Р озробка молекулярно-біологічних тест-систем для діагностики та

мозаїки
Доповідач:
Студент 4 курсу 1 групи
Обідник Святослав Миколайович

Керівник бакалаврської роботи:
к.с.г.н., доцент

Антіпов І.О.

Кабінет Міністрів України
НAЦІOНAЛЬНИЙ УНІBEPCИТEТ БІOPECУPCІВ І ПРИPOДOКOPИСТУВАННЯ УКРАЇНИ

НAВЧAЛЬНИЙ-НAУКOВИЙ ІНCТИТУТ РОСЛИННИЦТВА, ЕКОЛОГІЇ І БІOТEХНOЛOГІЙ
ФAКУЛЬTEТ БІOТEХНOЛOГІЇ

вірусу, молекулярно-біологічна характеристика ВТМ, біоінформативний аналіз та розробка дизайну праймерів.

не має ознак ураження вірусними інфекціями

симптомами деформації листкової пластини

листкової пластинки

матриці

праймерів, специфічних до нуклеотидних послідовностей вірусу тютюнової мозаїки.
2. Здійснено

скринінг консервативних послідовностей генів, що кодують білок оболонки вірусу за допомогою генетичного банку даних (GenBank). На підставі узагальнених даних щодо відомих нуклеотидних послідовностей, які в подальшому використали як матриці для олігонуклеотидних затравок у процесі синтезу вірусспецифічних фрагментів нуклеїнових кислот. Аналіз здійснювали за допомогою програмного забезпечення «MultAline» (Multiple sequence alignment).
3. Синтезовані олігонуклеотидні праймери на основі аналізу консервативних послідовностей, які відповідали таким вимогам: GC-склад ˜ 40-60%, відсутність неспецифічних вторинних структур (шпильок, димерів), близькі температури відпалу обох праймерів.

мозаїки при використанні власної розробленої молекулярно-генетичної тест-системи та встановлено оптимальні

показники для проведення відповідних досліджень. Оптимальна концентрація іонів магнію у реакційній суміші для проведення полімеразної ланцюгової реакції для діагностики та ідентифікації ВТМ встановлена 1,7 мМ, а оптимальна температура відпалу праймерів на ДНК матриці 60ºС і 62ºС
5. Розроблено діагностичну тест-систему на основі полімеразної
ланцюгової реакції для виявлення вірусу тютюнової мозаїки.
6. Виявлено специфічні фрагменти вірусного генома, чим доведено
працездатність новоствореної діагностичної тест-системи. Запропоновано використовувати метод ПЛР як високочутливий метод діагностики та ідентифікації ВТМ.