Лекция 5 Нукл кислоты 2016

нуклеотиды.

обусловлено возможностью образования
водородных связей между остатками оснований в цепях нуклеиновых
кислот:

тимин – аденин, цитозин – гуанин в ДНК; урацил – аденин и
цитозин – гуанин в РНК. Урацил входит только в состав РНК, тимин – ДНК.

Эти гетероциклические соединения способны к лактим-лактамной таутомерии и таутомерии азолов.













Гетероциклы

имеют ароматический характер и плоское строение. Ароматичность гетероциклов является причиной их высокой термодинамической стабильности.

6-N- метиладенин и др.
В ДНК некоторых бактериофагов вместо цитозина

встречается 5- гидроксиметилцитозин и его
Гликозилированные производные:
-D-глюкопиранозил или - D-глюкопиранозил

В РНК редкие компоненты чаще всего
содержатся в тРНК.
Известны, например,
производные урацила:
3-метилурацил, 4-тиоурацил.

и 2-дезокси-D-рибоза в состав природных нуклеозидов входят в - фуранозной

форме. Гликозидная связь осуществляется между аномерным атомом углерода С-1 рибозы (или дезоксирибозы) и атомом азота N-1 пиримидинового и N-9 пуринового оснований.
Названия нуклеозидов строятся как для гликозидов, например -аденинрибофуранозид и т. п. Однако более употребительны названия, производимые от тривиального названия соответствую­щего нуклеинового основания с суффиксами -идин у пиримидиновых и -озин у пуриновых нуклеозидов.
цитидин: цитозин и рибоза;
дезоксицитидин: цитозин и дезоксирибоза;
аденозин: аденин и рибоза;
дезоксицитидин: аденин и дезоксирибоза и т.д.
Исключение составляет название тимидин (а не дезокситимидин), для дезоксирибозида тимина, входящего в состав ДНК. В редких случаях, когда тимин встречается в РНК, нуклеозид называется риботимидином.

нуклеозиды.
Например, инозин, который можно рассматривать как продукт
дезаминирования аденозина,

а также псевдоуридин,
который является не N-, а С-гликозидом, с чем связана
его высокая устойчивость к гидролизу.
Лекарственные средства нуклеиновой природы.
При лечении некоторых опухолевых заболеваний используют
синтетические производные пиримидинового и пуринового рядов,
по строению похожие на естественные метаболиты
(нуклеиновые основания), но не полностью им
идентичные, т.е. являющиеся антиметаболитами.
Например, 5-фторурацил выступает в роли антагониста
урацила и тимина, 6-меркаптопурин – аденина.
Конкурируя с метаболитами, они нарушают на разных этапах синтез нуклеиновых кислот в организме.
Нуклеозиды-антибиотики.
В клетках в свободном состоянии содержатся нуклеозиды, не являющиеся компонентами нуклеиновых кислот. Они обладают антибиотической активностью и приобретают все большее значение при лечении злокачественных образований. Нуклеозиды-антибиотики отличаются от обычных нуклеозидов некоторыми деталями строения либо углеводной части, либо гетероциклического основания.

гидроксил при С-5' или С-3' в остатке рибозы или дезоксирибозы

(атомы цикла азотистых оснований нумеруют обычными цифрами, пентозного цикла – цифрами со штрихом).
Нуклеотиды рассматривают и как эфиры нуклеозидов (фосфаты) и как кислоты (в связи с наличием остатка фосфорной кислоты).
За счет фосфатного остатка нуклеотиды проявляют свойства двухосновной кислоты и в физиологических условиях при рН  7 находятся в ионизированном состоянии.
Для нуклеотидов используют два вида названий. Одно включает наименование нуклеозида с указанием положения в нем фосфатного остатка (например, аденозин-3'-фосфат, ури-дин-5'-фосфат), другое строится с добавлением суффикса -овая кислота к названию остатка пиримидинового или пуринового оснований (например, 3'-адениловая или 5'-уридиловая кислота). По отношению к свободным нуклеотидам в биохимической литературе широко используются их названия как монофосфатов с отражением этого признака в сокращенном коде, например AMФ (аденозинмонофосфат) для аденозин-5'-фосфата и т.д.

количества энергии: 30 кДж/моль и более. 

структурой – последовательностью нуклеотидных остатков в составе полимерной цепи. Связи

в цепи формируются за счет этерификации группы ОН у атома С3 пентозы одного нуклеотида фосфатным остатком другого нуклеотида. Такую связь называют фосфодиэфирной.
В составе молекулы ДНК выделено значительно большее число нуклеотидных остатков, чем в молекуле РНК. Молекулярная масса ДНК порядка 10 млн; ДНК в условиях клетки нерастворима.

и нуклеотидная последовательность, т.е. порядок чередования нуклеотидных звеньев.
Устанавливают нуклеотидный

состав, исследуя продукты гидролитического расщепления нуклеиновых кислот.
ДНК и РНК различаются поведением в условиях щелочного и кислотного гидролиза. ДНК устойчивы к гидролизу в щелочной среде. РНК легко гидролизуются в мягких условиях в щелочной среде до нуклеотидов, которые в свою очередь способны в щелочной среде отщеплять остаток фосфорной кислоты с образованием нуклеозидов. Нуклеозиды в кислой среде гидролизуются до гетероциклических оснований и углеводов.
Химический гидролиз ДНК почти не применяют из-за осложнения его побочными процессами. Более предпочтителен ферментативный гидролиз под действием нуклеаз. Обычно для этой цели используют змеиный яд, в котором содержатся ферменты, расщепляющие фосфодиэфирные связи. Такие ферменты проявляют специфичность по отношению к разным типам нуклеиновых кислот.

цепи. Водородные связи образуются между аминогруппой одного основания карбонильной

группой другого, а также между амидным и иминным атомами азота.



































А-форма В-форма Z-форма В-форма

образуют спирализованные петли – «шпильки», за счёт водородных
связей между комплементарными

азотистыми основаниями.
Участки цепи РНК в таких спиральных
структурах антипараллельны, но не всегда полностью
комплементарны, в них встречаются неспаренные
нуклеотидные остатки или даже одноцепочечные
петли, не вписывающиеся в
двойную спираль. Наличие спирализованных
участков характерно для всех типов РНК.

Вторичная структура РНК

ядерными белками и на определенном этапе клеточного цикла приобретает форму

хромосом.