Разделы презентаций


ПЕРВИЧНАЯ СТРУКТУРА БЕЛКА

Содержание

ПЕРВИЧНАЯ СТРУКТУРА БЕЛКА

Слайды и текст этой презентации

Слайд 1ПРОСТРАНСТВЕННАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ БЕЛКА

ПРОСТРАНСТВЕННАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ БЕЛКА

Слайд 2ПЕРВИЧНАЯ СТРУКТУРА БЕЛКА

ПЕРВИЧНАЯ СТРУКТУРА БЕЛКА

Слайд 4
БЕЛКИ – БИОПОЛИМЕРЫ, МОНОМЕРАМИ КОТОРЫХ ЯВЛЯЮТСЯ АМИНОКИСЛОТЫ.
РАЗЛИЧАЮТ L и

D формы аминокислот
БЕЛКИ СОСТОЯТ ТОЛЬКО ИЗ L АМИНОКИСЛОТ

БЕЛКИ – БИОПОЛИМЕРЫ, МОНОМЕРАМИ КОТОРЫХ ЯВЛЯЮТСЯ АМИНОКИСЛОТЫ. РАЗЛИЧАЮТ L и D формы аминокислотБЕЛКИ СОСТОЯТ ТОЛЬКО ИЗ L

Слайд 5
АМИНОКИСЛОТЫ, ВХОДЯЩИЕ В СОСТАВ БЕЛКА

АМИНОКИСЛОТЫ, ВХОДЯЩИЕ В СОСТАВ БЕЛКА

Слайд 6АМИНОКИСЛОТЫ, ВХОДЯЩИЕ В СОСТАВ БЕЛКА

АМИНОКИСЛОТЫ, ВХОДЯЩИЕ В СОСТАВ БЕЛКА

Слайд 7ОБРАЗОВАНИЕ ПЕПТИДНОЙ СВЯЗИ
α
α
α
ПЕПТИДНАЯ ГРУППА

ОБРАЗОВАНИЕ ПЕПТИДНОЙ СВЯЗИαααПЕПТИДНАЯ ГРУППА

Слайд 9ПЕРВИЧНАЯ СТРУКТУРА БЕЛКА

ПЕРВИЧНАЯ СТРУКТУРА БЕЛКА

Слайд 10ОДИНАРНАЯ СВЯЗЬ ДВОЙНАЯ СВЯЗЬ


ОДИНАРНАЯ СВЯЗЬ		ДВОЙНАЯ СВЯЗЬ

Слайд 11ПЛОСКАЯ ФОРМА ПЕПТИДНОЙ ГРУППЫ
ОБЕСПЕЧИВАЕТСЯ SP2-ГИБРИДИЗАЦИЕЙ ЭЛЕКТРОНОВ N И C

SP2-

ОРБИТЫ ВОВЛЕКАЮТ АТОМ В ТРИ КОВАЛЕНТНЫЕ СВЯЗИ, ЛЕЖАЩИЕ В ОДНОЙ

ПЛОСКОСТИ



ПЛОСКАЯ ФОРМА ПЕПТИДНОЙ ГРУППЫ ОБЕСПЕЧИВАЕТСЯ SP2-ГИБРИДИЗАЦИЕЙ ЭЛЕКТРОНОВ N И CSP2- ОРБИТЫ ВОВЛЕКАЮТ АТОМ В ТРИ КОВАЛЕНТНЫЕ СВЯЗИ,

Слайд 12ДЕЛОКАЛИЗАЦИЯ π-ЭЛЕКТРОНОВ В ПЕПТИДНОЙ СВЯЗИ

ЭЛЕКТРОНЫ АТОМОВ С И N СОЗДАЮТ

«ДЕЛОКАЛИЗОВАННОЕ » ЭЛЕКТРОННОЕ ОБЛАКО, КОТОРОЕ ОХВАТЫВАЕТ ОБА ЭТИ АТОМА И

РАСПРОСТРАНЯЮЩЕЕСЯ НА АТОМ О ЧЕРЕЗ СВЯЗЬ С=О.
ОБОБЩЕСТВЛЕННЫЕ ЭЛЕКТРОНЫ ПРЕПЯТСТВУЮТ ВРАЩЕНИЮ ВОКРУГ C-N СВЯЗИ
ДЕЛОКАЛИЗАЦИЯ π-ЭЛЕКТРОНОВ В ПЕПТИДНОЙ СВЯЗИЭЛЕКТРОНЫ АТОМОВ С И N СОЗДАЮТ «ДЕЛОКАЛИЗОВАННОЕ » ЭЛЕКТРОННОЕ ОБЛАКО, КОТОРОЕ ОХВАТЫВАЕТ ОБА

