Слайд 1Государственный медицинский университет города Семей
Кафедра биохимии и химических дисциплин
СРС
Подготовил: Володкин
Р. 225ОМФ
Проверила: Олжаева Р.Р.
Семей 2013 г
Тема: «Нуклеопротеиды и нуклеиновые кислоты
.Структура и функции нуклеопротеидов и нуклеиновых кислот. Структурная организация хромосом. Механизмы синтеза белка и нуклеиновых кислот.»
Слайд 2План.
I Введение
IIОсновная часть:
Нуклеотиды, нуклеиновые кислоты:
понятие и свойства.
2. Структура и функции
нуклеиновых кислот и нуклеотидов.
3. Структурная организация хромосом.
4. Механизмы синтеза белка
и нуклеиновых кислот
IIIЗаключение
IV Список литературы
Слайд 3Введение.
Синтез белка – многоступенчатый процесс, связанный с синтезом ДНК и
функцией хромосом ядра клеток, с синтезом РНК и функцией рибосом
ЭПС. Благодаря многочисленным исследованиям стало очевидно, что в основе структуры ген.кода лежит нуклеотидная последовательность полинуклеотидных цепей ДНК. Сформулирован основной постулат молекулярной биологии и генетики (ДНК – РНК– белок). Было установлено, что основными генетическими механизмами являются процессы репликации и репарации ДНК, транскрипции (синтез РНК), трансляции (синтез белка) и механизмы рекомбинации.
Слайд 4НУКЛЕОПРОТЕИДЫ
- комплексы нуклеиновых кислот с белками. Содержатся в каждой клетке и выполняют важные
функции, связанные с хранением и реализацией генетич. информации. Нуклеопротеиды образуются
с участием как ДНК (дезоксирибо-нуклеопротеиды, или ДНП), так и РНК(рибонуклеопротеи-ды, или РНП). Типичные представители РНП -рибосомы (комплексы рибосомных РНК с белками) и информосомы (комплексыматричных РНК с белками); типичный ДНП-хроматин (комплекс ДНК с гистонами и негистоновыми белками). К нуклеопротеидам относят такжевирусы (бактериофаги, вирусы растений и животных без внеш. оболочки) и нуклеокапсиды вирусов (комплексы вирусных РНК и ДНК с белками увирусов с внеш. оболочкой).
Нуклеопротеиды существуют в клетке длит. время.
Слайд 5Нуклеопротеидный комплекс — субчастица 50S рибосом бактерий.
Жёлтым показана рРНК, синим — белки.
Слайд 6Помимо природных нуклеопротеидов, выделяемых из биол. объектов, существуют искусственные нуклеопротеиды, к-рые
получают из синтетич.полинуклеотидов и белков. Последние широко используют в исследованиях как модели
природных нуклеопротеидов.
Нуклеопротеиды выделяют из клеток в осн. с помощью ультрацентри-фугирования и гель-электрофореза, избегая денатурирующих воздействий.
Слайд 7Физические свойства:
Нуклеиновые кислоты хорошо растворимы в воде, практически не растворимы в
органических растворителях. Очень чувствительны к действию температуры и критическим значениям
уровня pH. Молекулы ДНК с высокой молекулярной массой, выделенные из природных источников, способны фрагментироваться под действием механических сил, например при перемешивании раствора. Нуклеиновые кислоты фрагментируются ферментами — нуклеазами.
Нуклеиновые кислоты
Нуклеиновая кислота (от лат. nucleus — ядро) — высокомолекулярное органическое соединение, образованное остатками нуклеотидов. Нуклеиновые кислоты ДНК и РНК присутствуют в клетках всех живых организмов и выполняют важнейшие функции по хранению, передаче и реализации наследственной информации.
Слайд 8В природе существуют нуклеиновые кислоты двух типов, различающиеся по составу,
строению и функциям. Одна из них содержит углеводный компонент дезоксирибозу
и названа дезоксирибонуклеиновой кислотой (ДНК).
Другая содержит рибозу и названа рибонуклеиновой кислотой (РНК).
Слайд 9Фосфат и сахар составляют неспецифическую часть в молекуле нуклеотида, а
пуриновое или пиримидиновое основание — специфическую.
