Регуляція ферментативної активності шляхом просторового роз ’ єднання

молекул.
2. Характер розподілу ферментативної активності серед олігомерних форм ферменту.

3. Вплив специфічних лігандів на положення рівноваги між олігомерними формами ферментів.
4. Динамічна мікрокомпартменталізація метаболітів.

асоціація, елементарною стадією якої є взаємодія 2-х ідентичних центрів асоціації,

розташованих на білкових субодиницях;
асоціація білкових субодиниць веде до утворення "замкнених" олігомерних структур.


Гетерологічна асоціація - тобто асоціація, елементарною стадією якої є взаємодія 2-х різнорідних центрів асоціації;
асоціація молекул ферменту супроводжується утворенням асоціатів необмеженої довжини.

Мi+ Mj <=> Mi+j (K = [Mi+j]/ [Mi][Mj]) – ідентичні при
утворенні контактів одного типу

масою 115 кД

глікогенфосфорилаза b з скелетних м'язів кроля
димер

тетрамер, молекулярна маса димеру 194,8 кД

"мономерна одиниця" - М у рівновазі М M2

M3, являє собою гексамер з молекулярною масою 312 кД
К не ідентичні!!!

активний димер а=v/ [E] – не є сталою при

зміні концентрації ферменту!!!

А- залежність питомої ферментативної активності NADP-залежної ізоцитратдегідрогенази із серця свині від концентрації ферменту, розрахованої на мономер [E]0; 0,1 мМ NADP; рН 7,4; 25 °С; [ Dl-ізоцитрат]: 1- 5мкм, 2- 10 мкм.
Б- лінійна анаморфоза

неактивний тетрамер
Н:глікогенфосфорилаза b з скелетних м'язів кроля

проходить через максимум з зростанням концентрації ферменту
Димерна форма неактивна,

а її асоціати проявляють каталітичну активність, яка, однак, знижується в міру збільшення розміру асоціатів

Залежність питомої ферментативної активності 6-фосфофруктокінази з еритроцитів людини від концентрації ферменту [E]0 у логарифмічних координатах. [ATP]: 1-0,01 мМ; 2- 0,02 мМ; 3- 0,05 мМ.
Розмірність а-мкм S/хв*мг білка

специфічних лігандів приводить до конформаційних змін білкової молекули, що стосуються

центрів асоціації, відповідальних за білок-білкові взаємодії.
Н: асоціація димерів глікогенфосфорилази b у тетрамери під дією АМР
центри зв'язування специфічних лігандів розташовуються в зонах, що беруть участь у білок-білкових взаємодіях, і стерично екрануються при утворенні білкових асоціатів
Н: глікогенфосфорилаза b: амінокислотні залишки, що входять у центр запасання глікогену, залучаються в димер-димерні контакти в тетрамері. Тому тетрамер не здатний зв'язувати глікоген. В умовах існуючої рухомої рівноваги димер <=> тетрамер глікоген проявляє дисоціюючу дію.

ферментів.
А й Б - високий і низький рівні фруктозо-1,

6-біфосфату (Fru-1,6-P2). FBPаза - фруктозо-1, 6-біфосфатаза; PFK - 6-фосфофруктокіназа; ALD - фруктозобіфосфатальдолаза; GAPD - гліцеральдегідфосфатдегідрогеназа; Fru-6-P - фруктозо-6-фосфат; G-3-P - гліцеральдегід-3-фосфат; DHAP - діоксиацетонфосфат; GPD - d-гліцероілфосфат. .

структурами.
Адсорбційний механізм регуляції. Зміна властивостей ферменту.
Фізіологічні наслідки адсорбції

ферментів. Компартменталізація метаболітів.

може приводити до зміни їх каталітичних і регуляторних властивостей і,

отже, бути чинником, що регулює активність ферментів;
б) адсорбція ферментів може забезпечувати компартменталізацію метаболітів у поверхні, на якій адсорбовані ці ферменти;
в) адсорбовані ферменти можуть утворювати впорядковані мультиферментні структури (метаболони), завдяки чому з'являється можливість регулювати метаболічний процес як єдине ціле;
г) ферменти, адсорбовані на білкових порах мембран, можуть брати участь в активному транспорті метаболітів через мембрану;
д) адсорбовані ферменти більш стабільні, чим вільні ферменти й таким чином, адсорбція може служити фактором, що знижує швидкість деградації ферментів у клітині.

формою ферменту й адсорбованим ферментом;
2) зміна каталітичних характеристик ферменту

при адсорбції;
3) чутливість рухомої рівноваги між вільною й зв'язаною формами ферменту до присутності клітинних метаболітів

залежності швидкості ферментативної реакції, що каталізується вільною 6-фосфофруктокіназою (1) і

мембраноз’вязаним ферментом (2), від концентрації фруктозо-6-фосфату (1 мМ АТР);

б- залежності швидкості ферментативної реакції, що каталізується вільною 6-фосфофруктокіназою (1) і мембрано-зв'язаним ферментом (2), від концентрації АТР (0,2 мМ фруктозо-6-фосфат)

субклітинних структурах
зміна конформації білкової молекули
стеричне екранування активних або алостеричних центрів
зміна

мікрооточення молекули ферменту, що супроводжує перехід ферменту з вільного стану в адсорбований.

не зв'язує субстрат (n=4).

Е + А ЕА
при

оборотній адсорбції мономерного ферменту (n=1) можливе зниження чутливості швидкості ферментативної реакції до зміни концентрації субстрату

а- теоретична залежність відносної швидкості ферментативної реакції v/V від безрозмірної концентрації субстрату [S]0/Kм;
б- залежність порядку швидкості ферментативної реакції по субстрату (ns) від відношення v/V; пунктирна лінія відповідає випадку, коли виконується міхаелісова кінетика; K0[A]0 = 100; значення безрозмірної концентрації ферменту К0[E]0: 1- К0[E]0 → 0; 2- 40; 3- 80 і 4- 100

транспорте метаболитов через мембрану за счет энергии ферментативной реакции, катализирумой

ферментом. Возможно, подобным образом функционирует гексокиназа, адсорбированная на порине, встроенном во внешнюю мембрану митохондрий. Известно, что адсорбированная гексокиназа эффективно использует синтезируемый митохондриями АТР. Не исключено, что транспорт адениновых нуклеотидов через порин сопряжен с действием гексокиназы

метаболических процессов на уровне ферментов. У Надмолекулярных структур появляется новый,

иерархически более высокий регуляторный механизм. Важность изучения структурных уровней, соответствующих биомакромолекулам и надмолекулярным комплексам, состоит в том, что они играют роль стандартных блоков (транспортные, ферментные, сократительные, рецепторные, энергизирующие) в построении более высоких структурных уровней (клетка, орган, ткань, системы органов, организм), выполняющих более сложные функции и регулируемые с участием иерархически более важных регуляторных механизмов. В целом эволюция осуществляется с помощью комбинации одних и тех же универсальных блоков, что приводит к возникновению функциональных блоков более высокого ранга, которые обладают новыми, уникальными функциями.