Слайд 13ДЕЛОКАЛИЗАЦИЯ π-ЭЛЕКТРОНОВ

ДЕЛОКАЛИЗАЦИЯ π-ЭЛЕКТРОНОВ

Слайд 14ПРИ ДЕЛОКАЛИЗАЦИИ ЭНЕРГИЯ ЭЛЕКТРОНОВ
ПАДАЕТ И ОНИ ПЕРЕХОДЯТ В БОЛЕЕ


СТАБИЛЬНОЕ СОСТОЯНИЕ

ПРИ ДЕЛОКАЛИЗАЦИИ ЭНЕРГИЯ ЭЛЕКТРОНОВ ПАДАЕТ И ОНИ ПЕРЕХОДЯТ В БОЛЕЕ СТАБИЛЬНОЕ СОСТОЯНИЕ

Слайд 15ДЛИНЫ СВЯЗЕЙ
N – C (ПЕПТИДНАЯ СВЯЗЬ) 0,132 НМ
N – C

(ОДИНОЧНАЯ) 0,147 НМ
N

= C (ДВОЙНАЯ) 0,125 НМ
0,147 < 0,132 < 0,125
ПЕПТИДНАЯ СВЯЗЬ ЗАНИМАЕТ ПРОМЕЖУТОЧНОЕ ПОЛОЖЕНИЕ
ДЛИНЫ СВЯЗЕЙN – C (ПЕПТИДНАЯ СВЯЗЬ) 0,132 НМN – C (ОДИНОЧНАЯ)

Слайд 16ДЛИНЫ СВЯЗЕЙ В ПЕПТИДНОЙ ГРУППЕ

ДЛИНЫ СВЯЗЕЙ В ПЕПТИДНОЙ ГРУППЕ

Слайд 17ВАЛЕНТНЫЕ УГЛЫ СОСТАВЛЯЮТ ОКОЛО 120о И 109о
120о - ПРИ SP2-ГИБРИДИЗИРОВАННЫХ

ОРБИТАЛЯХ -С

ВЕРШИНАМ ПЛОСКОГО ТРЕУГОЛЬНИКА
109о - ПРИ SP3-ГИБРИДИЗИРОВАННЫХ АТОМАХ >Сα< , ГДЕ ЧЕТЫРЕ СВЯЗИ НАПРАВЛЕНЫ ИЗ ЦЕНТРА К ВЕРШИНАМ ТЕТРАЭДРА.
ВАЛЕНТНЫЕ УГЛЫ СОСТАВЛЯЮТ ОКОЛО 120о И 109о120о - ПРИ SP2-ГИБРИДИЗИРОВАННЫХ ОРБИТАЛЯХ -С

Слайд 18ПРИ КОМНАТНОЙ ТЕМПЕРАТУРЕ ВАЛЕНТНЫЕ СВЯЗИ НЕ ФЛУКТУИРУЮТ:
ЧАСТОТА КОЛЕБАНИЙ ЭТИХ

СВЯЗЕЙ 2х1013 сек –1
ЧАСТОТА ТЕПЛОВЫХ КОЛЕБАНИЙ 7х1012 сек –1

АМПЛИТУДА ТЕПЛОВЫХ

КОЛЕБАНИЙ ВАЛЕНТНЫХ УГЛОВ НЕВЕЛИКА И СОСТАВЛЯЕТ ОКОЛО 5о.
ТАКИМ ОБРАЗОМ, ГИБКОСТЬ ПОЛИПЕПТИДНОЙ ЦЕПИ ОБЕСПЕЧИВАЕТСЯ ДРУГИМИ ФАКТОРАМИ.
ПРИ КОМНАТНОЙ ТЕМПЕРАТУРЕ ВАЛЕНТНЫЕ СВЯЗИ НЕ ФЛУКТУИРУЮТ: ЧАСТОТА КОЛЕБАНИЙ ЭТИХ СВЯЗЕЙ 2х1013 сек –1ЧАСТОТА ТЕПЛОВЫХ КОЛЕБАНИЙ 7х1012