Химически нуклеиновые кислоты представляют собой
биополимеры, состоящие из мономерных звеньев — нуклеотидов. Каждый нуклеотид содержит три различных компонента: азотистое основание, моносахарид пентозу, остаток фосфорной кислоты (P). Эти компоненты соединены друг с другом в такой последовательности: азотистое основание — пентоза — фосфат. Соседние нуклеотиды связаны друг с другом посредством эфирной связи между моносахаридом и фосфатом другого нуклеотида.
Биологическая функция нуклеиновых кислот оставалась неизвестной в течение почти столетия. Только в 40-х гг. XXв. О.Т . Эвери, К. Мак-Леод и М. Мак-Карти установили, что эти биополимеры ответственны за хранение, репликацию (воспроизведение), транскрипцию (передачу) и трансляцию (воспроизведение на белок) генетической (наследственной) информации. В 1953г., когда Дж. Уотсон и Ф. Крик сообщили о расшифровке молекулярной структуры ДНК, биохимия и вообще биология начала отсчет новой эры познания живой материи.
Слайд 10Структура нуклеиновых кислот:
1. первичная структура - Под первичной структурой нуклеиновых
кислот понимают порядок, последовательность расположения мононуклеотидов в полинуклеотидной цепи ДНК
и РНК.
2. Вторичная структура - Она основана на молекуле Днк которая состоит из двух цепей образуя правовращающую спираль в которую обе полинуклеотидные цепи закручены вокруг одной и той же оси.Одна оссобенность они удерживаються водородными связами.
3. Третичная структура - Двойная спираль ДНК на некоторых участках может подвергаться дальнейшей спирализации с образованием суперспирали или открытой кольцевой формы.
Слайд 11ХРОМОСОМЫ
(греч. chroma цвет, окраска+ soma тело) - основные структурно-функциональные
элементы клеточного ядра, содержащие гены. В клетках всех организмов имеется
определенное, характерное для каждого биологического вида число хромосом (хромосомный набор). В половых клетках (гаметах) все хромосомы набора представлены в единственном числе (гаплоидный хромосомный набор), в соматических клетках в диплоидном наборе.
Слайд 12Вся информация о человеке хранится в хромосомах. Высокомолекулярные ДНК в
комплексе с молекулами многочисленных белков составляют хромосому. В структуре хромосомы
молекула ДНК наряду с типичной одной двойной спиралью может содержать участки, состоящих из нескольких двойных спиралей, дополнительно закрученных крупными витками.
Молекула ДНК заряжается отрицательно и присоединяет к своей поверхности по всей длине положительные белки-гистоны, образуя хроматин.
Хромосомы по своей структуре – нуклеопротеиды. Они состоят из белковой части (гистоны), и простатической группы (ДНК, РНК).
В 1932 г. Герман Мёллер обратил внимание на особое поведение концевых участков хромосом, которые предотвращали склеивание одних хромосом с другими. Он назвал их теломерами.
Структурная организация
хромосом
Слайд 13Структурная организация хромосом меняется в течение жизненного цикла клетки. Сохраняя
свою индивидуальность в ядре, хромосомы обладают способностью к удвоению (редупликации)
в интерфазе, конденсации и продольному расщеплению в митозе. При формировании половых клеток соответствующие друг другу (гомологичные) хромосомы соединяются (конъюгируют) по длине, образуя так называемые биваленты и обмениваются гомологичными участками (явление генетической рекомбинации).
Слайд 14В составе хроматина имеются кроме гистонов и другие белки.
В хромосоме
спираль ДНК соединяется с группами из восьми молекул белка гистона
и образует нуклеосомы - частицы, имеющие вид нанизанных на нить из ДНК бусинок.
Нуклеосомы и соединяющие их участки ДНК плотно упакованы в виде спирали толщиной в 36 нм. На каждый виток спирали приходится примерно 6 нуклеосом, которые по своим размерам и другим признакам соответствуют хромомере хромосом.
Слайд 15
Теломеры хромосом.
В 1932 году Нобелевский лауреат Герман Мёллер обратил внимание
на особое поведение концевых участков хромосом, которые предотвращали склеивание одних
хромосом с другими. Он назвал их "теломерами", что в переводе с греческого означает "концевые частички". Длина теломер колеблется от 5 до 15 тысяч пар оснований.
Главной функцией теломер является защита концов хромосом от деградации и слипания во время клеточного деления.
Для деления клетки необходимо, чтобы перед этим произошло удвоение хромосом.
ДНК-полимеразы –ферменты ведущие синтез ДНК на ДНК-матрице нуждаются в наличии праймеров .
