Слайд 1ВИЧ. Лабораторная диагностика.
к.м.н. Давидович Наталия Валерьевна
кафедра клинической биохимии, микробиологии
и лабораторной диагностики Северного государственного медицинского университета (г. Архангельск)
Слайд 4Открытие ВИЧ
В 1981 году появились первые три научные статьи о необычных случаях развития пневмоцистной
пневмонии и саркомы Капоши у гомосексуальных мужчин
В июле 1982 года для обозначения этого состояния был предложен термин синдром приобретённого
иммунного дефицита (СПИД, AIDS)
Вирус иммунодефицита человека независимо открыли в 1983 году в двух лабораториях: в Институте Пастера во Франции под руководством Люка Монтанье и в Национальном институте рака в США под руководством Роберта Галло
В 2008 году Люк Монтанье и Франсуаза Барр-Синусси были удостоены Нобелевской премии в области физиологии или медицины «за открытие вируса иммунодефицита человека»
Слайд 5Открытие ВИЧ
Вирус иммунодефицита человека независимо открыли в 1983 году в двух лабораториях:
в Институте Пастера во Франции под руководством Люка Монтанье и в Национальном институте рака в США под руководством Роберта Галло: выделен
из лимфатического узла пациента с лимфаденопатией
В 2008 году Люк Монтанье и Франсуаза Барр-Синусси были удостоены Нобелевской премии в области физиологии или медицины «за открытие вируса иммунодефицита человека»
С помощью электронной микроскопии и анализа последовательностей ВИЧ - ретровирус из рода лентивирусов, вызывающий медленно прогрессирующее заболевание — ВИЧ-инфекцию.
Слайд 6Классификация семейства Retroviridae
Alpharetrovirus (вирусы лейкоза, саркомы птиц, саркомы Рауса кур)
Betaretrovirus
(вирус рака молочной железы мышей, эндогенный ретровирус человека, вирус обезьян
Мезон-Пфайзера)
Gammaretrovirus (вирусы саркомы и лейкемии мышей, кошек и приматов)
Deltaretrovirus (вирус лейкемии крупного рогатого скота, лимфотропные вирусы Т-клеток человека (HTLV-1,2)
Epsilonretrovirus (вирус саркомы кожи)
Lentivirus (вирус иммунодефицита человека (HIV), вирус Мэди/Висна)
Spumavirus (пенящие вирусы человека, бычий синцитиальный вирус)
Слайд 7Эпидемиология
В мире за всё время ВИЧ-инфекцией заболели 60 миллионов человек, из них:
25 миллионов умерли, а 35 миллионов живут с ВИЧ-инфекцией
В России
848 тысяч человек живут с ВИЧ-инфекцией, за период с 1986 по 2016 год умерло от разных причин 220 тысяч ВИЧ-инфицированных граждан России
В Архангельской области на 30 апреля 2016 года ВИЧ-инфекция выявлена у 1124 жителей. Число новых случаев ВИЧ-инфекции имеет тенденцию к росту: в 2014 году было зарегистрировано 109 случаев, а в 2015 году – уже 197.
Слайд 12Однако…
Нет специфического лечения (способного привести к полной гибели и элиминации
вируса)…
Нет специфической профилактической вакцины (для предотвращения первичного инфицирования)…
Появление резистентных к
лекарствам вирусов…
Высокая стоимость лечения…
СПИД становится пандемией XXI века («Третья мировая война»)…
Слайд 13Классификация ВИЧ
Предположительно возникли в результате независимой передачи людям SIV (вируса иммунодефицита обезьян) шимпанзе и мангабеев
ВИЧ
– 1 является наиболее распространённым и патогенным видом ВИЧ. Глобальная
эпидемия ВИЧ-инфекции главным образом обусловлена распространением ВИЧ-1. Группы M (main – 90%), N, O, P. Генотипы A (Россия*)B C D E ….(10) (gp120, gp41,gp160,p24)
ВИЧ – 2 менее патогенен и передаётся с меньшей вероятностью, чем ВИЧ-1, (gp140, gp36, gp10, p26)
Слайд 14Строение ВИЧ
Вирионы ВИЧ имеют вид сферических частиц, диаметр которых составляет около 100—120 нм.