Слайд 19ГИБКОСТЬ ПОЛИПЕПТИДНОЙ ЦЕПИ, А, ЗНАЧИТ, И
ЕЕ СПОСОБНОСТЬ ОБРАЗОВЫВАТЬ СПИРАЛИ

И
ГЛОБУЛЫ ОБЕСПЕЧИВАЕТ ВРАЩЕНИЕ ВОКРУГ
ВАЛЕНТНЫХ СВЯЗЕЙ.

ГИБКОСТЬ ПОЛИПЕПТИДНОЙ ЦЕПИ, А, ЗНАЧИТ, И ЕЕ СПОСОБНОСТЬ ОБРАЗОВЫВАТЬ СПИРАЛИ И ГЛОБУЛЫ ОБЕСПЕЧИВАЕТ ВРАЩЕНИЕ ВОКРУГ ВАЛЕНТНЫХ СВЯЗЕЙ.

Слайд 20
Отсчет величины угла поворота:
вид поперек (слева) и вдоль (справа)

оси вращения.
Дальняя от нас валентная связь 0''— c   —  

"ось координатного круга",
центральная связь 0'— 0''   —   "ось вращения",
ближняя к нам связь 0'— a   —   "стрелка на координатном круге".
Отсчет величины угла поворота: вид поперек (слева) и вдоль (справа) оси вращения. Дальняя от нас валентная связь

Слайд 21

УГОЛ ϕ ОПИСЫВАЕТ ВРАЩЕНИЕ ВОКРУГ СВЯЗИ N – C α
УГОЛ

ψ ОПИСЫВАЕТ ВРАЩЕНИЕ ВОКРУГ СВЯЗИ C α – C
УГОЛ

ω ОПИСЫВАЕТ ВРАЩЕНИЕ ВОКРУГ СВЯЗИ C - N
χ- УГОЛ ВРАЩЕНИЯ В БОКОВОЙ ЦЕПИ

ϕ

ω

ψ

χ





УГОЛ ϕ ОПИСЫВАЕТ ВРАЩЕНИЕ ВОКРУГ СВЯЗИ N – C αУГОЛ ψ ОПИСЫВАЕТ ВРАЩЕНИЕ ВОКРУГ СВЯЗИ C α

Слайд 22ПОВОРОТ ВОКРУГ СВЯЗИ С-N (УГОЛ ω) МАЛОВЕРОЯТЕН ИЗ-ЗА ЕЕ ЧАСТИЧНО

ДВОЙНОГО ХАРАКТЕРА.
ЗАТО ВОЗМОЖНЫ ПОВОРОТЫ ВОКРУГ ОДИНАРНЫХ СВЯЗЕЙ Cα-C (УГОЛ ψ)

И C α -N (УГОЛ ϕ)

ЕА ДЛЯ УГЛОВ ϕ И ψ ОТ 0,84 ДО 2,52 кДж/моль, ДЛЯ ПЕПТИДНОЙ СВЯЗИ 84 кДж/моль

ПОВОРОТ ВОКРУГ СВЯЗИ С-N (УГОЛ ω) МАЛОВЕРОЯТЕН ИЗ-ЗА ЕЕ ЧАСТИЧНО ДВОЙНОГО ХАРАКТЕРА.ЗАТО ВОЗМОЖНЫ ПОВОРОТЫ ВОКРУГ ОДИНАРНЫХ СВЯЗЕЙ

Слайд 24ВТОРИЧНАЯ СТРУКТУРА БЕЛКА

ВТОРИЧНАЯ СТРУКТУРА БЕЛКА

Слайд 25

ГЛОБУЛА

ГЛОБУЛА

Слайд 26НАИБОЛЕЕ ВАЖНЫМИ ДЛЯ ВТОРИЧНОЙ
СТРУКТУРЫ БЕЛКА ЯВЛЯЮТСЯ ВОДОРОДНЫЕ
СВЯЗИ
Водородные связи

