Разделы презентаций


ВИСОКОЕФЕКТИВНИЙ СКРИНІНГ ( HTS) Количество – само по себе качество. приписують

Содержание

МЕТОДИ ІДЕНТИФІКАЦІЇ СПОЛУК – ЛІДІВ- ВИСОКОЕФЕКТИВНИЙ СКРИНІГ- ФЕНОТИПОВИЙ СКРИНІНГ- ФРАГМЕНТНО-ОРІЄНТОВАНИЙ ПОШУК Л/З- ХЕМОГЕНОМІКА- ЛІГАНД-ОРІЄНТОВАНИЙ ДИЗАЙН (3D) ПОДІБНІСТЬ ТА (Q)SAR ФАРМАКОФОРНІ МОДЕЛІ- СТРУКТУРНО-ОРІЄНТОВАНИЙ ДИЗАЙН МІСЦЕ ЗВ’ЯЗУВАННЯ ВІДОМЕ DE NOVO ДИЗАЙН- ВИПАДКОВІСТЬ ТА SERENDIPITYВІРТУАЛЬНИЙ СКРИНІНГта/абоДИЗАЙН «ВРУЧНУ»

Слайды и текст этой презентации

Слайд 1ВИСОКОЕФЕКТИВНИЙ СКРИНІНГ (HTS)
Количество – само по себе качество.
приписують Й. Сталіну

ВИСОКОЕФЕКТИВНИЙ СКРИНІНГ (HTS)Количество – само по себе качество.приписують Й. Сталіну

Слайд 2МЕТОДИ ІДЕНТИФІКАЦІЇ СПОЛУК – ЛІДІВ
- ВИСОКОЕФЕКТИВНИЙ СКРИНІГ
- ФЕНОТИПОВИЙ СКРИНІНГ
- ФРАГМЕНТНО-ОРІЄНТОВАНИЙ

ПОШУК Л/З
- ХЕМОГЕНОМІКА
- ЛІГАНД-ОРІЄНТОВАНИЙ ДИЗАЙН
(3D) ПОДІБНІСТЬ ТА (Q)SAR
ФАРМАКОФОРНІ МОДЕЛІ
- СТРУКТУРНО-ОРІЄНТОВАНИЙ

ДИЗАЙН
МІСЦЕ ЗВ’ЯЗУВАННЯ ВІДОМЕ
DE NOVO ДИЗАЙН

- ВИПАДКОВІСТЬ ТА SERENDIPITY

ВІРТУАЛЬНИЙ СКРИНІНГ
та/або
ДИЗАЙН «ВРУЧНУ»

МЕТОДИ ІДЕНТИФІКАЦІЇ СПОЛУК – ЛІДІВ- ВИСОКОЕФЕКТИВНИЙ СКРИНІГ- ФЕНОТИПОВИЙ СКРИНІНГ- ФРАГМЕНТНО-ОРІЄНТОВАНИЙ ПОШУК Л/З- ХЕМОГЕНОМІКА- ЛІГАНД-ОРІЄНТОВАНИЙ ДИЗАЙН	(3D) ПОДІБНІСТЬ ТА

Слайд 3СТАНОВЛЕННЯ HTS
КІНЕЦЬ 1980х: СКРИНІНГ СОТНІ СПОЛУК НА ТИЖДЕНЬ – ВИСОКОЕФЕКТИВНИЙ
-

РОЗВИТОК ЕФЕКТИВНИХ ТЕСТІВ in vitro (МІНІАТЮРИЗАЦІЯ ТА АВТОМАТИЗАЦІЯ)
- ПРОГРЕС В

МОЛЕКУЛЯРНІЙ БІОЛОГІЇ ТА БІОХІМІЇ

«ІНДУСТРІАЛІЗОВАНИЙ ПРОЦЕС, ЯКИЙ ВИКОРИСТОВУЄ ВАЛІДОВАНІ ТА ЛЕГКО КОНТРОЛЬОВАНІ БІОЛОГІЧНІ МІШЕНІ ТА ХІМІЧНЕ РІЗНОМАНІТТЯ, ЩОБ ШВИДКО ІДЕНТИФІКУВАТИ НОВІ ЛІДИ ДЛЯ РАННІХ ФАЗ ВІДКРИТТЯ ЛІКАРСЬКИХ ЗАСОБІВ»

