TheSlide.ru

Как и зачем мы изучаем транскрипцию стрессоустойчивых бактерий

Содержание

1. Как и зачем мы изучаем транскрипцию стрессоустойчивых бактерий
2. Транскрипционный цикл
3. Схема элонгационного комплекса бактериальной РНКП
4. ДетоксикацияКлеточная оболочкаГеномАнтиоксидантныесистемыMn2+Стрессоустойчивость D. radioduransРепарация ДНК
5. Стрессоустойчивость D. radiodurans
6. ДетоксикацияКлеточная оболочкаГеномАнтиоксидантныесистемыMn2+Стрессоустойчивость D. radioduransРепарация ДНКТранскрипция?
7. Стрессоустойчивость D. radiodurans
8. Стрессоустойчивость D. radiodurans
9. Схема элонгационного комплекса бактериальной РНК-полимеразы
10. Gfh-факторы (Gre factor homologs)Есть только у бактерий
11. Gfh-факторы усиливают транскрипционные паузыGfh1Esyunina et al., 2016hisP
12. Слайд 12
13. Исследуемые повреждения в ДНК
14. Искусственные элонгационные комплексы
15. Точность синтеза РНК на поврежденных матрицахGGЭффективность и точность включения нуклеотидов напротив повреждений снижаются
16. Gfh1 Dra усиливает паузу на поврежденном нуклеотиде матрицыMn2+
17. RNA||||||||||||||||||||||||||||||||MfdРоль фактора Mfd в транскрипцииТранслоказа Mfd у
18. Действие Mfd и Gfh1 Dra на остановленные транскрипционные комплексыРНК||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||Gfh1bioMfdMfdосадоксупернатант
19. Mfd действует на остановленные транскрипционные комплексы совместно с Gfh1 Dra
20. RNA||||||||||||||||||||||||||||||||||||| транскрипция,  диссоциация РНКППредполагаемая роль Gfh-факторовGfh
21. Текущие исследованияАнализ Gre-подобных факторов других бактерий: D.
22. Чем ещё занимаются в (мета)лабораторииИнициацией транскрипцииЭукариотическими ДНК-полимеразами
23. Слайд 23
24. Скачать презентанцию

Транскрипционный цикл

Главная
Разное
Как и зачем мы изучаем транскрипцию стрессоустойчивых бактерий

Слайды и текст этой презентации

Слайд 1Как и зачем мы изучаем транскрипцию стрессоустойчивых бактерий
Бактериальная транскрипция. Как

её исследуют
Природа радиоустойчивости Deinococcus radiodurans
Особенности транскрипции бактерий Deinococcus
Чем ещё занимаются

в нашей лабе

Алексей Агапов
al.a.agapov@gmail.com

29 марта 2019 г.

Как и зачем мы изучаем транскрипцию стрессоустойчивых бактерийБактериальная транскрипция. Как её исследуютПрирода радиоустойчивости Deinococcus radioduransОсобенности транскрипции бактерий

Слайд 2Транскрипционный цикл

Транскрипционный цикл

Слайд 3Схема элонгационного комплекса бактериальной РНКП

Схема элонгационного комплекса бактериальной РНКП

Слайд 4Детоксикация
Клеточная оболочка
Геном
Антиоксидантные
системы
Mn2+
Стрессоустойчивость D. radiodurans
Репарация ДНК

ДетоксикацияКлеточная оболочкаГеномАнтиоксидантныесистемыMn2+Стрессоустойчивость D. radioduransРепарация ДНК

Слайд 5Стрессоустойчивость D. radiodurans

Стрессоустойчивость D. radiodurans

Слайд 6Детоксикация
Клеточная оболочка
Геном
Антиоксидантные
системы
Mn2+
Стрессоустойчивость D. radiodurans
Репарация ДНК
Транскрипция?

ДетоксикацияКлеточная оболочкаГеномАнтиоксидантныесистемыMn2+Стрессоустойчивость D. radioduransРепарация ДНКТранскрипция?

Слайд 7Стрессоустойчивость D. radiodurans

Стрессоустойчивость D. radiodurans

Слайд 8Стрессоустойчивость D. radiodurans

Стрессоустойчивость D. radiodurans

Слайд 9Схема элонгационного комплекса бактериальной РНК-полимеразы

Схема элонгационного комплекса бактериальной РНК-полимеразы

Слайд 10Gfh-факторы (Gre factor homologs)
Есть только у бактерий филума Deinococcus-Thermus

В отличие

от Gre-факторов не активируют расщепление РНК

Gfh1 Tth ингибирует инициацию транскрипции

Концентрация

Gfh1 повышается в клетках Dra при стрессе

Gfh-факторы (Gre factor homologs)Есть только у бактерий филума Deinococcus-ThermusВ отличие от Gre-факторов не активируют расщепление РНКGfh1 Tth