параллельны оси спирали
Водородные связи перпендикулярны оси спирали
β-СКЛАДЧАТАЯ СТРУКТУРА
α-СПИРАЛЬ

НАИБОЛЕЕ ВАЖНЫМИ ДЛЯ ВТОРИЧНОЙ СТРУКТУРЫ БЕЛКА ЯВЛЯЮТСЯ ВОДОРОДНЫЕ СВЯЗИВодородные связи параллельны оси спиралиВодородные связи перпендикулярны оси спиралиβ-СКЛАДЧАТАЯ

Слайд 27
ВОДОРОДНЫЕ СВЯЗИ В БЕЛКОВОЙ МОЛЕКУЛЕ

ВОДОРОДНЫЕ СВЯЗИ В БЕЛКОВОЙ МОЛЕКУЛЕ

Слайд 28
-спираль может быть правозакрученной (ϕ=132о, ψ=123о) и левозакрученной (ϕ =228о, ψ=237о).

ПРАВЫЕ
ЛЕВЫЕ

-спираль может быть правозакрученной (ϕ=132о, ψ=123о) и левозакрученной (ϕ =228о, ψ=237о). ПРАВЫЕЛЕВЫЕ

Слайд 29
Правая α-спираль.
(а) Атомарная структура. R  —  боковые группы. Голубые

линии  —   водородные связи.
(б) Схематическое изображение одного витка той

же α-спирали, вид с торца. Стрелка показывает поворот спирали (в расчете на один остаток) по мере ее приближения к нам.
Правая α-спираль. (а) Атомарная структура. R  —  боковые группы. Голубые линии  —   водородные связи. (б) Схематическое изображение

Слайд 30Водородные связи в α спирали
параллельны оси спирали
образуются между первым

и четвертым аминокислотными остатками

Водородные связи в α спирали параллельны оси спиралиобразуются между первым и четвертым аминокислотными остатками

Слайд 31НА КАЖДЫЙ ВИТОК (ШАГ) СПИРАЛИ ПРИХОДИТСЯ 3,6 АМИНОКИСЛОТНЫХ ОСТАТКОВ.
ШАГ СПИРАЛИ

(РАССТОЯНИЕ ВДОЛЬ ОСИ) – 0,54 НМ.
НА ОДИН АМИНОКИСЛОТНЫЙ ОСТАТОК ПРИХОДИТСЯ

0,15 НМ.
ЧЕРЕЗ 5 ВИТКОВ СПИРАЛИ (18 АМИНОКИСЛОТНЫХ ОСТАТКОВ) СТРУКТУРНАЯ КОНФИГУРАЦИЯ ПОЛИПЕПТИДНОЙ ЦЕПИ ПОВТОРЯЕТСЯ

ПАРАМЕТРЫ α-СПИРАЛИ

НА КАЖДЫЙ ВИТОК (ШАГ) СПИРАЛИ ПРИХОДИТСЯ 3,6 АМИНОКИСЛОТНЫХ ОСТАТКОВ.ШАГ СПИРАЛИ (РАССТОЯНИЕ ВДОЛЬ ОСИ) – 0,54 НМ.НА ОДИН

Слайд 32ПОСТУЛАТЫ ПОЛИНГА – КОРИ
Длины связей и валентных углов всех пептидных

групп одинаковы
Полипептидная цепь насыщена водородными связями
Конформационное состояние всех звеньев полипептидной

цепи является эквивалентным
ПОСТУЛАТЫ ПОЛИНГА – КОРИДлины связей и валентных углов всех пептидных групп одинаковыПолипептидная цепь насыщена водородными связямиКонформационное состояние

Слайд 33Некоторые остатки аминокислот могут нарушать формирование α-спирали.
ПРОЛИН
Его атом азота входит

в состав жёсткого кольца, что исключает возможность вращения вокруг -N-CH-

связи.

Пролин не способен образовать водородную связь в данном месте пептидного остова, и α-спиральная структура нарушается. Обычно в этом месте пептидной цепи возникает петля или изгиб.