Функцию праймеров выполняет фрагменты РНК, синтезируемые на ДНК матрице ферментом праймазой.
После завершения синтеза копий ДНК происходит удаление праймеров, и дочерние цепи ДНК оказываются недореплицированными, то есть короче материнских ДНК на размер праймера (на 100-200 нуклеотидов), что приводит укорочению теломеров.
Слайд 16Прогрессивное укорочение теломер является счетно-ограничительным механизмом митотических циклов и играет
роль часов, отсчитывающих число делений клетки и продолжительность жизни.
При
каждом делении клетки теломеры дочерних клеток становятся короче на 100-200 нуклеотидов.
По достижении критической длины теломеров ДНК запускаются процессы остановки клеточного цикла.
Это состояние получило название сенессенса или "репликативного старения ".
Старение обусловлено исчезновением теломер и образованием "липких" концов хромосом, что вызывает их слипание.
Далее запускаются реакции разрушения ДНК, в результате чего клетка утрачивает способность к репродукции и погибает.
В результате того что после каждой репликации дочерние цепи ДНК оказываются короче материнских на размер первого РНК-праймера (10-20 нуклеотидов), образуются выступающие однонитевые 3'-концы материнских цепей.
Они-то узнаются особым ферментом - теломеразой, которая последовательно наращивает материнские цепи (у человека на сотни повторов), используя 3'-ОН-концы их в качестве затравок, а РНК, входящую в состав фермента, в качестве матрицы.
Образующиеся длинные одноцепочные концы, в свою очередь, служат матрицами для синтеза дочерних цепей по традиционному репликативному механизму.
Слайд 17Теломераза является ДНК-полимеразой, достраивающей
3'-концы линейных молекул ДНК хромосом короткими
(6-8 нуклеотидов) повторяющимися последовательностями (у позвоночных TTAGGG).
Согласно номенклатуре, этот
фермент называют ДНК-нуклеотидилэкзотрансферазой или теломерной терминальной трансферазой.
Помимо белковой части теломераза содержит РНК, выполняющую роль матрицы для наращивания ДНК повторами.
Длина теломеразной РНК колеблется от 150 нуклеотидов у простейших до 1400 нуклеотидов у дрожжей, у человека - 450 нуклеотидов.
Сам факт наличия в молекуле РНК последовательности, по которой идет матричный синтез куска ДНК, позволяет отнести теломеразу к своеобразной обратной транскриптазе, то есть ферменту, способному вести синтез ДНК по матрице РНК.
Слайд 181. Кодовым элементом в полинуклеотидной цепи ДНК, определяющим включение соответствующей
аминокислоты в полипептидную цепь, служит триплет ( триплетный код).
2. Код универсален: одни и те же триплеты кодируют одни и те же аминокислоты у всех живущих на Земле организмов.
3. Каждой аминокислоте соответствует свой код (ТТТ - фенилаланин, ЦТТ - лейцин, ТАТ - тирозин и др.).
4. Триплетный код является вырожденным: аминокислота может кодироваться несколькими триплетами (ТТГ, ТТЦ - фенилаланин, ААГ, ААЦ - аспарагин и др.).
5. Триплетный код не перекрывается.
6. Имеет место инициирующий триплет и терминирующий стоп триплет (кодон).
Инициирующий "стартовый" триплет (АТГ - триплет метионина, ГТГ -триплет валина) служит сигналом, означающим начало полипептидной цепи.
Терминирующий стоп триплет (ТАА, ТАГ, ТГА), или бессмысленный код, не кодирует ни одну аминокислоту, и служит "стоп сигналом", означающим конец синтеза полипептидной цепи.
Генетический код.
Слайд 19Биосинтез белка — сложный многостадийный процесс синтеза полипептидной цепи из аминокислот, происходящий на рибосомах с участием молекул мРНК и тРНК.
Процесс биосинтеза белка требует значительных затрат энергии
Биосинтез белка происходит в
два этапа. В первый этап входит транскрипция и процессинг РНК, второй этап включает трансляцию. Во время транскрипции фермент РНК-полимераза синтезирует молекулу РНК, комплементарную последовательности соответствующего гена (участка ДНК). Терминатор в последовательности нуклеотидов ДНК определяет, в какой момент транскрипция прекратится. В ходе ряда последовательных стадий процессинга из мРНК удаляются некоторые фрагменты, и редко происходит редактирование нуклеотидных последовательностей. После синтеза РНК на матрице ДНК происходит транспортировка молекул РНК в цитоплазму. В процессе трансляции информация, записанная в последовательности нуклеотидов переводится в последовательность остатков аминокислот.ф
Биосинтез Белков и Нуклеиновых Кислот.
