Слайд 1Экспрессия генов и механизмы регуляции
Слайд 2Регуляция прокариот
Регуляция метаболизма, поведения, морфологии бактерий осуществляется с помощью контроля
экспрессии генов.
Прокариоты способны быстро меняться в ответ на условия среды,
переключая работу многих гены и оперонов.
Для адаптации и экономии ресурсов экспрессия должна строго регулироваться.
Регуляция экспрессия эукариот сложнее в сравнении с прокариотами и включает больше точек контроля.
Слайд 3Регуляция прокариот
Контроль осуществляется на уровне инициации и элонгации транскрипции, трансляции
и посттрансляции.
Археи схожи с бактериями по организации генома, однако их
регуляторные механизмы имеют большое сходство с эукариотическими организмами.
Слайд 4Регуляция прокариот
Примеры: Почвенный микроорганизм Bacillus subtilis при понижении концентрации питательных
веществ запускает процессы споруляции. Патогенные организмы при попадании в организм
хозяина приспосабливаются к температуре и высокой концентрации питательных веществ.
Хромосома Escherichia coli кодирует 4500 белков, однако не все они экспрессируются. Некоторые участки экспрессируются постоянно, некоторые – раз за генерацию.
Слайд 5Уровни регуляции в трех доменах жизни
Механизмы транскрипции и трансляции
схожи у всех живых организмов.
Бактерии не содержат гистонов (за
исключением некоторых архебактерий), их ДНК более доступна для РНК-полимеразы, в то же время Эукариоты имеюют дополнительные этапы регуляции, связанные с изменением структуры хроматина.
Молекулы РНК у эукариот моноцистронны, требуется обработка иРНК (кэпирование, полиаденилирование, вырезание интронов). У прокариот транскрипция и трансляция происходят совместно.
Слайд 9История открытия регуляции
1900г. Эмиль Дюкло обнаружил спобность Aspergillus niger продуцировать
фермент гидролизующий сукрозу только в присутствии субстрата.
Также в 1909г.
Ф.Динерт обнаружил, что дрожжи содержат фермент галактозидазу только на среде с галактозой.
1930г. Х.Картстрём предложил разделить ферменты на 2 класса: адаптивные и конститутивные.
1942г. Жак Моно обнаружил что аналоги галактозидазы также вызывают продукцию фермента. Концентрация и скорость роста не влияли на индукцию синтеза фермента, который синтезировался вновь в клетке а не формировался из предшественника под действием галактозы.
Слайд 10История открытия регуляции
Позже Ледерберг, Моно, Жакоб и Парди обнаружили наличие
гена, синтезирующего продукт ингибирующий запуск синтеза галактозидазы.
1961г. Жакоб и
Моно назвали этот продукт репрессором, предположив его белковую природу. Комплекс оператора (сайта структурного гена, запускающего синтез фермента) и генов которые он контролирует назвали оперон.
1967г. У.Гилберт и Б. Мюллер-Хилл изолировали репрессор, доказали его белковую природу.
Слайд 11Регуляция прокариот
Исследования Е. coli показали, что у бактерий существуют ферменты
3 типов:
конститутивные, присутствующие в клетках в постоянных количествах независимо
от метаболического состояния организма (например, ферменты гликолиза);
индуцируемые, их концентрация в обычных условиях мала, но может возрастать в 100 раз и более;
репрессируемые, т.е. ферменты метаболических путей, синтез которых прекращается при добавлении в среду выращивания конечного продукта этих путей.
Слайд 12Лактозный оперон
При выращивании E.coli на среде с лактозой, содержание лактозы
достигает 3000 молекул на клетку, без лактозы – 3 молекулы.
Фермент галактозидаза расщепляет лактозу на галактозу и глюкозу.
Галактозидаза – индуцибельный фермент, кодируется индуцибельными генами. Лактоза – индуктор.
Промотор – связывает РНК-полимеразу. Регуляторный элемент – участок ДНК, примыкающий к промотору и связывающий белок-регулятор (активатор или репрессор).
Слайд 20Отрицательный контроль индуцибельных генов
Пример: лактозный оперон.
В отсутствии индуктора, репрессорный
белок блокирует транскрипцию. При появлении индуктора, комплекс (репрессор+индуктор) теряет способность
связывать с ДНК, РНК-полимераза получает доступ к промотору.
Слайд 21Отрицательный контроль репрессибельных генов
Пример: оперон синтеза триптофана.
В отсутствии корепрессора
белок-репрессор не способен связываться с ДНК, транскрипция идет нормально.
Корепрессор
(триптофан) связывается с репрессором, который блокирует оператор.
Слайд 22Положительный контроль индуцибельных генов
Пример: оперон деградации арабинозы.
Активаторный белок (апоактиватор)
способен связываться с сайтом активации на ДНК только в комплексе
с индуктором (арабиноза).
Слайд 23Положительный контроль репрессибельных генов
Пример: оперон синтеза лейцина.
Активаторный белок связывается
с ДНК и запускает транскрипцию. Ингибитор присоединяется к активатору и
делает его неспособным связаться с ДНК.
Слайд 24Особенности белков-активаторов
На оперон могут воздействовать одновременно специфический и общий активаторы.
Активаторы не являются особой группой белков.. Многие метаболические ферменты являются
активаторами.
Пример: репаративный белок Ada устраняет алкильные группы. Алкильные (метильные) группы переносяться на сам белок, его метилированная модификация (meAda) – служит активатором транскрипции собственного гена.