СТАНОВЛЕННЯ HTSКІНЕЦЬ 1980х: СКРИНІНГ СОТНІ СПОЛУК 	НА ТИЖДЕНЬ – ВИСОКОЕФЕКТИВНИЙ- РОЗВИТОК ЕФЕКТИВНИХ ТЕСТІВ in vitro (МІНІАТЮРИЗАЦІЯ ТА

Слайд 4СТАНОВЛЕННЯ HTS
НЕОБХІДНІСТЬ ВЕЛИКОЇ КІЛЬКОСТІ РЕЧОВИН
- МАСОВІ ЗАКУПКИ КОЛЕКЦІЙ РЕЧОВИН
- СТАНОВЛЕННЯ

КОМБІНАТОРНОЇ ХІМІЇ

СТАНОВЛЕННЯ HTSНЕОБХІДНІСТЬ ВЕЛИКОЇ КІЛЬКОСТІ РЕЧОВИН- МАСОВІ ЗАКУПКИ КОЛЕКЦІЙ РЕЧОВИН- СТАНОВЛЕННЯ КОМБІНАТОРНОЇ ХІМІЇ

Слайд 5КІНЕЦЬ 1990х: КРАХ СПОДІВАНЬ…
- ВИПАДКОВІ ВИБІРКИ СВІТОВИХ КОЛЕКЦІЙ ХІМІЧНИХ

СПОЛУК
- ВІДСУТНІСТЬ КОНТРОЛЮ ЯКОСТІ ХІМІЧНИХ СПОЛУК
Drug Discov. Today 1999, 4,

447
КІНЕЦЬ 1990х:  КРАХ СПОДІВАНЬ…- ВИПАДКОВІ ВИБІРКИ СВІТОВИХ КОЛЕКЦІЙ ХІМІЧНИХ СПОЛУК- ВІДСУТНІСТЬ КОНТРОЛЮ ЯКОСТІ ХІМІЧНИХ СПОЛУКDrug Discov.

Слайд 6КІНЕЦЬ 1990-х: КРАХ СПОДІВАНЬ…

КІНЕЦЬ 1990-х:  КРАХ СПОДІВАНЬ…

Слайд 7ПЕРІОД “ТВЕРЕЗОГО” РОЗВИТКУ HTS
РОЗУМІННЯ НЕОБХІДНОСТІ СТРУКТУРНИХ ФІЛЬТРІВ
СПОЛУКИ ДЛЯ HTS НЕ

ПОВИННІ МАТИ:
- РЕАКЦІЙНОЗДАТНИХ ТА НЕСТАБІЛЬНИХ ГРУП (ангідриди, ацилгалогеніди, сульфохлориди, алкілгалогеніди

(за винятком фторидів), N–S, N=C=O, N=C=S, N=C=N, C=S, N–галоген, S–галоген, тіоли, епоксиди, азиди, азирідини, тіїрани, акцептори Міхаеля, альдегіди, іміни, 1,2-дикарбонільні сполуки;

- ПОТЕНЦІЙНИХ ТОКСИКОФОРІВ (N–NH2, –N=N–, ArNO2, деякі Ar–NH2 та ArOH, конденсовані ароматичні фрагменти)

- ІНШИХ СТРУКТУРНИХ ФРАГМЕНТІВ ПЕВНИХ ТИПІВ (елементів, інших ніж C, H, N, O, F, S, Cl, Br, I; цукрів, краун-етерів, довгих аліфатичних ланцюгів та карбоциклів…)

ПЕРІОД “ТВЕРЕЗОГО” РОЗВИТКУ HTSРОЗУМІННЯ НЕОБХІДНОСТІ СТРУКТУРНИХ ФІЛЬТРІВСПОЛУКИ ДЛЯ HTS НЕ ПОВИННІ МАТИ:- РЕАКЦІЙНОЗДАТНИХ ТА НЕСТАБІЛЬНИХ ГРУП (ангідриди,