Слайд 21Молекулярные основы репликации и репарации ДНК.
Репликация – самоудвоение структурного материала
в пределах одного типа нуклеиновых кислот, т.е. синтез ДНК.
Для репликации
ДНК необходим ряд условий:
наличие структурного материала для сборки новых цепей ДНК
Расплетенные полинуклеотидные цепи ДНК.
РНК-затравка (праймер)
Ферменты.
Суммарно процесс синтеза ДНК можно представить следующей схемой:
M(d АТФ+dТТФ) + n(dГТФ + dЦТФ) ------- ДНК + (m + n) H4P2O7
В ходе репликации самопроизвольно или под действием различных внешних факторов могут совершаться ошибки, приводящие к изменению нуклеотидного состава и их последовательности соединения в ДНК. Нарушение процесса репарации может привести к мутациям, к нарушению процесса сохранения ген. информации.
Слайд 23Важнейшими особенностями этой многоступенчатой реакции является:
1-В ходе синтеза ДНК
трифосфорные эфиры дезоксирибонулеозидов служат одновременно источниками энергии, освобождаемой при отщеплении
пирофосфата.
2-Реакция идет в присутствии ДНК-матрицы.
3.Все вновь синтезируемые молекулы ДНК имеют структуру, идентичную первичной структуре ДНК-матрицы.
Удвоение ДНК происходит вследствие того, что цепи расходятся, а потом каждая цепь служит матрицей, на которой собирается комплементарная ей новая цепь ДНК.
В результате образуются две дочерние, двуспиральные, неотличимые по строению от родительской ДНК молекулы.
Каждая из них состоит из одной цепи исходной родительской молекулы ДНК и одной вновь синтезированной цепи.
Слайд 25Транскрипция.
- копирование ген.информации, заключенной в генах молекулы ДНК с образованием
молекул мРНК.
Транскрипцмия идет в 3 фазы:
1. Фаза инициации: зависимая РНК-полимераза
присоединяется к промоторному гену оперона. Различают 3 вида РНК-полимеразы (1, 2, 3). 1 ответственна за транскрипцию рРНК, 2 за синтез тРНК, а 3 участвует в синтезе мРНК. Связывание РНК-полимеразы с промотором приводит к локальному расхождению нуклеотидных цепей в этом участке гена. Одна из цепей служит матрицей. Первой, исходной реакцией синтеза РНК является реакция присоединения АТФ или ГТФ соответствубющего второго рибонуклеотид трифосфата. При этом образуется динуклеотид.
Слайд 262. Фаза элонгации – наращивание полинуклеотидной цепи РНК. В результате
перемещения РНК-полимеразы вдоль ДНК путем присоединения очередного рибонуклеотида. Идет наращивание
полинуклеотидной цепи синтезируемой молекулы РНК. Скорость элонгации 40-50 нуклеотидов в сек, что в 30 раз медленнее скорости репликации ДНК.
3. Фаза терминации (завершение) происходит после достижения РНК-полимеразой терминирующих кодонов, являющихся стоп-сигналам. Одновременно спец.белок обрабатывает транскрипцию, взаимодействуя с терминирующими кодонами. Благодаря этому формируется определенной длины молекулы РНК. Первичные продукты транскрипции являются полными копиями структурных генов ДНК, но в них имеются информативные и неинформативные участки. Поэтому первичный транскрипт называют РНК-предшественниками. В ядре они проходят стадию пост транскрипционного созревания или процессинга. В ходе процессинга удаляются неинформативные участки в пре-РНК и образуются функцонально зрелые молекулы РНК.
Слайд 27Процессинг включает три операции:
Вырезание неинформативных участков из пре-РНК
Сращивание информативных
участков генов – сплайсинг
Модификация 5 ‘и 3’ –концевых участков РНК.
Процессинг
РНК
Между транскрипцией и трансляцией молекула мРНК претерпевает ряд последовательных изменений, которые обеспечивают созревание функционирующей матрицы для синтеза полипептидной цепочки. К 5΄-концу присоединяется кэп, а к 3΄-концу поли-А хвост, который увеличивает длительность жизни иРНК. С появлением процессинга в эукариотической клетке стало возможно комбинирование экзонов гена для получения большего разнообразия белков, кодируемым единой последовательностью нуклеотидов ДНК, — альтернативный сплайсинг.
