Лаборатория биофотоники ( К.А. Лукьянов ) Лаборатория методов

обратимо фотопереключаемые красные флуоресцентные белки на основе белка FusionRed. Флуоресценция

этих белков, rsFusionRed1, 2 и 3, может быть “выключена” и “включена” облучением оранжевым и зеленым светом, соответственно. Это позволяет избежать облучения фототоксичным фиолетовым и синим светом, обычно используемым для других фотопереключаемых белков. Благодаря высокой яркости, высокой фотостабильности, быстрому фотопереключению и низкой фототоксичности возбуждающего света белки rsFusionRed представляют собой прекрасные метки для наноскопии живых клеток.

ФОТОПЕРЕКЛЮЧАЕМЫЕ КРАСНЫЕ ФЛУОРЕСЦЕНТНЫЕ БЕЛКИ ДЛЯ НАНОСКОПИИ В ЖИВЫХ КЛЕТКАХ

Pennacchietti F и др. (2018) Fast reversibly photoswitching red fluorescent proteins for live-cell RESOLFT nanoscopy. Nat Methods IF 26.919

MV и др. (2018) Precise tracking of vaccine-responding T cell

clones reveals convergent and personalized response in identical twins. Proc Natl Acad Sci U S A IF 9.504
Bolotin DA и др. (2018) Reply to: Evaluation of immune repertoire inference methods from RNA-seq data. Nat Biotechnol
Fan X и др. (2018) CD49b defines functionally mature Treg cells that survey skin and vascular tissues. J Exp Med IF 10.79
Davydov AN и др. (2018) Comparative Analysis of B-Cell Receptor Repertoires Induced by Live Yellow Fever Vaccine in Young and Middle-Age Donors. Front Immunol IF 5.51
Hunter S и др. (2018) Human liver infiltrating γδ T cells are composed of clonally expanded circulating and tissue-resident populations. J Hepatol IF 14.911
Egorov ES и др. (2018) The changing landscape of naive T cell receptor repertoire with human aging. Front Immunol IF 5.51
Dolton G и др. (2018) Optimized peptide-MHC multimer protocols for detection and isolation of autoimmune T-cells. Front Immunol IF 5.51
Komech EA и др. (2018) CD8+T cells with characteristic T cell receptor beta motif are detected in blood and expanded in synovial fluid of ankylosing spondylitis patients. Rheumatology (Oxford) IF 5.5245
Davey MS и др. (2018) The human Vδ2+T-cell compartment comprises distinct innate-like Vγ9+and adaptive Vγ9-subsets. Nat Commun IF 12.353
Sycheva AL и др. (2018) Quantitative profiling reveals minor changes of T cell receptor repertoire in response to subunit inactivated influenza vaccine. Vaccine IF 3.285
Pogorelyy MV и др. (2018) Method for identification of condition-associated public antigen receptor sequences. Elife IF 7.616

Показано, что Т-клеточный иммунитет долгоживущего грызуна Spalax (слепушонок) с возрастом не накапливает крупных клональных экспансий, в отличие от человека и мыши.  

Также проведен ряд исследований Т- и В-клеточного адаптивного иммунитета человека и модельных животных,  в том числе по направлениям:
- возрастные изменения в В-клеточном ответе на вакцинацию   
- Т клеточный ответ на вакцинацию на близнецах
- экстракция репертуаров Т-клеточных рецепторов из данных RNA-Seq
- функциональные сабсеты регуляторных Т-лимфоцитов 
- память и специфичность адаптивного ответа гамма-дельта Т лимфоцитов  

КЛЕТОК ГЛИОБЛАСТОМЫ
M.S. Pavlyukov, Hai Yu, Soniya Bastola, et al. Apoptotic

cell-derived extracellular vesicles promote malignancy of glioblastoma via intercellular transfer of splicing factors. Cancer Cell. 2018, 34(1): 119-135 IF 22.844

Было показано, что под воздействием химио- и радиотерапии клетки глиобластомы секретируют мембранные пузырьки - везикулы, обогащённых различными компонентами сплайсосом. Эти везикулы изменяют тип сплайсинга РНК в реципиентных опухолевых клетках, таким образом, увеличивая их инвазивность, пролиферацию и устойчивость к терапии.

Рис. Модель, иллюстрирующая предполагаемую роль сплайсосомных белков в передаче сигнала от апоптотических к выжившим клеткам глиобластомы.