Слайд 8ПЕРІОД “ТВЕРЕЗОГО” РОЗВИТКУ HTS
РОЗУМІННЯ НЕОБХІДНОСТІ СТРУКТУРНИХ ФІЛЬТРІВ
СПОЛУКИ ДЛЯ HTS ПОВИННІ

МАТИ:
- Як мінімум один N чи О атом
- Як мінімум

один цикл

LogP ≤ 5

MW ≤ 500

HBD ≤ 5

HBA ≤ 10

РОЗУМІННЯ НЕОБХІДНОСТІ ФІЗИКО-ХІМІЧНИХ ФІЛЬТРІВ

- Правила Ліпінського (правила «п’яти»)

- Правила Вебера

TPSA ≤ 140 Å2

RotB ≤ 10

«ПРАВИЛА ЛІКАРСЬКОПОДІБНОСТІ (DRUG-LIKENESS)»

ПЕРІОД “ТВЕРЕЗОГО” РОЗВИТКУ HTSРОЗУМІННЯ НЕОБХІДНОСТІ СТРУКТУРНИХ ФІЛЬТРІВСПОЛУКИ ДЛЯ HTS ПОВИННІ МАТИ:- Як мінімум один N чи О

Слайд 9ПЕРІОД “ТВЕРЕЗОГО” РОЗВИТКУ HTS
РОЗУМІННЯ НЕОБХІДНОСТІ СТРУКТУРНОГО РІЗНОМАНІТТЯ
МОЛЕКУЛЯРНА ПОДІБНІСТЬ ЗА ТАНІМОТО
-

ОБЧИСЛЮЄТЬСЯ КОЕФІЦІЄНТ ТАНІМОТО
- ГЕНЕРУЄТЬСЯ МОЛЕКУЛЯРНИЙ «ВІДБИТОК ПАЛЬЦІВ»
1) генерується набір структурних

фрагментів молекули (можуть включатися інші властивості)
2) за допомогою хеш-функції (псевдовипадкова) інформація про наявність кожного з фрагментів переводиться у ціле число (від 0 до 2N–1), що подається у двоїчному представленні довжини N біт
3) отримані двоїчні представлення сумуються за допомогою логічного оператора «АБО»

T (A, B) = N(AB) / (N(A) + N(B) – N(AB))

ПЕРІОД “ТВЕРЕЗОГО” РОЗВИТКУ HTSРОЗУМІННЯ НЕОБХІДНОСТІ СТРУКТУРНОГО РІЗНОМАНІТТЯМОЛЕКУЛЯРНА ПОДІБНІСТЬ ЗА ТАНІМОТО- ОБЧИСЛЮЄТЬСЯ КОЕФІЦІЄНТ ТАНІМОТО- ГЕНЕРУЄТЬСЯ МОЛЕКУЛЯРНИЙ «ВІДБИТОК ПАЛЬЦІВ»	1)

Слайд 1000000000 00000000 00000000 00000000 01000000 00000000 00000000 00000000 00000000 00000000

00000000 00000000 00000000 00000000 00000000 00000000
00000000 00000000 00001000 00000000

01000001 00000000 00001000 00000000 00000000 00000000 00000000 00000000 00000000 00000000 01000000 00000000

11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111110

11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 10111111 11111111 11111111 11111111 11111110 11111110

МОЛЕКУЛЯРНА ПОДІБНІСТЬ ЗА ТАНІМОТО: ПРИКЛАД

метан

етанол

T = 125 / (127 + 125 – 125) = 0.98

(ДЛЯ 1024 БІТ T = 0.69)

00000000 00000000 00000000 00000000 01000000 00000000 00000000 00000000 00000000 00000000 00000000 00000000 00000000 00000000 00000000 00000000 00000000

