Разделы презентаций
- Разное
- Английский язык
- Астрономия
- Алгебра
- Биология
- География
- Геометрия
- Детские презентации
- Информатика
- История
- Литература
- Математика
- Медицина
- Менеджмент
- Музыка
- МХК
- Немецкий язык
- ОБЖ
- Обществознание
- Окружающий мир
- Педагогика
- Русский язык
- Технология
- Физика
- Философия
- Химия
- Шаблоны, картинки для презентаций
- Экология
- Экономика
- Юриспруденция
Лекции: ЭНЗИМОЛОГИЯ
Содержание
- 1. Лекции: ЭНЗИМОЛОГИЯ
- 2. ЛЕКЦИЯ № 1ФЕРМЕНТЫ:Строение, свойства, регуляция активности
- 3. Актуальность темыИзучение ферментов способствует познанию феномена жизниБиохимические
- 4. История энзимологииПищеварение — это идущие внутри тела
- 5. Артур Корнберг (1918 – 2007)Кэри Мюллис (р.
- 6. План лекцииПонятие о ферментах и особенности ферментативного
- 7. Цель Знать:строение, свойства и роль ферментов в
- 8. Понятие о ферментах Ферменты – белковые катализаторы
- 9. Особенности ферментативного катализа: сравнение с неорганическими катализаторамиСходстваРазличия(свойства
- 10. Высокая эффективность ферментативного катализа2Н2О2 → 2Н2О +
- 11. Структура фермента: активный центр Активный центр фермента
- 12. Схема строения активного центраСубстрат (S) – вещество,
- 13. Связывание субстрата в активном центре фермента
- 14. Механизм действия ферментов: этапы ферментативного катализа
- 15. Фермент-субстратный комплекс (ES)Образование ES – это ключевой
- 16. Пример индуцированного соответствия и конформационных перестроек ферментаКаталаза
- 17. Итак, высокая каталитическая эффективность ферментов обусловленаВысокой специфичностью
- 18. Специфичность ферментовКаталитическая (реакционная) специфичность – способность фермента
- 19. Специфичность ферментовСубстратная специфичность – способность фермента взаимодействовать
- 20. Сложные ферментыБелок (апофермент) + кофактор (кофермент) →
- 21. КофакторыПо химической природе:неорганические вещества (ионы металлов)органические вещества
- 22. Кофакторы – ионы металлов: способы участия в
- 23. Cu, Zn-супероксиддисмутаза (СОД)Zn необходим для стабилизации молекулыCu
- 24. Коферменты, обратимо связанные с апоферментомNAD+ , NADP+
- 25. Простетические группыфлавиновые нуклеотиды FAD, FMN – коферменты
- 26. Мультиферментные комплексыКомплексы ферментов, катализирующие последовательные этапы превращения
- 27. Кинетика ферментативного катализа: условия протекания ферментативных реакцийАктивность
- 28. Факторы, определяющие активность фермента (скорость реакции)Количество ферментаКоличество
- 29. Скорость реакции и температураВлияние температуры обусловлено броуновским
- 30. Скорость реакции и рНВлияние рН обусловлено изменением
- 31. Скорость реакции и концентрация субстратаКонстанта Михаэлиса (концентрация
- 32. Скорость реакции и концентрация субстратаЗависимость скорости реакции
- 33. Активаторы ферментовАктиваторы – вещества, повышающие каталитическую активность
- 34. Ингибиторы ферментовИнгибиторы – вещества, снижающие каталитическую активность
- 35. Конкурентные ингибиторыСтруктурные аналоги субстратов (структурное сходство той
- 36. Неконкурентное ингибированиеИнгибитор связывается не с активным центромОбразуется
- 37. Регуляция активности ферментов – основа регуляции метаболических
- 38. Изменение количества ферментаРегуляция на уровне транскрипции: индукция
- 39. Конститутивные ферменты – ферменты, которые синтезируются постоянно,
- 40. Механизмы регуляция каталитической активности ферментовВзаимодействие с белком-активаторомАссоциация и диссоциация протомеровФосфорилирование и дефосфорилированиеЧастичный протеолизАллостерическая регуляция
- 41. Взаимодействие с белком-активаторомФермент переваривания пищевого жира в
- 42. Ассоциация-диссоциация протомеров
- 43. Фосфорилирование -дефосфорилирование
- 44. Частичный протеолизИзменение первичной структуры белкаИзменение конформации молекулы, формирование активного центраНеобратимая регуляция
- 45. Аллостерическая регуляция
- 46. Аллостерические ферментыОлигомерные белки (2 и более субъединиц)Имеют
- 47. Задание для самостоятельной работы1. Используя материал слайдов
- 48. ЗаключениеОснова физиологических процессов – биохимические реакцииСкорость биохимических
- 49. ЛитератураБиохимия: учебник для вузов / ред. Е.
