Курс Молекулярная биология клетки Основные концепции современной молекулярной

стабильность генома. Структура ДНК, процессы репликации ДНК, репарации и пространственной

организации генома.

2) Реализация наследственной информации. Процессы, лежащие в основе "работы" (экспрессии) генов — транскрипция, трансляция. Жизненный цикл мРНК и посттрансляционная судьба белковых молекул.

3) Клетка и окружающая среда. Взаимодействие клетки с окружающими её клетками через прямые межклеточные контакты и химические сигналы. Обмен веществ (метаболизм) и клеточный цикл.

базе ЦКП
Экзамен

"О геномах" СФУ.

Alberts B., Johnson A., Lewis J., Raff M.,

Roberts K., Walter P. Molecular Biology of the Cell; издание 5-ое или 6-ое. («Молекулярная биология клетки», в 2-х томах, переведено на русский язык издательством НИЦ "Регулярная и хаотическая динамика" ). 

https://www.coursera.org/
https://stepic.org/
http://postnauka.ru/
http://vk.com/molbio
http://icg.nsc.ru/lectures/

такое клетка и чем отличаются прокариоты от эукариотов.
Из чего состоят

живые клетки, что такое ДНК, РНК и белки.
Как передается информация между разными биологическими молекулами.
«Центральная догма молекулярной биологии".

от 120 до 200 т.п.н. В часто в этих молекулах

обнаруживаются повторы противоположной ориентации длиной 20–30 т.п.н., разделенные уникальными последовательностями.
В молекулах хлДНК насчитывается около 140 генов, в число которых входят:
гены, обеспечивающие синтез белка в органеллах (аппарат транскрипции и трансляции),
гены белков, участвующих в процессе фотосинтеза.

кишечнополостных животных, эти молекулы линейные.
Для животных, обычно, размеры мтДНК

около 16 т.п.н.
В мтДНК млекопитающих и других животных 37 генов.
Такой же набор генов присутствует в мтДНК
высших растений, к нему добавляется еще ген 5SРНК.
По размеру молекул мтДНК растений от 200 т.п.н. у видов рода Brassica до 2500 т.п.н. у арбуза. Увеличение размера молекул мтДНК происходит за счет некодирующих последовательностей, кроме них в мтДНК растений включены фрагменты хлоропластной ДНК.

есть митохондрии
Прокариоты имеют оформленное ядро, а эукариоты - нет

У прокариот нет цитоплазматической мембраны
У эукариот гораздо сложнее устройство внутриклеточной среды (цитоплазмы), с большим количеством отделов (компартментов)

архей и эукариот
Карл Вёзе (1928-2012) — американский физик. Использовал 16S рРНК как

универсальную молекулу для классификации организмов.
Первым выделил Археи.

полисахаридов и нуклеиновых кислот
Химической особенностью полисахаридов является наличие аминогруппы

в структуре молекул

В состав плазматической мембраны входят фосфолипиды и холестерол

Биологические макромолекулы представляют собой гомополимеры, составленные из одинаковых звеньев

датский ботаник Вильгельм Иогансен (1857-1927)

организмов (начало «эры ДНК». Работы О. Эвери, К. Маклеод, М.

Маккарти )
1953: расшифровка генетического кода (Watson & Crick, Nature 171, 737: 1953).
1977: первый полный сиквенс целого генома бактериофага phiX174; всего только 5386 нуклеотидов, в 60 000 раз меньше генома человека (Sanger et al. Nature 265, 687: 1970).
mid-1980s: бурное развитие автоматизации и компьютеризации секвенирования
1990: начало проекта полного секвенирования генома человека
1997: полный сиквенс генома дрожжей (~12 Mbp)
1998: нематоды (~97 Mbp)
2000: арабидопсиса (~125 (Mbp)
2000: дрозофилы (~180 Mbp)
2001: человека (~3,200 Mbp)
2002: мыши (~3,500 Mbp) и риса (~420 Mbp)
2006: тополя (~550 Mbp)
2008: Новое поколение секвенирующих платформ - Next generation sequencing
2013: неандертальца (~3,200 Mbp)
2013: ели и 2014: сосны (~20,000 Mbp)
2015: кедр и лиственница?

С» или «загадка значения С»

из разных мономеров полимера — ДНК, РНК и белок.
Передача информации

между ними может осуществляться девятью (3 × 3 = 9) способами.
Центральная догма разделяет эти девять типов передачи информации на три группы:

по-видимому я не понимал, что подразумевается под словом „догма“, которая

означает часть веры, не подлежащая сомнению.