Капсид зрелого
вириона, состоящий из примерно 2000 молекул белка р24, имеет форму
усечённого конуса.
Внутри капсида находится белково-нуклеиновый комплекс: две нити вирусной РНК, прочно связанные с белком нуклеокапсида p7, ферменты (обратная транскриптаза, протеаза, интеграза).
С капсидом также ассоциированы белки Nef и Vif. Внутри вириона (и, вероятнее всего, за пределами капсида) обнаружен белок Vpr.
С капсидом ВИЧ-1 (но не ВИЧ-2) связаны около 200 копий клеточного фермента пептидилпролилизомеразы A (циклофилин А), необходимого для сборки вириона
Слайд 15Строение ВИЧ
Капсид окружён оболочкой, образованной примерно 2000 молекул матриксного белка p17.
Матриксная
оболочка в свою очередь окружена двуслойной липидной мембраной, являющейся наружной оболочкой вируса. Она
образована молекулами фосфолипидов, захваченными вирусом во время его отпочковывания от клетки, в которой он сформировался.
В липидную мембрану встроены 72 гликопротеиновых комплекса Env, каждый из которых образован тремя молекулами трансмембранного гликопротеина gp41, служащего «якорем» комплекса, и тремя молекулами поверхностного гликопротеина gp120 (SU).
С помощью белка gp120 вирус присоединяется к рецептору CD4 и корецептору, находящимся на поверхности Т-лимфоцитов человека.
При формировании наружной оболочки вируса также происходит захват некоторого количества мембранных белков клетки, в том числе человеческих лейкоцитарных антигенов (HLA) классов I и II и молекул адгезии
Слайд 16Функции структурных белков ВИЧ-1
Слайд 17Геном и кодируемые белки
Генетический материал ВИЧ представлен двумя копиями положительно-смысловой
(+)РНК.
Геном ВИЧ-1 имеет длину 9000 нуклеотидов.
9 генов ВИЧ-1 кодируют, по крайней мере, 15 белков.
Ген pol кодирует ферменты: обратную транскриптазу (RT), интегразу (IN) и протеазу (PR). Ген gag кодирует полипротеин Gag/p55, расщепляемый вирусной протеазой до структурных белков p6, p7, p17, p24. Ген env кодирует белок gp160, расщепляемый клеточной эндопротеазой фурином на структурные белки gp41 и gp120. Другие шесть генов — tat, rev, nef, vif, vpr, vpu (vpx у ВИЧ-2) — кодируют белки, отвечающие за способность ВИЧ-1 инфицировать клетки и производить новые копии вируса.
Слайд 19Пути передачи ВИЧ
Контакт повреждённой или неповрежденной слизистой оболочки или повреждённой кожи здорового человека с
биологическими жидкостями заражённого человека: кровью, предсеменной жидкостью, спермой, секретом влагалища, грудным молоком.
Передача вируса может
происходить при незащищённом анальном, вагинальном или оральном сексе
Интранатальный, трансплацентарный
Слайд 20Выделение ВИЧ из биологических жидкостей
Слайд 21Устойчивость ВИЧ
ВИЧ слабоустойчив во внешней среде
Погибает при высушивании (99% за
24 часа)
При нагревании (56 ˚С – 30 минут)
При кипячении (гибнет
через 1 минуту)
При обработке 96% спиртом – через 1 минуту
При применении дез.средств (хлорамин, хлорная известь, перекись водорода) - через 3-5 минут
Слайд 22Течение болезни
В течении болезни выделяют три стадии: острую инфекцию, латентный
период и терминальную стадию (СПИД).
В ходе развития ВИЧ-инфекции у одного и того
же человека в результате мутаций возникают новые штаммы вируса, которые различаются по скорости воспроизведения и способности инфицировать.
Размножившись, вирусные частицы высвобождаются из поражённых клеток и внедряются в новые — цикл развития повторяется. Инфицированные вирусом Т-хелперы постепенно гибнут из-за разрушения вирусом, апоптоза или уничтожения Т-киллерами.