- 50. Скачать презентанцию
ЛЕКЦИЯ № 1ФЕРМЕНТЫ:Строение, свойства, регуляция активности
Слайды и текст этой презентации
Слайд 1
Дисциплина: биохимия (Б1.Б.15)
Специальность: педиатрия (31.05.02)
НГМУ, кафедра медицинской химии
Д.б.н., доцент Суменкова
Дина Валерьевна
Слайд 3Актуальность темы
Изучение ферментов способствует познанию феномена жизни
Биохимические реакции – основа
физиологических процессов
Ферменты – «возбудители всех химических превращений у живых существ»
(И.П. Павлов)Изучение ферментов необходимо для понимания связи между ферментами и наследственными болезнями обмена веществ
Изучение ферментов позволяет расширять область их использования в медицине
Успехи биохимии, молекулярной биологии и медицины связаны с развитием энзимологии
Слайд 4История энзимологии
Пищеварение — это идущие внутри тела химические реакции, важнейшую
роль в которых играет химический реагент – «фермент» (от лат.
fermentum «брожение»)Ян Баптист Ван Гельмонт (17 в):
Лат. fermentum, греч. enzym
Слайд 5Артур Корнберг (1918 – 2007)
Кэри Мюллис (р. 1944)
Открытие ДНК-полимеразы (1956)
Открытие
механизма биосинтеза НК (Нобелевская премия 1959 совместно с Северо Очоа)
Создание
высокоэффективного метода ПЦР-диагностики (1983)Нобелевская премия совместно с Майклом Смитом (1993)
Слайд 6План лекции
Понятие о ферментах и особенности ферментативного катализа (свойства ферментов)
Структура и механизм действия ферментов
Сложные ферменты и их кофакторы Мультиферментные
комплексыКинетика ферментативных реакций
Регуляция активности ферментов
Слайд 7Цель
Знать:
строение, свойства и роль ферментов в организме человека
химико-биологическую сущность
ферментативного катализа, условия протекания ферментативных реакций
механизмы регуляции активности ферментов для
понимания биохимических основ функционирования организмаЗнания о ферментативном катализе необходимы для понимания принципов методов определения активности ферментов в клинической лабораторной диагностике с целью выявления патологических процессов в органах и системах детей и подростков
Слайд 8Понятие о ферментах
Ферменты – белковые катализаторы химических реакций в
живом организме
состоят из L-α-аминокислот, соединенных пептидными связями
имеют 4 уровня организации
молекулхарактерна конформационная лабильность
при денатурации теряют активность
синтезируются как белковые молекулы
И.П. Павлов: переваривающая способность желудочного сока зависит от количества белка в нем (отсюда следует, что пепсин – белок)
Слайд 9Особенности ферментативного катализа: сравнение с неорганическими катализаторами
Сходства
Различия
(свойства ферментов)
Снижают энергию активации
реакции
Катализируют реакции возможные по термодинамическим условиям
Не изменяют термодинамических характеристик реакции
(не смещают равновесие)Многие ферменты катализируют прямую и обратную реакции
Не расходуются в процессе реакции
Уникальность структуры
Высокая эффективность катализа
Высокая специфичность действия
Конформационная лабильность
Регулируемая активность
Проявляют активность в оптимальных для организма условиях
Слайд 10Высокая эффективность ферментативного катализа
2Н2О2 → 2Н2О + О2
самопроизвольно (Еа =
70 кДж/моль)
при участии железа (Еа = 42 кДж/моль), скорость реакции
увеличивается в 103 разв присутствии каталазы (Еа = 7 кДж/моль), скорость реакции увеличивается в 1010 раз
Что лежит в основе высокой эффективности ферментативного катализа?