Слайд 11- РОЗУМІННЯ НЕОБХІДНОСТІ ЖОРСТКОГО КОНТРОЛЮ ЧИСТОТИ ХІМІЧНИХ СПОЛУК ДЛЯ HTS
ПЕРІОД

“ТВЕРЕЗОГО” РОЗВИТКУ HTS

- РОЗУМІННЯ НЕОБХІДНОСТІ ЖОРСТКОГО КОНТРОЛЮ ЧИСТОТИ ХІМІЧНИХ СПОЛУК ДЛЯ HTSПЕРІОД “ТВЕРЕЗОГО” РОЗВИТКУ HTS

Слайд 12ПЕРІОД “ТВЕРЕЗОГО” РОЗВИТКУ HTS
- ЕФЕКТИВНА ОРГАНІЗАЦІЯ І МЕНЕДЖМЕНТ
- РОЗВИТОК ТЕХНОЛОГІЇ

ПЕРІОД “ТВЕРЕЗОГО” РОЗВИТКУ HTS- ЕФЕКТИВНА ОРГАНІЗАЦІЯ І МЕНЕДЖМЕНТ- РОЗВИТОК ТЕХНОЛОГІЇ

Слайд 13СУЧАСНІ ТЕНДЕНЦІЇ РОЗВИТКУ HTS
- ФІЛЬТРИ НА ЛІД-ПОДІБНІСТЬ
- “ПРОРИВ У ТРЕТІЙ

ВИМІР”
- НАВЧАТИСЯ У ПРИРОДИ!
- ФОКУСНІ БІБЛІОТЕКИ
- РІЗНОМАНІТТЯ НА РІВНІ СКАФФОЛДІВ

СУЧАСНІ ТЕНДЕНЦІЇ РОЗВИТКУ HTS- ФІЛЬТРИ НА ЛІД-ПОДІБНІСТЬ- “ПРОРИВ У ТРЕТІЙ ВИМІР”- НАВЧАТИСЯ У ПРИРОДИ!- ФОКУСНІ БІБЛІОТЕКИ- РІЗНОМАНІТТЯ

Слайд 14СУЧАСНІ ТЕНДЕНЦІЇ РОЗВИТКУ HTS
- ФІЛЬТРИ НА ЛІД-ПОДІБНІСТЬ
- “ПРОРИВ У ТРЕТІЙ

ВИМІР”
- НАВЧАТИСЯ У ПРИРОДИ!
- ФОКУСНІ БІБЛІОТЕКИ
- РІЗНОМАНІТТЯ НА РІВНІ СКАФФОЛДІВ

СУЧАСНІ ТЕНДЕНЦІЇ РОЗВИТКУ HTS- ФІЛЬТРИ НА ЛІД-ПОДІБНІСТЬ- “ПРОРИВ У ТРЕТІЙ ВИМІР”- НАВЧАТИСЯ У ПРИРОДИ!- ФОКУСНІ БІБЛІОТЕКИ- РІЗНОМАНІТТЯ

Слайд 15СУЧАСНІ ТЕНДЕНЦІЇ РОЗВИТКУ HTS

СУЧАСНІ ТЕНДЕНЦІЇ РОЗВИТКУ HTS

Слайд 16СУЧАСНІ ТЕНДЕНЦІЇ РОЗВИТКУ HTS
- ФІЛЬТРИ НА ЛІД-ПОДІБНІСТЬ
- “ПРОРИВ У ТРЕТІЙ

ВИМІР”
- НАВЧАТИСЯ У ПРИРОДИ!
- ФОКУСНІ БІБЛІОТЕКИ
- РІЗНОМАНІТТЯ НА РІВНІ СКАФФОЛДІВ

СУЧАСНІ ТЕНДЕНЦІЇ РОЗВИТКУ HTS- ФІЛЬТРИ НА ЛІД-ПОДІБНІСТЬ- “ПРОРИВ У ТРЕТІЙ ВИМІР”- НАВЧАТИСЯ У ПРИРОДИ!- ФОКУСНІ БІБЛІОТЕКИ- РІЗНОМАНІТТЯ

