Слайд 1
МЗ РФ ВГМУ
2 высшее образование
«Молекулярно – генетические методы изучения
генетики человека
Проф Каредина В.С.
Слайд 2Методы изучения генетики человека
Клинико – генеалогический
Близнецовый
Популяционно – статистический
Цитогенетический
Метод генетики соматических
клеток
Биохимический метод
Молекулярно – генетические
Метод приемных детей
Антропометрический
Дерматоглифика
Слайд 3 Молекулярно – генетические методы.
Конечный итог молекулярно-генетических методов —
выявление изменений в определенных участках ДНК, гена или хромосомы. В
их основе лежат современные методики работы с ДНК или РНК. В 70-80 гг. в связи с прогрессом в молекулярной генетике и успехами в изучении генома человека молекулярно-генетический подход нашел широкое применение.
.
Слайд 4 Начальным этапом молекулярно-гене-тического анализа является получение образцов ДНК
или РНК. Для этого используют геномную ДНК (вся ДНК клетки)
или отдельные ее фрагменты. В последнем случае, чтобы получить достаточное количество таких фрагментов, необходимо, амплифицировать (размножить) их.
Для этого пользуются полимеразной цепной реакцией — быстрым методом ферментативной репликации определенного фрагмента ДНК. С его помощью можно амплифицировать любой участок ДНК, расположенный между двумя известными последовательностями.
Слайд 5Анализировать огромные молекулы ДНК в том виде, в котором они
существуют в клетке, невозможно. Поэтому прежде их необходимо разделить на
части, обработать разнообразными рестриктазами — бактериальными эндонуклеазами. Эти ферменты способны разрезать двойную спираль ДНК, причем места разрыва строго специфичны для данного образца. Расщепление ДНК рестриктазами дает характерный набор фрагментов (4-6 пар оснований), отличающихся по длине.
Слайд 6Фракционирование (т.е. разделение) фрагментов ДНК по размеру и длине проводится
с помощью электрофореза на поверхности агарозного или полиакриламид-ного геля. Под
действием электрического поля фрагменты ДНК начинают перемещаться вниз по гелю со скоростью, зависящей от их длины. (Чем короче фрагменты, тем быстрее они движутся). В результате каждый фрагмент ДНК занимает определенное положение в виде дискретной полосы в конкретном месте геля.
Слайд 7Длину каждого фрагмента можно определить путем сравнения расстояния, пройденного им
и стандартным (с известными размерами) отрезком ДНК.
Молекулярно -.генетическую диагностику наследственных
болезней используют и для изучения генома человека. Чтобы выявить необходимые для этого специфические фрагменты ДНК, используют блот-гибридизацию по Саузерну. Сущность этой методики кратко состоит в следующем: сначала осуществляют денатурацию ДНК с образованием одноцепочечных фрагментов, которые переносят на нитроцеллюлезный или нейлоновый фильтр в буферном растворе.
Слайд 8 Молекулярно - генетическую диагностику наследственных болезней используют и для
изучения генома человека. Чтобы выявить необходимые для этого специфические фрагменты
ДНК, используют блот-гибридизацию по Саузерну.
Сущность этой методики кратко состоит в следующем: сначала осуществляют денатурацию ДНК с образованием одноцепочечных фрагментов, которые переносят на нитроцеллюлезный или нейлоновый фильтр в буферном растворе.
Слайд 9Агарозный гель с фрагментами ДНК помещают на фильтровальную
бумагу, смоченную концентрированным
солевым раствором. На гель накладывают нитроцеллюлезный фильтр, а сверху помещают
сухую фильтровальную бумагу, в которую впитывается солевой раствор. ДНК переносится вместе с раствором, но задерживается фильтром и практически полностью оказывается на его поверхности. Затем одноцепочечные ДНК фиксируют на фильтре. Расположение фрагментов на фильтре точно соответствует их расположению в геле.
Слайд 10Чтобы выявить нужные фрагменты, проводят гибридизацию ДНК с радиактивным ДНК-зондом
или клонированным фрагментом ДНК. Нуклеотидная последовательность зонда должна быть полностью
или частично комплементарна изучаемому участку геномной ДНК.
Результат гибридизации комплементарных цепей радиоактивного ДНК-зонда и фрагмента ДНК обнаруживают с помощью радиоавтографии: каждая комплементарная зонду последовательность ДНК проявляется в виде радиоактивной полосы.
Слайд 11С помощью метода Саузерна можно составить рестрикционную карту генома в
участке исследуемого гена и установить, несет ли данный ген какие-либо
дефекты. Так, разработаны эффективные методы синтеза искусственных ДНК-зондов, которые используются в пренатальнои диагностике наследственных заболеваний. Для этого из эмбриональных клеток, содержащихся в амниотической жидкости плода, выделяют ДНК и гибридизируют ее с помощью Саузерн-блоттинга с радиоактивным ДНК-зондом.
