Ферментативная реакция в общем виде

Содержание

1. Ферментативная реакция в общем виде
2. Изменение энергетики химической реакцииН2СО3=Н2О+СО2Энергия активации (Еа)– дополнительное
3. Энергетическая диаграмма химической р-цииИзменение свободной энергии системы
4. Ферменты снижают высоту энергетического барьераИзменение свободной энергии
5. Активный центр Активный центр ферментов расположен в
6. Этапы ферментативного катализаЕ + S ↔ ES
7. Этапы ферментативного катализаЕ + S (I этап)
8. Этапы ферментативного катализаIII этап (ЕР) – деформация
9. Молекулярные механизмы ферментативного катализаКислотно-основной катализ. Аминокислотные остатки
10. Ковалентный катализМежду субстратом и ферментом (коферментом или
11. Механизм ковалентного катализа в активном центре химотрипсина (гидролиз пептидных связей при переваривании белков в двенадцатиперстной кишке)
12. Мультисубстратные р-ции. 1. Механизм «пинг-понг»
13. События в активном центре аминотрансферазы как пример механизма «пинг-понг»ПФ – кофермент пиридоксальфосфат
14. 2. Последовательный механизм1. Механизм упорядоченного взаимодействия субстрата с активным центром фермента.
15. 2. Последовательный механизмМеханизм случайного взаимодействия субстрата с активным центром фермента
16. Скачать презентанцию

Изменение энергетики химической реакцииН2СО3=Н2О+СО2Энергия активации (Еа)– дополнительное кол-во кинетической энергии, необходимое молекулам в-ва, чтобы они вступили в реакцию.Молекула, обладающая Еа находится в переходном состоянии.Изменение свободной энергии (∆G)-разница энергий между исходным реагентом

Главная
Разное
Ферментативная реакция в общем виде

Слайды и текст этой презентации

Слайд 1Ферментативная реакция в общем виде.
Е + S ↔ ES ↔

EP ↔ E + P
E – фермент, S – субстрат,

P – продукт р-ции
(рис.Alberts)

Ферментативная реакция в общем виде.Е + S ↔ ES ↔ EP ↔ E + PE – фермент,

Слайд 2Изменение энергетики химической реакции
Н2СО3=Н2О+СО2
Энергия активации (Еа)– дополнительное кол-во кинетической энергии,

необходимое молекулам в-ва, чтобы они вступили в реакцию.
Молекула, обладающая Еа

находится в переходном состоянии.
Изменение свободной энергии (∆G)-разница энергий между исходным реагентом (Н2СО3) и конечными соединениями (Н2О и СО2)
(фото. из Северин)

Изменение энергетики химической реакцииН2СО3=Н2О+СО2Энергия активации (Еа)– дополнительное кол-во кинетической энергии, необходимое молекулам в-ва, чтобы они вступили в

Слайд 3Энергетическая диаграмма химической р-ции
Изменение свободной энергии системы во время р-ции

S → P
Энергия активации – энергия необходимая для перевода реагирующих

молекул в активное состояние.
Gupta et al. 2014

Энергетическая диаграмма химической р-цииИзменение свободной энергии системы во время р-ции S → PЭнергия активации – энергия необходимая

Слайд 4Ферменты снижают высоту энергетического барьера
Изменение свободной энергии в ходе химической

реакции, некатализируемой и катализируемой ферментами.(фото из Северин)

Ферменты снижают высоту энергетического барьераИзменение свободной энергии в ходе химической реакции, некатализируемой и катализируемой ферментами.(фото из Северин)

Слайд 5Активный центр
Активный центр ферментов расположен в шарнирных, более лабильных

сайтах между двумя доменами.
А.ц. – это молекулярная «машина», обладает свойством

сближать и ориентировать функциональные группы S и дестабилизировать химические связи S (эффект деформации субстрата).(рис. Alberts )

Активный центр Активный центр ферментов расположен в шарнирных, более лабильных сайтах между двумя доменами.А.ц. – это молекулярная

Слайд 6Этапы ферментативного катализа
Е + S ↔ ES ↔ EP ↔

E + P
E – фермент, S – субстрат, P –

продукт реакции.(фото из Северин)

Этапы ферментативного катализаЕ + S ↔ ES ↔ EP ↔ E + PE – фермент, S –

Слайд 7Этапы ферментативного катализа
Е + S (I этап) ↔ ES (II

этап)
I этап – сближение и ориентация субстрата относительно активного центра

фермента
II этап – образование фермент-субстратного комплекса (ЕS) в результате индуцированного соответствия.

Этапы ферментативного катализаЕ + S (I этап) ↔ ES (II этап)I этап – сближение и ориентация субстрата

Слайд 8Этапы ферментативного катализа
III этап (ЕР) – деформация субстрата и образование

нестабильного комплекса фермент-продукт(ЕР) (эффект деформации субстрата – дестабилизация химических связей

под действием активного центра)

IV этап (Е+Р)– распад комплекса(ЕР) с высвобождением продуктов реакции (Р) из активного центра фермента и освобождение ферментов (Е)

Этапы ферментативного катализаIII этап (ЕР) – деформация субстрата и образование нестабильного комплекса фермент-продукт(ЕР) (эффект деформации субстрата –

Слайд 9Молекулярные механизмы ферментативного катализа
Кислотно-основной катализ. Аминокислотные остатки активного центра имеют

функциональные группы со свойствами и кислот и оснований. (фото из

Северин)
С2Н5ОН+NAD(+) → CH3 - HC =O + NADH + H(+)

Молекулярные механизмы ферментативного катализаКислотно-основной катализ. Аминокислотные остатки активного центра имеют функциональные группы со свойствами и кислот и

Слайд 10Ковалентный катализ
Между субстратом и ферментом (коферментом или функциональной группой а.к.

остатка активного центра фермента (ацф) образуется ковалентная связь.

К.к. основан на

атаках нуклеофильных (отрицательно заряженных) или электрофильных (положительно зар-х) групп ацф молекулами субстрата.

Ковалентный катализМежду субстратом и ферментом (коферментом или функциональной группой а.к. остатка активного центра фермента (ацф) образуется ковалентная

Слайд 11Механизм ковалентного катализа в активном центре химотрипсина (гидролиз пептидных связей

при переваривании белков в двенадцатиперстной кишке)

Механизм ковалентного катализа в активном центре химотрипсина (гидролиз пептидных связей при переваривании белков в двенадцатиперстной кишке)

Слайд 12Мультисубстратные р-ции. 1. Механизм «пинг-понг»

Слайд 13События в активном центре аминотрансферазы как пример механизма «пинг-понг»
ПФ –

кофермент пиридоксальфосфат

Слайд 142. Последовательный механизм
1. Механизм упорядоченного взаимодействия субстрата с активным центром