Слайд 1Генетика микроорганизмов
Микробиология
Слайд 2Генетическая информация
Хранение – ДНК, хромосомы, плазмиды, репликация и репарация
Реализация –
транскрипция и трансляция
Передача – трансформация, конъюгация, трансдукция
Слайд 3Хранение генетической информации
ДНК – полимер, состоящий из дезоксинуклеотидов
Слайд 4Хранение генетической информации
Нуклеоид – область цитоплазмы с расположенной в ней
ДНК, а также набором белков для ее функционирования (аппарат репликации
и транскрипции) и хранения (ДНК-связывающие белки)
Чаще всего у прокариот одна(?) кольцевая(?) хромосома и, соответственно, одна группа сцепления
Слайд 6Mycoplasma genitalium – возбудитель урогенитального миксоплазмоза. Внутриклеточный паразит, лишенный клеточной
стенки, а значит практически неокрашиваемый обычными способами.
В силу своей
паразитарности имеет очень маленький геном – около 580 т.п.н. – меньше, чем у некоторых вирусов
Слайд 8Bradyrhizobium japonicum – вид клубеньковых азотфиксаторов, симбионт сои. Имеет один
из самых крупных геномов среди бактерий – около 9-10 млн
в зависимости от штамма
Слайд 10Хранение генетической информации
Плазмида - относительно короткие (?) кольцевые (?) молекулы
ДНК, реплицирующиеся и функцио-нирующие независимо от хромосомы (?)
Размер – 2-600
т.п.н.
Количество – 1-множество
Плазмида может передаваться от клетки к клетке в процессе конъюгации, либо поглощаться непосредственно из внешней среды в процессе трансформации
Слайд 11Функции плазмид
Если плазмида дает бактерии способность быть донором при конъюгации,
то это F-плазмида (fertility)
Если плазмида содержит гены устойчивости к антибиотикам,
то это R-плазмида (resistance)
Плазмиды также могут нести гены вирулентности, гены токсинов, гены антибиотиков, гены метаболизма
Слайд 12 ori
Сайты рестрикции
Ген устойчивости к антибиотику
Промотор и
целевой ген
Маркерный ген
Обязательные элементы плазмид
В молекулярно-генетических исследования плазмиды используют
в качестве вектора для доставки генов в клетки бактерий или растений
Слайд 15Рестриктазы
Ферменты, разлагающие полинуклеотиды
Экзонуклеазы рестрикции и эндонуклеазы рестрикции
В молекулярно-генетических исследованиях используются
для разрезания ДНК в определенных для каждой рестриктазы местах –
сайтах рестрикции
Слайд 17ДНК-лигазы
Совместно с рестриктазами всегда идут ферменты лигазы, ответственные за соединение
двух молекул ДНК, то есть действуют обратно рестриктазам
Слайд 19Транспозоны
Важный фактор изменчивости бактериального генома
Транспозоны – МГЭ, способный перемещаться из
одного сайта в другой как в пределах одной хромосомы, так
и внехромосомно вплоть до перемещения в другую клетку
Перемещение транспозонов может приводить к различным мутациям – делециям, дупликациям, инверсиям и т.д.
Слайд 20Виды транспозонов
Инсерционные последовательности (IS) – содержат исключительно гены, предназначенные для
работы самого транспозона – транспозазы и регуляторных элементов
Сложные транспозоны содержат
помимо этих генов еще и гены устойчивости к антибиотикам, например
Слайд 21Особенности организации генетического материала прокариот
Отсутствие ядра
Отсутствие процессинга
Транскрипция и трансляция сопряжены
во времени и пространстве
Полицистронные мРНК
Отсутствие интронов
Отсутствие накопления
мутаций
Слайд 22Эволюционный Эксперимент
Эксперимент по изучению базовых процессов эволюции, начатый в 1988
году и продолжающийся до сих пор
Организатор – Ричард Ленски
Слайд 23Методика эксперимента
12 популяций одного штамма Escherichia coli выращивали на минимальной
среде с глюкозой
Каждый день 100 мкл популяции высевалось на свежую
питательную среду
Каждое 500 поколение (75 дней) замораживалось для дальнейших исследований
К настоящему моменту анализируется более, чем 60000 поколений
Слайд 24Результаты эксперимента
За первые 20000 поколений зафиксировались 45 мутаций
На удивление большинство
мутаций были полезными, а не нейтральными как ожидалось
Слайд 25Результаты эксперимента
После 26000 поколений произошла мутация в гене, ответственном за
репарацию
Возросло количество мутаций
Возросло количество зафиксированных мутаций (609)
Такая же мутация
возникла и в других популяциях и также зафиксировалась
Из «новых» 609 мутаций большинство на сей раз оказались нейтральными
Слайд 26Мутагенез – причина появления устойчивости к антибиотикам
Неконтролируемое использование антибиотиков
Инсерционные последовательности
Плазмиды
и горизонтальный перенос генов
Мутагенез
Слайд 28Реализация генетической информации
Транскрипция:
Одна РНК-полимераза
Для ее работы требуется сигма-субъединица, основная
функция которой – узнавание и связывание с промотором, отсоединяется на
этапе элонгации
Терминация транскрипции может проходить с участиям ро-фактора, а может с образованием шпильки РНК
Слайд 29Реализация генетической информации
Трансляция:
Отсутствие сплайсинга, КЭПирования и полиаденилирования
Сопряжение транскрипции
и трансляции – присоединение рибосом и синтез белка начинается еще
до окончания синтеза РНК
Немного иные рибосомы
Слайд 30Передача генетической информации
Бесполое размножение – бинарное деление / почкование
Половое размножение
– трансформация, конъюгация и трансдукция
Важно понимать разницу между половым размножением
эукариот и «половым размножением» прокариот.
У последних НЕ образуются гаметы, нет их слияния и образования зиготы. Единственное что есть – обмен ДНК в каком-либо процессе
Слайд 31Трансформация
Процесс поглощения ДНК из внешней среды клеткой
Осуществляется только «компетентными» клетками
Компетентность – свойство клеток
поздней лаг-фазы. Осуществляется компетентность выработкой факторов компетентности либо вызывается искусственно
Слайд 34Конъюгация
Процесс передачи ДНК от одной клетки к другой при непосредственном
контакте двух клеток
Процесс однонаправленный – от донора к реципиенту
Передача ДНК
осуществляется через половые пили – своеобразные временные «мостики» меж двумя клетками
Необходима F-плазмида
Слайд 36Трансдукция
Перенос ДНК посредством вирусов-бактериофагов
Процесс также однонаправленный
Может быть литической – после
которой клетка умирает, а может быть лизогенной, когда ДНК вируса
встраивается в хромосому бактерии
Слайд 38Передача генетической информации
Слайд 39CRISPR-Cas9
clustered regularly interspaced short palindromic repeats
Система адаптивного иммунитета бактерий и
архей