Некоторые остатки аминокислот могут нарушать формирование α-спирали.ПРОЛИНЕго атом азота входит в состав жёсткого кольца, что исключает возможность

Слайд 34участки, где последовательно расположены несколько одинаково заряженных радикалов, между которыми

возникают электростатические силы отталкивания
участки с близко расположенными объёмными радикалами, механически

нарушающими формирование α-спирали, например метионин, триптофан
участки, где последовательно расположены несколько одинаково заряженных радикалов, между которыми возникают электростатические силы отталкиванияучастки с близко расположенными

Слайд 35β -складчатые структуры

β -складчатые структуры

Слайд 36β -формы бывают параллельные, антипараллельные и смешанные.

β -складчатые структуры

β -формы бывают параллельные, антипараллельные и смешанные. β -складчатые структуры

Слайд 37АНТИПАРАЛЛЕЛЬНЫЕ И ПАРАЛЛЕЛЬНЫЕ β-СКЛАДЧАТЫЕ СТРУКТУРЫ

АНТИПАРАЛЛЕЛЬНЫЕ И ПАРАЛЛЕЛЬНЫЕ β-СКЛАДЧАТЫЕ СТРУКТУРЫ

Слайд 38
β-СКЛАДЧАТАЯ СТРУКТУРА
Водородные связи перпендикулярны оси спирали

β-СКЛАДЧАТАЯ СТРУКТУРАВодородные связи перпендикулярны оси спирали

Слайд 39
ИМЕЮТСЯ СПИРАЛИ И БЕЗ ВОДОРОДНЫХ СВЯЗЕЙ,
КОТОРЫЕ СУЩЕСТВУЮТ ЗА СЧЕТ


ВАНДЕРВААЛЬСОВЫХ СИЛ.
ЭТО ПОЛИПРОЛИНОВАЯ
СПИРАЛЬ, КОТОРАЯ РЕАЛИЗУЕТСЯ В КОЛЛАГЕНЕ.

ИМЕЮТСЯ СПИРАЛИ И БЕЗ ВОДОРОДНЫХ СВЯЗЕЙ, КОТОРЫЕ СУЩЕСТВУЮТ ЗА СЧЕТ ВАНДЕРВААЛЬСОВЫХ СИЛ. ЭТО ПОЛИПРОЛИНОВАЯ СПИРАЛЬ, КОТОРАЯ РЕАЛИЗУЕТСЯ

Слайд 40Нерегулярные вторичные структуры
ТРИПСИН:
ПОЛИПЕПТИДНАЯ ЦЕПЬ СПИРАЛИЗОВАНА НА 30%
Области с

нерегулярной вторичной структурой, которые представлены петлеобразными и кольцеобразными структурами, имеющими

меньшую регулярность укладки, чем α-спиралъ и β-структура.

ГЕМОГЛОБИН:
ПОЛИПЕПТИДНЫЕ ЦЕПИ СПИРАЛИЗОВАНЫ НА 75%

Нерегулярные вторичные структуры ТРИПСИН: ПОЛИПЕПТИДНАЯ ЦЕПЬ СПИРАЛИЗОВАНА НА 30%Области с нерегулярной вторичной структурой, которые представлены петлеобразными и

Слайд 41ДРУГИЕ СПИРАЛЬНЫЕ КОНФОРМАЦИИ
СПИРАЛЬ 310
3 ОСТАТКА АМИНОКИСЛОТ НА ШАГ (ВИТОК)

СПИРАЛИ
РАДИУС 0,19 НМ
СПИРАЛЬ
4,4 ОСТАТКА НА ШАГ СПИРАЛИ
РАДИУС 0,28 НМ

ДРУГИЕ СПИРАЛЬНЫЕ КОНФОРМАЦИИСПИРАЛЬ 310 3 ОСТАТКА АМИНОКИСЛОТ НА ШАГ (ВИТОК) СПИРАЛИРАДИУС 0,19 НМСПИРАЛЬ4,4 ОСТАТКА НА ШАГ СПИРАЛИРАДИУС

Слайд 42СВЕРХВТОРИЧНЫЕ СТРУКТУРЫ

СВЕРХВТОРИЧНЫЕ СТРУКТУРЫ

Слайд 43СВЕРХВТОРИЧНЫЕ СТРУКТУРЫ –
ЭТО ТЕРМОДИНАМИЧЕСКИ ИЛИ КИНЕТИЧЕСКИ
СТАБИЛЬНЫЕ КОМПЛЕКСЫ α-СПИРАЛЕЙ

И
βСТРУКТУР, КОТОРЫЕ ФОРМИРУЮТСЯ ЗА
СЧЕТ МЕЖРАДИКАЛЬНЫХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЙ.

