Разделы презентаций
- Разное
- Английский язык
- Астрономия
- Алгебра
- Биология
- География
- Геометрия
- Детские презентации
- Информатика
- История
- Литература
- Математика
- Медицина
- Менеджмент
- Музыка
- МХК
- Немецкий язык
- ОБЖ
- Обществознание
- Окружающий мир
- Педагогика
- Русский язык
- Технология
- Физика
- Философия
- Химия
- Шаблоны, картинки для презентаций
- Экология
- Экономика
- Юриспруденция
Вводная лекция
Содержание
- 1. Вводная лекция
- 2. Вопросы:Какую научную работу написать?А что будет на кружке?
- 3. Наука
- 4. Секция устных докладовСекция мультимедийных постеровРеферативный докладDrug discovery pipelineКлинические Теоретические
- 5. Слайд 5
- 6. Слайд 6
- 7. Слайд 7
- 8. Слайд 8
- 9. Слайд 9
- 10. Клинические работы
- 11. Классическая работаИдея: Сравнение методов лечения. Препарат vs.
- 12. Этапы: 1. Сбор данных (Данные историй болезни,
- 13. Модели машинного обученияКлассификация Регрессия
- 14. Независимые переменныеЗависимая
- 15. Этапы: 1. Сбор данных (Данные историй болезни,
- 16. Теоретические работы
- 17. Теоретические работыСистематический обзор с выполнением мета-анализаIn silico drug design
- 18. Мета-анализ
- 19. Систематический обзор с выполнением мета-анализа Этапы: 1.
- 20. In silico drug designМодели машинного обученияПроект кружка
- 21. Модели машинного обученияQSAR = Q + SARSAR = structure–activity relationshipQ = Quantitative
- 22. Кружок
- 23. LigandTargetLigand basedTarget basedLigand + Target based
- 24. Выбираем “target” и “ligand”Строим модель фармакофораОтбираем молекулы,
- 25. Слайд 25
- 26. Находим свою мишень “Target”Therapeutic Target Database PDB
- 27. Chembl DBМой скриптTTD_modMEGA/TTD_mod
- 28. PDB (https://www.rcsb.org/)UniProt (https://www.uniprot.org/)ChEMBL (https://www.ebi.ac.uk/chembl/)
- 29. SMILES Simplified molecular-input line-entry system(Упрощенная система молекулярного ввода-вывода)
- 30. +
- 31. Спасибо за внимание!
- 32. Скачать презентанцию
Вопросы:Какую научную работу написать?А что будет на кружке?
Слайды и текст этой презентации
Слайд 4Секция устных докладов
Секция мультимедийных постеров
Реферативный доклад
Drug discovery pipeline
Клинические
Теоретические
Слайд 11Классическая работа
Идея: Сравнение методов лечения.
Препарат vs. Другой препарат,
Препарат
vs. Комбинация препаратов,
Слайд 12Этапы:
1. Сбор данных (Данные историй болезни, опрос пациентов)
2. Обработка
данных: разбиваем пациентов на две группы, считаем описательные статистики, проверяем
на нормальность.3. Анализ данных: считаем средние значения сравниваемых показателей, подтверждаем наличие/отсутствие различий (t-критерий Стьюдента, U-критерий Манна — Уитни)
4. Делаем выводы.
VS
Слайд 15Этапы:
1. Сбор данных (Данные историй болезни, опрос пациентов)
2. Обработка
данных: разбиваем данные на две части – тренировочную и тестовую.
3.
На тренировочных данных обучаем модель.4. На тестовых данных предсказываем значение зависимой переменной.
5. Оцениваем эффективность модели, делаем выводы.
Слайд 19Систематический обзор с выполнением мета-анализа
Этапы:
1. Поиск и отбор статей
по проблеме обзора
2. Отбор наиболее подходящих статей для включения в
обзор3. Выполнение мета-анализа
4. Оценка риска предвзятости (ROB 2.0)
5. Оценка качества доказательств (GRADE)
6. Выводы, оформление обзора
Слайд 21Модели машинного обучения
QSAR = Q + SAR
SAR = structure–activity relationship
Q
= Quantitative
Слайд 24Выбираем “target” и “ligand”
Строим модель фармакофора
Отбираем молекулы, которые в большей
степени подходят под структуру фармакофора
Фильтруем молекулы по ADME свойствам и
токсичностиМолекулярный докинг
Слайд 28PDB (https://www.rcsb.org/)
UniProt (https://www.uniprot.org/)
ChEMBL (https://www.ebi.ac.uk/chembl/)
Слайд 29SMILES
Simplified molecular-input line-entry system
(Упрощенная система молекулярного ввода-вывода)