Слайд 17СУЧАСНІ ТЕНДЕНЦІЇ РОЗВИТКУ HTS

СУЧАСНІ ТЕНДЕНЦІЇ РОЗВИТКУ HTS

Слайд 18СУЧАСНІ ТЕНДЕНЦІЇ РОЗВИТКУ HTS
- ФІЛЬТРИ НА ЛІД-ПОДІБНІСТЬ
- “ПРОРИВ У ТРЕТІЙ

ВИМІР”
- НАВЧАТИСЯ У ПРИРОДИ!
- ФОКУСНІ БІБЛІОТЕКИ
- РІЗНОМАНІТТЯ НА РІВНІ СКАФФОЛДІВ

СУЧАСНІ ТЕНДЕНЦІЇ РОЗВИТКУ HTS- ФІЛЬТРИ НА ЛІД-ПОДІБНІСТЬ- “ПРОРИВ У ТРЕТІЙ ВИМІР”- НАВЧАТИСЯ У ПРИРОДИ!- ФОКУСНІ БІБЛІОТЕКИ- РІЗНОМАНІТТЯ

Слайд 19СУЧАСНІ ТЕНДЕНЦІЇ РОЗВИТКУ HTS
- ФІЛЬТРИ НА ЛІД-ПОДІБНІСТЬ
- “ПРОРИВ У ТРЕТІЙ

ВИМІР”
- НАВЧАТИСЯ У ПРИРОДИ!
- ФОКУСНІ БІБЛІОТЕКИ
- РІЗНОМАНІТТЯ НА РІВНІ СКАФФОЛДІВ

СУЧАСНІ ТЕНДЕНЦІЇ РОЗВИТКУ HTS- ФІЛЬТРИ НА ЛІД-ПОДІБНІСТЬ- “ПРОРИВ У ТРЕТІЙ ВИМІР”- НАВЧАТИСЯ У ПРИРОДИ!- ФОКУСНІ БІБЛІОТЕКИ- РІЗНОМАНІТТЯ

Слайд 20СУЧАСНІ ТЕНДЕНЦІЇ РОЗВИТКУ HTS

СУЧАСНІ ТЕНДЕНЦІЇ РОЗВИТКУ HTS

Слайд 21СУЧАСНІ ТЕНДЕНЦІЇ РОЗВИТКУ HTS
- ФІЛЬТРИ НА ЛІД-ПОДІБНІСТЬ
- “ПРОРИВ У ТРЕТІЙ

ВИМІР”
- НАВЧАТИСЯ У ПРИРОДИ!
- ФОКУСНІ БІБЛІОТЕКИ
- РІЗНОМАНІТТЯ НА РІВНІ СКАФФОЛДІВ

СУЧАСНІ ТЕНДЕНЦІЇ РОЗВИТКУ HTS- ФІЛЬТРИ НА ЛІД-ПОДІБНІСТЬ- “ПРОРИВ У ТРЕТІЙ ВИМІР”- НАВЧАТИСЯ У ПРИРОДИ!- ФОКУСНІ БІБЛІОТЕКИ- РІЗНОМАНІТТЯ

Слайд 22СУЧАСНІ ТЕНДЕНЦІЇ РОЗВИТКУ HTS

СУЧАСНІ ТЕНДЕНЦІЇ РОЗВИТКУ HTS

Слайд 23ТИПИ HTS-ТЕСТІВ
- БІОХІМІЧНІ ТЕСТИ
РАДІОЛІГАНДНІ (SPA)
ФЛУОРЕСЦЕНТНІ (FLINT, FP, TR-FRET)
ЛЮМІНЕСЦЕНТНІ
(ФОТОАБСОРБЦІЙНІ)
- КЛІТИННІ ТЕСТИ
ЗА

ВТОРИННИМИ МЕСЕНДЖЕРАМИ (FLIPR, VIPR)
З ВИКОРИСТАННЯМ ГЕНІВ-РЕПОРТЕРІВ
ЗА ПРОЛІФЕРАЦІЄЮ ТОЩО

ФЛУОРЕСЦЕНТНІ/ЛЮМІНЕСЦЕНТНІ/НЕФЕЛОМЕТРИЧНІ

ТИПИ HTS-ТЕСТІВ- БІОХІМІЧНІ ТЕСТИ	РАДІОЛІГАНДНІ (SPA)	ФЛУОРЕСЦЕНТНІ (FLINT, FP, TR-FRET)	ЛЮМІНЕСЦЕНТНІ	(ФОТОАБСОРБЦІЙНІ)- КЛІТИННІ ТЕСТИ	ЗА ВТОРИННИМИ МЕСЕНДЖЕРАМИ (FLIPR, VIPR)	З ВИКОРИСТАННЯМ ГЕНІВ-РЕПОРТЕРІВ	ЗА ПРОЛІФЕРАЦІЄЮ