СВЕРХВТОРИЧНЫЕ СТРУКТУРЫ – ЭТО ТЕРМОДИНАМИЧЕСКИ ИЛИ КИНЕТИЧЕСКИ СТАБИЛЬНЫЕ КОМПЛЕКСЫ α-СПИРАЛЕЙ И βСТРУКТУР, КОТОРЫЕ ФОРМИРУЮТСЯ ЗА СЧЕТ МЕЖРАДИКАЛЬНЫХ

Слайд 441.Белки, в структуре которых обнаружены только α-спирали.
Миоглобин (А)

и гемоглобин (Б)
А
Б

1.Белки, в структуре которых обнаружены только α-спирали. Миоглобин (А)  и   гемоглобин (Б) АБ

Слайд 45Примеры суперспиралей
Легкий меромиозин и тропомиозин – 2 скрученные α-спирали

Примеры суперспиралейЛегкий меромиозин и тропомиозин – 2 скрученные α-спирали

Слайд 46СУПЕРСПИРАЛЬ, СОСТОЯЩАЯ ИЗ НЕСКОЛЬКИХ α-СПИРАЛЕЙ
В ПЕРЕВИТЫХ СПИРАЛЯХ ПЕРИОДИЧНОСТЬ 3,5 ОСТАТКОВ

НА ВИТОК (ВМЕСТО 3,6 В ОДИНОЧНОЙ α-СПИРАЛИ )

СУПЕРСПИРАЛЬ, СОСТОЯЩАЯ ИЗ НЕСКОЛЬКИХ α-СПИРАЛЕЙВ ПЕРЕВИТЫХ СПИРАЛЯХ ПЕРИОДИЧНОСТЬ 3,5 ОСТАТКОВ НА ВИТОК (ВМЕСТО 3,6 В ОДИНОЧНОЙ α-СПИРАЛИ

Слайд 47
Взаимодействие α-спиралей в двойной (а) и тройной (б) суперспирали (вид

с торца спирали). В двойной суперспирали непосредственно контактируют с другой

спиралью только остатки а и d, а в тройной  —  еще и остатки e и g (хотя и более слабо).





Взаимодействие α-спиралей в двойной (а) и тройной (б) суперспирали (вид с торца спирали). В двойной суперспирали непосредственно

Слайд 482. Белки с α-спиралями и β-структурами
Лактатдегидрогеназа (А) и фосфоглицераткиназа

(Б).

2. Белки с α-спиралями и β-структурами Лактатдегидрогеназа (А) и фосфоглицераткиназа (Б).

Слайд 493. Белки, имеющие только β-структуры.
Иммуноглобулин (А) фермент супероксиддисмутаза (Б)

3. Белки, имеющие только β-структуры. Иммуноглобулин (А) фермент супероксиддисмутаза (Б)

Слайд 504.Белки, имеющие в своём составе лишь незначительное количество регулярных вторичных

структур.
ТРИПСИН:
ПОЛИПЕПТИДНАЯ ЦЕПЬ СПИРАЛИЗОВАНА НА 30%

4.Белки, имеющие в своём составе лишь незначительное количество регулярных вторичных структур. ТРИПСИН: ПОЛИПЕПТИДНАЯ ЦЕПЬ СПИРАЛИЗОВАНА НА 30%

Обратная связь

Если не удалось найти и скачать доклад-презентацию, Вы можете заказать его на нашем сайте. Мы постараемся найти нужный Вам материал и отправим по электронной почте. Не стесняйтесь обращаться к нам, если у вас возникли вопросы или пожелания:

Email: Нажмите что бы посмотреть 

Что такое TheSlide.ru?

Это сайт презентации, докладов, проектов в PowerPoint. Здесь удобно  хранить и делиться своими презентациями с другими пользователями.


Для правообладателей

Яндекс.Метрика