Разделы презентаций
- Разное
- Английский язык
- Астрономия
- Алгебра
- Биология
- География
- Геометрия
- Детские презентации
- Информатика
- История
- Литература
- Математика
- Медицина
- Менеджмент
- Музыка
- МХК
- Немецкий язык
- ОБЖ
- Обществознание
- Окружающий мир
- Педагогика
- Русский язык
- Технология
- Физика
- Философия
- Химия
- Шаблоны, картинки для презентаций
- Экология
- Экономика
- Юриспруденция
12 дуплетный код
Содержание
- 1. 12 дуплетный код
- 2. Генетический код – это Способ записи
- 3. Каким должен быть дуплетный кодЧисло возможных дуплетов
- 4. Наш метод создания кода:Выбрали белки лизоцим (129
- 5. Проблема глицина:считать глицин полярной или неполярной а.к.?Мы
- 6. Слайд 6
- 7. Знаком начала гена мы выбралиСТАРТ-кодон АУ
- 8. Идеальный дуплетный код
- 9. Свойства дуплетного кода:Отсутствие межкодонных знаков препинанияНаличие межгенных
- 10. Сравним эти два кода – построенный нами
- 11. ПомехоустойчивостьX Y 1 2Консервативная
- 12. Гидрофобные (неполярные)Классификация аминокислот по полярности радикалаГидрофильныеПолярныеЗаряженные (ионы)+─
- 13. Подсчёт коэффициента помехоустойчивости (q).Число радикальных замен =
- 14. Недостатки дуплетного кода:Таким кодом невозможно закодировать больше, чем 15 аминокислот.Возможный путь преодоления: Посттрансляционная модификация
- 15. Molecular Cell Biology Harvey Lodish et al.Примеры пострансляционной модификации аминокислот
- 16. Недостатки дуплетного кода:Коэффициент помехоустойчивости (q) меньше, чем у триплетного кода (qтр~1,28, а qдп∼1,1) Нет вырожденности (избыточности).
- 17. ЛитератураВ.А. Ратнер. Молекулярно-генетические системы управления. Наука, Новосибирск, 1981.
- 18. Скачать презентанцию
Генетический код – это Способ записи информации о первичной структуре белков через последовательность нуклеотидов ДНК и РНК = «Словарь» перевода с языка нуклеиновых кислот на язык белков.
Слайды и текст этой презентации
Слайд 2Генетический код – это
Способ записи информации о первичной
структуре белков через последовательность нуклеотидов ДНК и РНК
перевода с языка нуклеиновых кислот на язык белков.
Слайд 3Каким должен быть дуплетный код
Число возможных дуплетов = 16
Им
можно закодировать не более 15 а.к.
один из дуплетов –
на СТОП-кодон
Слайд 4Наш метод создания кода:
Выбрали белки лизоцим (129 а.к.) и миоглобин
(154 а.к.);
Разделили а.к. на две группы:
а) обязательно
кодируемые б) с похожими радикалами
Посмотрели, какие а.к. наиболее часто встречаются в данных белках;
Подобрали дуплеты и а.к. так, чтобы коэффициент q был как можно больше.
Слайд 5Проблема глицина:
считать глицин полярной или неполярной а.к.?
Мы считали неполярной, потому
что:
Gly – п: qтр=1,16
Gly – н/п: qтр=1,28
Слайд 7Знаком начала гена мы выбрали
СТАРТ-кодон АУ
кодирует
Мет, а в начале гена фМет.
(в триплетном АУГ)
Знак окончания гена
–СТОП-кодон УА
(в триплетном УАА, УАГ, УГА)
Слайд 9Свойства дуплетного кода:
Отсутствие межкодонных знаков препинания
Наличие межгенных знаков препинания
Однозначность
Неперекрываемость
Дуплетность
Нет вырожденности
(избыточности)
Экономичность (на белок той же длины нужно меньше ДНК)
Слайд 10Сравним эти два кода – построенный нами дуплетный и стандартный
триплетный
Один из самых важных параметров - помехоустойчивость
Слайд 11Помехоустойчивость
X Y
1 2
Консервативная замена – не
меняет класс аминокислоты
Радикальная замена – меняет класс аминокислоты
Слайд 12Гидрофобные (неполярные)
Классификация аминокислот по полярности радикала
Гидрофильные
Полярные
Заряженные (ионы)
+
─
Слайд 13Подсчёт коэффициента помехоустойчивости (q).
Число радикальных замен = 40,
А консервативных
- 44,
Учитывая, что глицин – неполярная аминокислота и не
включая кодон УАq = 44/40 = 1,1.
Слайд 14Недостатки дуплетного кода:
Таким кодом невозможно закодировать больше, чем 15 аминокислот.
Возможный
путь преодоления:
Посттрансляционная модификация
Слайд 15Molecular Cell Biology
Harvey Lodish et al.
Примеры пострансляционной модификации аминокислот
Слайд 16Недостатки дуплетного кода:
Коэффициент помехоустойчивости (q) меньше, чем у триплетного кода
(qтр~1,28, а qдп∼1,1)
Нет вырожденности (избыточности).
Слайд 17Литература
В.А. Ратнер. Молекулярно-генетические системы управления. Наука, Новосибирск, 1981.
Теги