В процессе развития ВИЧ-инфекции количество Т-хелперов (CD4+-клеток) снижается настолько, что организм уже не может противостоять возбудителям оппортунистических инфекций, которые неопасны или мало опасны для здоровых людей с нормально функционирующей иммунной системой.
На терминальной стадии (СПИД), ослабленный организм поражают бактериальные, грибковые, вирусные и протозойные инфекции, а также опухоли.
В отсутствие антиретровирусной терапии смерть пациента наступает не в результате размножения вируса в CD4+-клетках, а по причине развития оппортунистических заболеваний (вторичных по отношению к ВИЧ-инфекции).
Слайд 23Динамика количества CD4+-лимфоцитов и копий РНК вируса за период от
момента инфицирования до терминальной стадии
---- количество CD4+лимфоцитов в 1 мкл
крови
---- количество копий РНК вируса в 1 мл плазмы крови
Слайд 24Первичное инфицирование
Взаимодействие вируса и дендритных клеток (CCR-5, DC-SIGN)
Доставка вируса в
лимфатические узлы
Активная репликация в лимфоидной ткани
Вирусемия и диссеминация вируса
Слайд 25Симптомы ВИЧ
50-90% случаев ВИЧ имеют симптомы
Возникновение симптомов через 5-30 дней
после инфицирования
Средняя продолжительность симптомов 10-14 дней
Слайд 27Тропизм ВИЧ
Т- и В- лимфоциты
Клетки моноцитарного ряда (макрофаги, лейкоциты, клетки
Лангерганса, дендритные клетки)
Клетки нервной ткани и др. клетки содержащие на
поверхности рецепторы CD4, с которыми взаимодействует белок gp120
Эпителиальные и эндотелиальные клетки (рН-независимое слияние оболочки вируса с клеточной мембраной и проникновение вируса в клетку)
Слайд 28Жизненный цикл ВИЧ
Вирионы ВИЧ проникают в кровеносную и лимфатическую систему организма и перемещаются по
организму в потоке крови и лимфы. Оказавшись рядом с CD4-клеткой, вирионы ВИЧ присоединяются к
рецептору CD4 на её плазматической мембране;
Слайд 29Проникновение в клетку и обратная транскрипция
Вирусный гликопротеин gp120 прочно связывает
рецептор CD4. В результате такого взаимодействия gp120 претерпевает конформационные изменения, которые позволяют
ему также связать молекулу корецептора CXCR4 или CCR5
Слайд 30Проникновение в клетку и обратная транскрипция
Вирусный белок gp41 проникает в мембрану
клетки и подвергается значительным конформационным изменениям, вследствие которых мембрана клетки и мембрана вириона ВИЧ сближаются друг с
другом и затем сливаются
После слияния мембран содержимое вириона проникает внутрь клетки. Внутри клетки вирусная РНК высвобождается из капсида. Затем под действием обратной транскриптазы происходит обратная транскрипция — процесс синтеза ДНК на основании информации в одноцепочечной геномной РНК вируса
Слайд 31Транспорт вирусной ДНК в ядро и интеграция в геном
После завершения
обратной транскрипции в CD4+-лимфоците вирусный геном представлен невстроенной ДНК. Для
встраивания вирусной ДНК в геном клетки-хозяина и для образования новых вирусов необходима активация T-лимфоцитов. Активация CD4+-лимфоцитов происходит при их контакте с антигенпредставляющими клетками в лимфоидной ткани. Наличие вирусов на поверхности фолликулярных дендритных клеток и присутствие провоспалительных цитокинов (ИЛ-1, ИЛ-6 и ФНОα) способствуют размножению ВИЧ в инфицированных клетках;
Синтезированная вирусная ДНК транспортируется внутрь ядра клетки в составе пре-интеграционного комплекса, в который также входят белки ВИЧ p17/MA, Nef и интеграза. Далее вирусная ДНК встраивается в хромосому активированного T-лимфоцита под действием интегразы
Слайд 32Транскрипция, сплайсинг, транспорт РНК из ядра в цитоплазму и трансляция
В
ядре клеточная РНК-полимераза синтезирует предшественник вирусных информационных РНК (мРНК), длина которого равна длине геномной
РНК ВИЧ-1
Предшественник мРНК подвергается сплайсингу, в результате которого образуются более 40 разных мРНК
На ранней стадии экспрессии генов, в отсутствие белка Rev, несплайсированная и неполностью сплайсированные РНК ВИЧ-1 нестабильны и быстро разрушаются в ядре. В то же время, полностью сплайсированные мРНК ВИЧ-1 являются стабильными и транспортируются из ядра в цитоплазму.