внутриклеточного пространства (компартпентализации).
2) В основе функционирования живой клетки лежат важнейшие

органические полимеры (поликонденсаты): нуклеиновые кислоты, служащие преимущественно для хранения (ДНК) и передачи (РНК) генетической информации; полисахарады, выполняющие структурную и энергозапасающую функцию; а также белки, реализующие и обеспечивающие основной спектр функциональной активности живой клетки.
3) ДНК представлена нитевидной двуцепочечной спиральной молекулой, РНК – одиночная спираль. ДНК и РНК являются полимерами нуклеотидов, в состав которых входит дезоксирибоза или рибоза, соответственно.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Они представляют собой полимеры аминокислотных остатков. Наличие водородных связей, гидрофобных

и электростатических взаимодействий позволяет укладывать полипептидные цепочки в более сложные вторичные и третичные структуры.
5) Центральным понятием в молекулярной биологии является ген – участок молекулы ДНК, кодирующий одну структуру одной или нескольких биологических макромолекул (РНК или белков). Совокупность генов организма называют геномом.
6) Центральная догма молекулярной биологии – это понятие, описывающее путь передачи информации в живой клетке. Согласно этой догме информация в клетке передается от ДНК через РНК (транскрипция) к белку (трансляция), но не в обратном направлении.

агентов принадлежит Стэнли Прузинеру, который также ввёл сам термин "прион", что

является сокращением от  «protein for infection».

и infection — «инфекция») — особый класс инфекционных агентов, представленных

белками с аномальной третичной структурой и не содержащих нуклеиновых кислот, которые вызывают тяжёлые заболевания центральной нервной системы у человека и ряда высших животных, вызванные массовым отмиранием клеток головного мозга. Прионы не являются живыми организмами, но они могут размножаться, используя функции живых клеток (в этом отношении прионы схожи с вирусами). Возникают вследствие нарушения синтеза белков из-за мутаций соответствующих генов.

Матричные процессы второго рода - процессы передачи конформации между молекулами белков.

от молекулы к молекуле по всему организму и даже другим организмам.

К таким заболеваниям относят скрэпи у овец (почесуха), болезнь Крейцфельда-Якоба, и другие трансмиссивные губчатые энцефалопатии.

нервных импульсов.
PrP способен принимать также и альтернативную, неправильную конформацию (PrPSс),

способную образовывать устойчивые к расщеплению бета-структуры.
PrPSс присоединяются к нормально свёрнутым молекулам PrPC, приводя к изменению укладки нормальной молекулы на "патологическую" (PrPSс).
Считается, что прионы могут синтезироваться каждой клеткой организма, но в норме ген, ответственный за воспроизводство прионов репрессирован.

Фатальная семейная бессонница.
Куру - болезнь каннибалов.

они объединяются в цепочку ДНК;
как происходит копирование молекулы ДНК (репликация) и

как был доказан основной принцип этого процесса;
какие стадии репликации ДНК выделяют, и что происходит в ходе этих стадий.

содержащий 200 пар нуклеотидов? Округлите ответ до целого.

экстракция нуклеиновых кислот и осаждение белков
Осаждение ДНК этанолом (преципитация)


Лекция "О

геномах" СФУ Дейч К.О.

мл воды и 1 ст. ложку соли. Размешать пока соль не

растворится. Потом отлить 3 ст. ложки в др. стакан.  2. Прополоскать рот 1 мин. Сплюнуть обратно в стакан. Жидкость содержит клетки с внутренней стороны щек.  3. Аккуратно размешать жидкость с каплей мыла (старайтесь без пузырьков). Мыло разрушает мембраны клеток.  4. В отдельном стакане смешайте 100 мл изопропилового спирта и 3 капли красителя. 5. Наклонить соляной раствор и аккуратно влейте спирт, что бы образовался отдельный слой.  6. Подождите 2,5 мин. Вы увидите белый сгустки и нитевидные формирования. Это ваша ДНК 
http://www.progene.ru/news/vydelenie_dnk_v_domashnikh_uslovijakh/2012-03-10-39
Необходимое: вода 0,5 л., соль поваренная 1 ст.л., стаканы и пробирки, моющее средство для посуды, спирт 100 мл, краситель пищевой, палочки.

Лекция "О геномах" СФУ Дейч К.О.

измельчить в блендере добавив 1 столовую ложку соли.
Кашицу процедить и

добавить средство для мытья посуды. Перемешать и дать постоять 10 минут.
Ещё раз процедить и разлить по пробиркам.
Добавить пару капель раствора для хранения контактных линз.
Аккуратно, по краю пробирки влить спирт слоем в 2 см и оставить на 10-15 мин.
Всплывшие хлотья и есть очищенная ДНК.

http://www.youtube.com/watch?v=ooZD3U62o50

Необходимое: вода 0,5л, соль поваренная 1 ст.л., овощ, моющее средство для посуды, жидкость для хранения контактных линз, спирт 100 мл., пробирки и стаканы, ситечко, блендер.

Лекция "О геномах" СФУ Дейч К.О.