Слайд 12 Аномальный эмбрион легко распознается, т.к. его ДНК будет гибридизоваться
только с ДНК-зондом, комплементарным мутантной последовательности.
В настоящее время имеются различные
методы выявления мутаций. Их делят на прямые и косвенные.
Прямая диагностика мутаций включает ряд методов:
1. Определение нуклеотидной последовательности (секвенирование), дающее возможность выявить замены оснований, делеции и вставки в изучаемом фрагменте.
Слайд 132. Выявление нарушения места рестрикции, с помощью блот-гибридизации по Саузерну. Около
50% нуклеотидных замен ведет к изменению сайта (места) рестрикции. Это
делает возможным выявить мутацию путем рестриктного анализа.
Проведение аллелоспецифической гибриди-зации с синтетическими зондами, что позволяет обнаружить мутации в геномной ДНК. Последовательность оснований в зонде может быть задана по дефектному или нормальному варианту гена. В обоих случаях зонд используется для гибридизации с фрагментами ДНК обследуемого индивида.
Слайд 14 Химическое и ферментативное расщепление ДНК в местах неправильной сшивки
оснований выявляет большую группу мутаций, ведущих к нестабильности ДНК. Метод
заключается в электрофорезе двух цепочечной ДНК в нейтральном или равномерно денатурирующем геле.
Регистрация изменения электрофоретической подвижности мутантных молекул ДНК.
Слайд 15 Трансляция белкового продукта осуществляется в системе in vitrо на
основе
получения специфической мРНК с добавлением лизата ретикулоцитов. Синтезируемый
белок анализируют с помощью электрофореза. Изменение подвижности белка указывает на наличие мутации.
Слайд 16 К косвенному выявлению мутаций прибегают в тех случаях, когда
нуклеотидная последовательность гена еще не расшифрована, но известно его положение
на генетической карте. Технические приемы такие же, как и в прямой диагностике, но добавляется математический анализ.
Диагностике мутаций способствует нахождение в геноме полиморфных по длине рестрикционных фрагментов. Их можно выявить с помощью блот-гибридизации по Саузерну.
Слайд 17 Другим типам полиморфизма ДНК являются микросателлиты. Это короткие моно-,
ди-, три- и тетрануклеотидные тандемно повторяющиеся последовательности ДНК. Они используются
в качестве маркерных локусов аллельных вариантов гена или маркеров дефектных мутаций..
Слайд 18 В 1993 г. был идентифицирован ген, ответственный за возникновение
тяжелого заболевания нервной системы у человека — хореи Гентингтона (ХГ).
Болезнь, проявляющаяся после 40 лет, выражается в расстройстве движений, снижении интеллекта, в нарушении эмоционально-волевой сферы и др. Этот недуг наследуется по аутосомно-доминантному типу со 100 % пенетрантностью. Ген локализован в коротком плече 4-й хромосомы.
Слайд 19 Оказалось, что ген ХГ содержит область, в которой нуклеотидная
последовательность представлена многократным повторением трех нуклеотидов — ЦАГ (цитозин-аденин-гуанин) геномной
ДНК. В норме количество таких повторов колеблется от 11 до 34, а у больных ХГ их 37-86 (в среднем 45). И, следовательно, хорея Гентингтона относится к наследственным заболеваниям, при котором мутация гена состоит в экспансии (многократном увеличении числа копий) тринуклеотидных ЦАГ-повторов.
Слайд 20Установлено, что форма болезни более тяжелая, если ХГ проявляется в
молодом возрасте, наследуется по отцовской линии и нарастает в последующих
поколениях. Ученые пришли к выводу, что число ЦАГ- повторов тесно связано и со сроком появления первых симптомов, и с тяжестью заболевания. В 1992 г. экспансия тринуклеотидных ЦТГ- повторов была обнаружена в гене, который вызывает миотоническую дистрофию. Этот ген, названный ДМ-1, был картирован на 19-й хромосоме.
Слайд 21Длина последовательности ЦТГ- повторов весьма различна. Если в нормальной популяции
она колеблется от 5 до 30, то у больных миотонической
дистрофией, количество повторов может достигать многих сотен.
Болезнь наследуется по аутосомно-доминантному типу, обычно начинается в зрелом возрасте и проявляется прогрессирующей мышечной слабостью, а в некоторых случаях задержкой умственного развития, поражением скелета, сердечнососудистой системы и глаз.
Слайд 22Для миотонической дистрофии характерно возрастание тяжести болезни на протяжении трех
или четырех поколений. Если в первом поколении болезнь возникает в
зрелом возрасте и проявляется лишь развитием катаракты или легким нарушением сократимости мышц, то в последующих поколениях болезнь начинается сразу после рождения ребенка, у которого развивается выраженная мышечная слабость, задержка умственного развития.
Слайд 23В последние годы было показано, что подобный механизм мутаций характерен
и для ряда других наследственных заболеваний нервной системы человека: болезни
Кеннеди, синдрома фрагильной (ломкой) Х-хромосомы и др.