Разделы презентаций
- Разное
- Английский язык
- Астрономия
- Алгебра
- Биология
- География
- Геометрия
- Детские презентации
- Информатика
- История
- Литература
- Математика
- Медицина
- Менеджмент
- Музыка
- МХК
- Немецкий язык
- ОБЖ
- Обществознание
- Окружающий мир
- Педагогика
- Русский язык
- Технология
- Физика
- Философия
- Химия
- Шаблоны, картинки для презентаций
- Экология
- Экономика
- Юриспруденция
Биоинформационные подходы исследования белок-белковых взаимодействий
Содержание
- 1. Биоинформационные подходы исследования белок-белковых взаимодействий
- 2. Основа подходаАнализ имеющихся геномных, протеомных и интерактомных
- 3. Классификация подходов в зависимости от источника информацииПодходы,
- 4. Подходы, основанные на геномной информации Анализ сходства
- 5. Анализ функциональной связи совместно расположенных генов (метод
- 6. Анализ функциональной связи совместно расположенных генов (метод
- 7. Подходы, основанные на эволюционной взаимосвязи белков
- 8. Подходы, основанные на трехмерной структуре белка Гомологичные
- 9. Подходы, основанные на информации о белковых доменах
- 10. Скачать презентанцию
Основа подходаАнализ имеющихся геномных, протеомных и интерактомных экспериментальных данных = информация баз данныхИтог подходаПредсказание новых взаимодействий на основе выявляемых закономерностей
Слайды и текст этой презентации
Слайд 2Основа подхода
Анализ имеющихся геномных, протеомных и интерактомных экспериментальных данных =
информация баз данных
Слайд 3Классификация подходов в зависимости от источника информации
Подходы, основанные на геномной
информации
Подходы, основанные на эволюционной взаимосвязи белков
Подходы, основанные на трехмерной структуре
белкаПодходы, основанные на информации о белковых доменах
Подходы, основанные на первичной структуре белка
Слайд 4Подходы, основанные на геномной информации
Анализ сходства последовательности генов
Анализ функциональной связи
совместно расположенных генов (метод позиционно связанных генов)
Секвенирование генома
Общий смысл:
Если гены похожи, то их продукты также могут быть похожими (гомологичными), и поэтому они смогут взаимодействовать между собойОбщий смысл: Если гены располагаются рядом, то их продукты должны выполнять совместно определённую функцию, и поэтому они смогут взаимодействовать между собой
Слайд 5Анализ функциональной связи совместно расположенных генов (метод позиционно связанных генов)
Различен для прокариот и эукариот, так как у них отличается
организация генома
Слайд 6Анализ функциональной связи совместно расположенных генов (метод позиционно связанных генов)
Однако
в ходе эволюции структурные гены оперона прокариот могли объединяется в
один ген, продутом которого являлись белки слияния – мультидоменные белки (белки «Розеттского камня»)Хоть домены связаны полипептидной цепью, но они также могут взаимодействовать между собой с помощью ББВ.
Слайд 8Подходы, основанные на трехмерной структуре белка
Гомологичные белки (>30% идентичности последовательностей)
участвуют в сходных ББВ.
Есть общая зона контакта у гомологичных белков
– контактный интерфейс (структурно консервативен)Из этого следует, что, изучив одну пространственную структуру ББВ пары белков, можно создать модель их взаимодействия.
По этой модели можно рассчитывать вероятность такого же ББВ между гомологичными белками.
Слайд 9Подходы, основанные на информации о белковых доменах
Основываются на анализе консерватизма
белковых доменов
Подходы, основанные напервичной структуре белка
Основываются на гипотезе, что ББВ
характеризуют некоторые короткие специфические полипептидные последовательности.