Слайд 11Структура фермента: активный центр
Активный центр фермента (АЦ) – это
участок молекулы фермента, способный комплементарно (специфически) связываться с субстратом и
обеспечивать его каталитическое превращениеФормируется на уровне III структуры белка
У простых ферментов состоит только из аминокислотных остатков
У сложных ферментов имеет кофактор (кофермент)
Участок связывания активного центра обеспечивает сродство к субстрату и формирование фермент-субстратного комплекса (ES), например, за счет ионных взаимодействий
Каталитический участок активного центра осуществляет химическую реакцию
Слайд 12Схема строения активного центра
Субстрат (S) – вещество, вступающее в ферментативную
реакцию
Субстрат комплементарен АЦ фермента («ключ-замок»)
Продукт (Р) – вещество, которое образуется
в процессе реакцииПродукт не имеет сродства к активному центру фермента
Слайд 15Фермент-субстратный комплекс (ES)
Образование ES – это ключевой момент ферментативной реакции,
основа высокой эффективности катализа
ES образуется в результате индуцированного соответствия фермента
и субстрата(теория Д. Кошленда, 1958) :
субстрат индуцирует конформационные изменения фермента и его активный центр принимает необходимую для связывания с субстратом пространственную ориентацию
(фермент активен только в присутствии субстрата)
субстрат также претерпевает конформационные перестройки, за счет которых и происходят его быстрые химические превращения
Слайд 16Пример индуцированного соответствия и конформационных перестроек фермента
Каталаза – гемопротеин
(сложный фермент:
белковая часть + гем)
неактивная каталаза: железо в составе гема находится
под плоскостью порфиринового кольцаактивная каталаза: при взаимодействии с Н2О2 железо перемещается в плоскость кольца, «настраивая» активный центр фермента
Слайд 17Итак, высокая каталитическая эффективность ферментов обусловлена
Высокой специфичностью связывания АЦ фермента
и субстрата и образованием ES-комплекса
Конформационной лабильностью ферментов, которая является основой
их высокой специфичности
Слайд 18Специфичность ферментов
Каталитическая (реакционная) специфичность – способность фермента катализировать одну химическую
реакцию или один тип реакций
Пример: реакции гидролиза, окисления-восстановления
Исключение: лиазы, в
одном направлении, катализируют негидролитическое расщепление субстрата, а в другом – присоединение простой молекулы по кратной связи
Слайд 19Специфичность ферментов
Субстратная специфичность – способность фермента взаимодействовать с одним (абсолютная)
или несколькими субстратами со сходным строением и типом связей (относительная,
групповая)абсолютная субстратная специфичность
уреаза: гидролиз мочевины
аргиназа: гидролиз аргинина
относительная субстратная специфичность
пищеварительные ферменты
стереоспецифичность
лактатдегидрогеназа: окисление только L-лактата
Слайд 20Сложные ферменты
Белок (апофермент) + кофактор (кофермент) → активный фермент (холофермент)
апофермент
– не активен
большинство природных ферментов – сложные белки-протеиды
кофактор – небелковая
часть сложного фермента (лат. «вместе делающий»)
Слайд 21Кофакторы
По химической природе:
неорганические вещества (ионы металлов)
органические вещества (производные витаминов) -
коферменты
По виду химической связи:
слабые взаимодействия (присутствуют в активом центре фермента
только в момент реакции, являясь косубстратом)ковалентная связь (простетическая группа)
Роль кофактора:
изменение конформации фермента, субстрата
непосредственное участие в реакции
Слайд 22Кофакторы – ионы металлов: способы участия в ферментативном катализе
Изменяют конформацию
субстрата (Mg2+-АТФ)
Стабилизируют конформацию апофермента (Zn2+ стабилизирует IV структуру алкогольдегидрогеназы)
Участвует в
катализе (ионы железа, меди участвуют в переносе электронов)
Слайд 23Cu, Zn-супероксиддисмутаза (СОД)
Zn необходим для стабилизации молекулы
Cu – активный участник
в реакции дисмутации супероксид-аниона:
О2 - + О2 - + 2Н+ = Н2О2 + О21) О2 - + Cu2+ + Н+ = Cu1+ + О2
2) О2 - + Cu1+ + Н+ = Cu2+ + Н2О2
Слайд 24Коферменты, обратимо связанные с апоферментом
NAD+ , NADP+ – кофермент оксидоредуктаз,
(анаэробных дегидрогеназ) источник синтеза – никотиновая кислота (vit РР, или