Слайд 24ТЕСТ ЗА СЦИНТИЛЯЦІЙНОЮ БЛИЗЬКІСТЮ (SPA)

ТЕСТ ЗА СЦИНТИЛЯЦІЙНОЮ БЛИЗЬКІСТЮ (SPA)

Слайд 25ТЕСТ ЗА ІНТЕНСИВНІСТЮ ФЛУОРЕСЦЕНЦІЇ (FLINT)

ТЕСТ ЗА ІНТЕНСИВНІСТЮ ФЛУОРЕСЦЕНЦІЇ (FLINT)

Слайд 26МІКРОПЛАНШЕТНИЙ РІДЕР ФЛУОРЕСЦЕНТНОГО ВІДОБРАЖЕННЯ (FLIPR)

МІКРОПЛАНШЕТНИЙ РІДЕР ФЛУОРЕСЦЕНТНОГО ВІДОБРАЖЕННЯ (FLIPR)

Слайд 27ОБЛАДНАННЯ ДЛЯ HTS: МІКРОПЛАНШЕТИ

ОБЛАДНАННЯ ДЛЯ HTS: МІКРОПЛАНШЕТИ

Слайд 28ОБЛАДНАННЯ ДЛЯ HTS: БАГАТОКАНАЛЬНІ ДОЗАТОРИ
Beckman Multimek

ОБЛАДНАННЯ ДЛЯ HTS: БАГАТОКАНАЛЬНІ ДОЗАТОРИBeckman Multimek

Слайд 29Tecan Sunrise
ОБЛАДНАННЯ ДЛЯ HTS: МІКРОПЛАНШЕТНІ РІДЕРИ

Tecan SunriseОБЛАДНАННЯ ДЛЯ HTS: МІКРОПЛАНШЕТНІ РІДЕРИ

Слайд 30ОБЛАДНАННЯ ДЛЯ HTS: FLIPR

ОБЛАДНАННЯ ДЛЯ HTS: FLIPR

Слайд 31Grow reporter cell line in CO2 incubator
Check quality, seed into

384-well plates
Format compound library
Incubate
48 hrs
Wash
Lyse
cells
Add AP Substrate
Incubate 20 min.
Read

Fluorescence

Add compounds
Add ligand

Plate cell
dispenser

Plate
reader

Robotic liquid handler

Plate
washer

ПРИКЛАД АЛГОРИТМУ

Grow reporter cell line in CO2 incubatorCheck quality, seed into 384-well platesFormat compound libraryIncubate48 hrsWashLysecells Add AP

Слайд 32HITS
ПЕРВИННИЙ РЕЗУЛЬТАТ HTS

HITSПЕРВИННИЙ РЕЗУЛЬТАТ HTS

Слайд 33УСПІХИ HTS: ЛІКАРСЬКІ ЗАСОБИ
>20

УСПІХИ HTS: ЛІКАРСЬКІ ЗАСОБИ>20

Слайд 34МАЙБУТНЄ HTS

МАЙБУТНЄ HTS

Обратная связь

Если не удалось найти и скачать доклад-презентацию, Вы можете заказать его на нашем сайте. Мы постараемся найти нужный Вам материал и отправим по электронной почте. Не стесняйтесь обращаться к нам, если у вас возникли вопросы или пожелания:

Email: Нажмите что бы посмотреть 

Что такое TheSlide.ru?

Это сайт презентации, докладов, проектов в PowerPoint. Здесь удобно  хранить и делиться своими презентациями с другими пользователями.


Для правообладателей

Яндекс.Метрика