Слайд 11Gfh-факторы усиливают транскрипционные паузы
Gfh1
Esyunina et al., 2016
hisP – шпилькозависимая
… и

терминацию транскрипции
Gfh-факторы Dra активируются в присутствии Mn2+

Gfh-факторы усиливают транскрипционные паузыGfh1Esyunina et al., 2016hisP – шпилькозависимая… и терминацию транскрипцииGfh-факторы Dra активируются в присутствии Mn2+

Слайд 12

Слайд 13Исследуемые повреждения в ДНК

Исследуемые повреждения в ДНК

Слайд 14Искусственные элонгационные комплексы

Искусственные элонгационные комплексы

Слайд 15Точность синтеза РНК на поврежденных матрицах
G
G
Эффективность и точность включения нуклеотидов

напротив повреждений снижаются

Точность синтеза РНК на поврежденных матрицахGGЭффективность и точность включения нуклеотидов напротив повреждений снижаются

Слайд 16Gfh1 Dra усиливает паузу на поврежденном нуклеотиде матрицы
Mn2+

Gfh1 Dra усиливает паузу на поврежденном нуклеотиде матрицыMn2+

Слайд 17RNA
||||||||
||||||||
||||||||
||||||||
Mfd
Роль фактора Mfd в транскрипции
Транслоказа Mfd у E. coli смещает

остановленные транскрипционные комплексы с поврежденных участков ДНК

RNA||||||||||||||||||||||||||||||||MfdРоль фактора Mfd в транскрипцииТранслоказа Mfd у E. coli смещает остановленные транскрипционные комплексы с поврежденных участков ДНК

Слайд 18Действие Mfd и Gfh1 Dra на остановленные транскрипционные комплексы
РНК
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
||||||||
||||||||
Gfh1
bio
Mfd
Mfd
осадок
супернатант

Действие Mfd и Gfh1 Dra на остановленные транскрипционные комплексыРНК||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||Gfh1bioMfdMfdосадоксупернатант

Слайд 19Mfd действует на остановленные транскрипционные комплексы совместно с Gfh1 Dra

Mfd действует на остановленные транскрипционные комплексы совместно с Gfh1 Dra

Слайд 20RNA
||||||||||
|||||||||||||||||||||||||||
 транскрипция,  диссоциация РНКП
Предполагаемая роль Gfh-факторов
Gfh ингибируют транскрипцию, стабилизируя

неактивную конформацию РНКП
Mfd
Gfh1
способствует процессам репарации и репликации?
||||||||||

RNA||||||||||||||||||||||||||||||||||||| транскрипция,  диссоциация РНКППредполагаемая роль Gfh-факторовGfh ингибируют транскрипцию, стабилизируя неактивную конформацию РНКПMfdGfh1способствует процессам репарации и репликации?||||||||||

Слайд 21Текущие исследования
Анализ Gre-подобных факторов других бактерий: D. gobiensis, D. peraridilitoris,

Brevundimonas sp. leaf

Дальнейшее изучение механизма сопряжения транскрипции с эксцизионной репарацией

нуклеотидов: сборка in vitro системы репарации NER D. radiodurans

Поиск белков, ассоциированных с РНКП D. radiodurans в стрессовых условиях, методом pull-down и масс-спектрометрического анализа

Изучение блокирования транскрипции белком dCas9 in vitro

Текущие исследованияАнализ Gre-подобных факторов других бактерий: D. gobiensis, D. peraridilitoris, Brevundimonas sp. leafДальнейшее изучение механизма сопряжения транскрипции

Слайд 22Чем ещё занимаются в (мета)лаборатории
Инициацией транскрипции

Эукариотическими ДНК-полимеразами (лаба А.В. Макаровой)

Прокариотическими

аргонавтами (мегагрант А.А. Аравина)

Плазмидами с природной устойчивостью ко всему на

свете (группа М.А. Петровой)

Чем ещё занимаются в (мета)лабораторииИнициацией транскрипцииЭукариотическими ДНК-полимеразами (лаба А.В. Макаровой)Прокариотическими аргонавтами (мегагрант А.А. Аравина)Плазмидами с природной устойчивостью

Слайд 23

Скачать презентацию

Обратная связь

Если не удалось найти и скачать доклад-презентацию, Вы можете заказать его на нашем сайте. Мы постараемся найти нужный Вам материал и отправим по электронной почте. Не стесняйтесь обращаться к нам, если у вас возникли вопросы или пожелания:

Email: Нажмите что бы посмотреть

Что такое TheSlide.ru?

Это сайт презентации, докладов, проектов в PowerPoint. Здесь удобно хранить и делиться своими презентациями с другими пользователями.

Для правообладателей