В3)HS-CoA (кофермент А) - кофермент ацетилтрансфераз, некоторых лигаз, источник синтеза – пантотеновая кислота (vit B5)
тетрагидрофолат (Н4 –фолат) - кофермент трансфераз - переносчиков С1-фрагментов, источник синтеза – фолиевая кислота (vit B9)
Слайд 25Простетические группы
флавиновые нуклеотиды FAD, FMN – коферменты оксидоредуктаз (аэробных и
некоторых анаэробных дегидрогеназ, источник синтеза - рибофлавин (vit В2)
пиридоксальфосфат -
кофермент аминотрансфераз и некоторых других ферментов, источник синтеза - пиридоксин (vit В6)тиаминпирофосфат - кофермент в реакциях окислительного декарбоксилирования кетокислот и кетосахаров, источник синтеза – тиамин (vit В1)
биоцитин - кофермент лигаз, образующих связи С – С и карбоксильные группы, источник синтеза - биотин (vit Н, или В7)
Слайд 26Мультиферментные комплексы
Комплексы ферментов, катализирующие последовательные этапы превращения какого-либо субстрата
Отличительные особенности
комплексов:
прочность ассоциации ферментов
молекулярные массы от 2,3•106 до 10•106
определенный порядок расположения
ферментов в соответствии с последовательностью прохождения этапов превращения исходного субстратаБиологическая значимость комплексов: повышение эффективности процесса превращения
сокращение расстояния, на которые молекулы промежуточных продуктов должны перемещаться при действии изолированных ферментов
Примеры комплексов:
митохондриальная пируватдегидрогеназа и α-кетоглутаратдегидрогеназа
цитоплазматическая синтаза высших жирных кислот
ферментные комплексы дыхательной цепи митохондрий
Слайд 27Кинетика ферментативного катализа:
условия протекания ферментативных реакций
Активность фермента, или скорость ферментативной
реакции определяется уменьшением количества молекул субстрата или увеличением количества молекул
продукта за единицу времениактивность фермента (1МЕ) = мкмоль (S или P) / мин
1 кат = 6 х 107 МЕ
уд. активность фермента = мкмоль (S или P) / (мин • мг белка)
Слайд 28Факторы, определяющие активность фермента (скорость реакции)
Количество фермента
Количество субстрата
Количество продукта (для
аллостерических ферментов)
Концентрация кофактора (для сложных ферментов)
Присутствие активаторов или ингибиторов
Температура
рН среды
Слайд 29Скорость реакции и температура
Влияние температуры обусловлено броуновским движением молекул (от
нуля до 40 ° С) и денатурацией белка (выше 40°
С)
Слайд 30Скорость реакции и рН
Влияние рН обусловлено изменением ионизации
функциональных групп активного
центра фермента и субстрата,
а также денатурацией фермента при значительных изменениях
рН
Слайд 31Скорость реакции и концентрация субстрата
Константа Михаэлиса (концентрация субстрата, при которой
скорость реакции равна 1/2 от максимальной). Характеризует сродство фермента к
субстрату (чем меньше значение, тем выше сродство). Является величиной постоянной.
Слайд 32Скорость реакции и концентрация субстрата
Зависимость скорости реакции от концентрации субстрата
описывает уравнение Михаэлиса и Ментен:
V = V max · [
S] / [ S] + KmОтсюда,
[ S] = Km · V / V max - V
Слайд 33Активаторы ферментов
Активаторы – вещества, повышающие каталитическую активность ферментов
Часто активаторами являются
микро-, макроэлементы
Активаторы не являются кофакторами
Известно, что в присутствии хлорид-ионов активность
амилазы слюны значительно возрастает, а в отсутствии катионов кальция не проявляется. Какую роль в проявлении активности фермента играют кальций и хлор?
Слайд 34Ингибиторы ферментов
Ингибиторы – вещества, снижающие каталитическую активность фермента
По типу химической
связи:
обратимые (слабые связи)
необратимые (ковалентная связь)
По механизму действия:
конкурентные
неконкурентные
Слайд 35Конкурентные ингибиторы
Структурные аналоги субстратов (структурное сходство той части молекулы, которая
взаимодействует с активным центром фермента в участке связывания)
Связываются в активном
центре ферментаФормируется комплекс EI
Не изменяют структуры фермента
Продукт реакции не образуется (часть молекулы ингибитора, которая попадает в каталитический участок, не имеет структурного сходства с соответствующей частью молекулы субстрата)
Ингибитор вытесняется из активного центра фермента при увеличении концентрации субстрата
Снижают скорость реакции, но не изменяют Vmax. Почему?