В цитоплазме с помощью рибосом происходит процесс трансляции — биосинтез белка из аминокислот по заданной матрице на основе генетической информации, содержащейся в мРНК.
Синтезированный в цитоплазме белок Rev транспортируется в ядро, где связывается с областью RRE несплайсированной и неполностью сплайсированных РНК, что стабилизирует эти РНК.
Слайд 33Сборка и отпочковывание вирионов
Геномная РНК вируса, а также вирусные белки
транспортируются к местам сборки вирионов — к мембране. Вирионы первоначально формируются
из полипротеинов-предшественников структурных белков и ферментов и на этой стадии не являются инфекционными
В ходе созревания вирусной частицы вирусная протеаза расщепляет белки-предшественники до функциональных компонентов
Новые вирусные частицы отпочковываются от поверхности клетки, захватывая часть её мембраны, и выходят в кровяное русло, а клетка хозяина, несущая рецептор CD4, погибает
Слайд 34Распространение по организму ВИЧ
Только что выделившийся из зараженного лимфоцита вирион ВИЧ в плазме
крови живёт в среднем около 8 часов
В период острой фазы ВИЧ-инфекции
отсутствие специфического иммунного ответа позволяет вирусу активно реплицироваться и достигать высоких концентраций в крови
Вирус заселяет органы лимфатической системы, CD4+-лимфоциты, макрофаги, а также другие клетки: альвеолярные макрофаги лёгких, клетки Лангерганса…
В лимфоидной ткани ВИЧ размножается на протяжении всего заболевания, поражая макрофаги, активированные и покоящиеся CD4+-лимфоциты и фолликулярные дендритные клетки
Основным клеточным резервуаром ВИЧ являются CD4+-Т-лимфоциты иммунологической памяти
Слайд 38Кишечник-ассоциированная лимфоидная ткань при СПИД
Слайд 39Лабораторная диагностика ВИЧ
ИФА: определение антител к белкам вируса
Вестерн-блот: реакция антител на белки
вируса
ПЦР с обратной транскрипцией: определение РНК вируса; определение вирусной нагрузки (подсчёт количества
копий РНК вируса в миллилитре плазмы крови)
Слайд 41Вестерн-блоттинг
Блоттинг – (Blot –пятно) основан на сочетании электрофореза и ИФА
или РИА
Антиген выделяют с помощью ЭФ в геле
Переносят на активированную
бумагу или нитроцеллюлозную мембрану и проявляют с помощью ИФА
Слайд 42Вестерн-блоттинг
На полоски наносят сыворотку больного
Отмывают
Наносят антисыворотку меченую ферментом
Добавляют хромоген
Изменение
окраски
Возможна радиография если добавляли сыворотку меченую радиоактивной меткой
Слайд 44Методы ПЦР- диагностики
c использованием метода электрофореза
c использованием флуоресцентной детекции качественный
анализ (Джин)
c использованием флуоресцентной детекции количественный анализ (ДТ-322, iQiCycler)
Слайд 45Особенности «флуоресцентной» ПЦР
Высокая чувствительность
Высокая специфичность
Универсальность
+
Решение проблемы контаминации
Возможность количественного анализа
Технологичность
Слайд 49Естественная устойчивость к ВИЧ
Проникновение вируса в клетку иммунной системы связано
с его взаимодействием с поверхностным рецептором, белком CCR5.
Делеция CCR5-дельта32 приводит к невосприимчивости её
носителя к ВИЧ.
Предполагается, что эта мутация возникла примерно 2500 лет назад и со временем распространилась в Европе. (к ВИЧ фактически устойчив в среднем 1 % жителей Европы, 10—15 % - частичную сопротивляемость)
Учёные Ливерпульского университета объясняют распространение мутации гена CCR5 тем, что она усиливает сопротивляемость к бубонной чуме.