Слайд 28Трансляция.
- Перевод с «языка « нуклеотидной последовательности на «язык»» полипептидной
цепи, т.е. синтез белка.
В процессе трансляции можно выделить 2 этапа
– рекогниция или узнавание аминокислот, протекающий в гиалоплазме, и синтез белка на рибосомах.
Весь процесс синтеза белка можно разделить на 3 фазы: инициации (начало), элонгации (удлинение полипептидной цепи), терминации (окончание синтеза).
Для обеспечения биосинтеза необходимы: мРНК, аминоацил-тРНК, факторы инициации, инициирующие аминоацил-тРНК, фермент пептидилтрансфераза, ГТФ, факторы терминации и рибоомы.
Слайд 291. Фаза инициации: биосинтез начинается с появлением в цитозоле мРНК,
которая образует комплекс с малой субьединицей рибосом, в пределах инициирующего
кодона. Этому кодону соответствует антикодон met-тРНК. Одновременно met-тРНК образует комплекс с ГТФ и фактором инициации F2 и этот комплекс в присутствии фактора инициации F1 присоединяется к малой субъединице рибосомы. После образования такого комплекса малая субьеденица рибосом – ГТФ, фактор Ф3 освобождаются. Далее к малой субьеденице рибосом присоединяются большая субьединица. Сборка рибосом завершается формированием в большой субьеденице двух активных центров: Р-центр и А-центр 9он остается свободным). На этом данная фаза заканчивается.
Фаза инициации.
Слайд 30
В присутствии фактора элонгации ЕF1 и за счет энергии гидролиза
ГТФ в свободный А-центр комплиментарно кодону мРНК встраивается соответствующая аминоацил-тРНК.
Под воздействием пептидилтрансферазы остаток метионина с met-тРНК Р-центра переносится к аминогруппе аминокислоты находящейся в А-центре в составе аминоацил-тРНК.
В результате в А-центре образуется дипептидил т-РНК. тРНК оставшаяся в Р-центре высвобождается.
Под воздействием вне рибосомального фактора элонгации ЕF2 и энергии гидролиза 2-х молекул ГТФ рибосома сдвигается в сторону локализации дипептидил-тРНК.
В результате транслокации рибосомы относительно мРНК, дипептидил-тРНК оказывается в Р-центре, а на уровне сводобного А-центра обнажается новый кодон (триплет), к которому по правилу комплиментарности своим антикодоном присоединяется соответствующая аминоацил-тРНК.
Далее цикл повторяется.
Фаза элонгации.
Слайд 31
Синтез полипептидной цепи продолжается до тех пор, пока на пути
рибосом не встретится один из терминирующих триплетов ("бессмысленных" кодонов) мРНК
- УАА, УАГ или УГА.
В области этих триплетов при участии внерибосомальных белков- факторов терминации (F1,F2) - происходит гидролитическое расщепление связи между синтезированным пептидом и последней молекулой тРНК, и от рибосомы отделяется полипептидная цепь,
которая по мере ее нарастания приобретает вторичную и третичную структуры.
Фаза терминации.
Слайд 32Заключение.
В основе жизни лежит деление клеток организма. Вся информация о
человеке хранится в хромосомах, основными элементами которых являются ДНК.
Перенос генетической
информации, заложенной в ДНК хромосом является уникальным свойством живых организмов и осуществляется, согласно основному постулату молекулярной генетики, тремя основными механизмами:
Репликацией (самоудвоением заложенной в ДНК хромосом, т.е. синтезом ДНК),
Транскрипцией, т.е. переписыванием структуры ДНК на РНК, т.е. синтез РНК,
Трансляцией, т.е. синтезом белка.
Слайд 33Список литературы:
Бартон Д., Оллис У. Д. Общая органическая химия. — М.: Химия, 1986. —
Т. 10. — С. 32—215. — 704 с.
Франк-Каменецкий М. Д. Самая главная молекула. — М.: Наука, 1983. — 160 с.
Тапбергенов
С.О. Медицинская биохимия.- Астана, 2001.
Тапбергенов С.О, Тапбергенов Т.С. Медицинская и клиническая биохимия. Павлодар,2004.
Информационный сайт http://www.xumuk.ru/biologhim/022.html
Информационный сайт http://ru.wikipedia.org/wiki/