«Изменяют» (повышают) Кm. В чем состоит условность «изменения» Кm?
Слайд 36Неконкурентное ингибирование
Ингибитор связывается не с активным центром
Образуется комплекс ESI
Ингибитор изменяет
конформацию фермента и активного центра
Снижают Vmax
Не изменяют Km
Слайд 37Регуляция активности ферментов – основа регуляции метаболических путей
Способы регуляции активности
ферментов:
Изменение количества фермента (индукция или репрессия синтеза)
Изменение каталитической активности фермента
вследствие изменения его конформацииФерменты, активность которых регулируется при участии гормонов или каких-либо метаболитов, называются регуляторными, или ключевыми. С помощью ключевых ферментов регулируется скорость метаболических процессов.
Слайд 38Изменение количества фермента
Регуляция на уровне транскрипции: индукция синтеза
Инсулин индуцирует синтез
ключевых ферментов гликолиза (окисления глюкозы).
Активация гликолиза в клетках приводит к
снижению уровня глюкозы в крови.
Слайд 39Конститутивные ферменты – ферменты, которые синтезируются постоянно, независимо от наличия
субстрата
Индуцибельные (адаптивные) ферменты – ферменты, которые синтезируются только при наличии
субстратаПРИМЕР: алкогольдегидрогеназа
Слайд 40Механизмы регуляция каталитической активности ферментов
Взаимодействие с белком-активатором
Ассоциация и диссоциация протомеров
Фосфорилирование
и дефосфорилирование
Частичный протеолиз
Аллостерическая регуляция
Слайд 41Взаимодействие с белком-активатором
Фермент переваривания пищевого жира в тонком кишечнике –
панкреатическая липаза – активируется путем присоединения белка-фермента колипазы
Мембранный фермент аденилатциклаза,
участвующий в передаче сигнала гормонов в клетку, активируется путем взаимодействия с альфа-субъединицей G-белка
Слайд 44Частичный протеолиз
Изменение первичной структуры белка
Изменение конформации молекулы, формирование активного центра
Необратимая
регуляция
Слайд 46Аллостерические ферменты
Олигомерные белки (2 и более субъединиц)
Имеют аллостерический центр (один
или несколько)
Активный и аллостерический центры находятся в разных протомерах
Регуляторы активности
- эффекторы (активаторы, ингибиторы)Изменение конформации регуляторного протомера приводит к изменению конформации молекулы в целом, а значит и активного центра
Катализируют ключевые реакции
Аллостерическая регуляция обратима
ПРИМЕРЫ эффекторов:
продукты реакции (ингибиторы)
ATP – ингибитор, ADP – активатор ключевых ферментов энергетического обмена
Слайд 47Задание для самостоятельной работы
1. Используя материал слайдов 24, 25 закончите
таблицу:
2. Используя интернет-ресурсы, найдите информацию о лекарственных препаратах, механизм
действия которых связан с ингибированием активности ферментов. Приведите примеры лекарственных препаратов, назовите ферменты, которые они ингибируют, и укажите область применения данных препаратов.
Слайд 48Заключение
Основа физиологических процессов – биохимические реакции
Скорость биохимических реакций в организме
катализируют белки-ферменты, многие из которых нуждаются в кофакторах – микроэлементах
и производных витаминовФерментам свойственна высокая каталитическая эффективность, специфичность действия, конформационная лабильность, способность осуществлять катализ в «мягких» условиях внутренней среды организма
Активность ферментов регулируется. Это свойство ферментов является основой регуляции метаболических процессов в организме
Слайд 49Литература
Биохимия: учебник для вузов / ред. Е. С. Северин. -
М.: ГЭОТАР-Медиа, 2014. -768 с.
Биологическая химия с упражнениями и
задачами: учебник / ред. С.Е. Северин. – М.: ГЭОТАР-Медиа, 2013. - 624 с. (С. 65-72; 76-86) Биологическая химия: учебник для студентов медицинских вузов / А.Я. Николаев. – М.: Мед. информ. агенство, 2007. – 568 с.
