Разделы презентаций


БИОИНЖЕНЕРИЯ №1 Каменский Петр Андреевич piotr.kamenski@gmail.com Когда я

Содержание

ЛитератураJ. Sambrook, E.F. Fritsch, T. Maniatis. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press.N.King. RT-PCR protocols. Humana Press.Д.В.Ребриков и др. ПЦР в реальном времени. Изд-во БИНОМ.Д.В.Ребриков и др. NGS: высокопроизводительное секвенирование.

Слайды и текст этой презентации

Слайд 1БИОИНЖЕНЕРИЯ №1
Каменский Петр Андреевич
piotr.kamenski@gmail.com
«Когда я впервые услышал слово «биоинженерия», я

подумал: «Вау, просто улет». Я дичайше угарел по этой теме,

купил себе игрушечную змею и стал носить вместо шарфа».
БИОИНЖЕНЕРИЯ №1Каменский Петр Андреевичpiotr.kamenski@gmail.com«Когда я впервые услышал слово «биоинженерия», я подумал: «Вау, просто улет». Я дичайше угарел

Слайд 2Литература
J. Sambrook, E.F. Fritsch, T. Maniatis. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Cold

Spring Harbor Laboratory Press.

N.King. RT-PCR protocols. Humana Press.

Д.В.Ребриков и др.

ПЦР в реальном времени. Изд-во БИНОМ.

Д.В.Ребриков и др. NGS: высокопроизводительное секвенирование. Изд-во БИНОМ.

http://bitesizebio.com – отличный сайт с объяснением методологии работы с биомакромолекулами

https://biomolecula.ru/ – очень доступные объяснения разнообразных методов молекулярной биологии
ЛитератураJ. Sambrook, E.F. Fritsch, T. Maniatis. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press.N.King. RT-PCR protocols. Humana

Слайд 3Определение из Википедии:

Биоинженерия (включая инженерию биологических систем) — это применение понятий

и методов биологии (и, во вторую очередь, физики, химии, математики и информатики) для решения актуальных

проблем, связанных с науками о живых организмах или их приложениями, с использованием аналитических и синтетических методологий инженерного дела, а также его традиционной чувствительности к стоимости и практичности найденных решений.
Определение из Википедии:Биоинженерия (включая инженерию биологических систем) — это применение понятий и методов биологии (и, во вторую очередь, физики, химии, математики и информатики)

Слайд 4Определение специально для нашего курса, которое придумал я сам:


Биоинженерия –

это практический раздел молекулярной биологии, изучающий способы работы с биологическими

макромолекулами и направленного манипулирования ими.


Обратите внимание на слова «молекулярная биология».

Нет молекулярной биологии – нет биоинженерии.

Определение специально для нашего курса, которое придумал я сам:Биоинженерия – это практический раздел молекулярной биологии, изучающий способы

Слайд 5Биоинженерия
Генная инженерия
(работа с генами в пробирке)
Молекулярное клонирование
Белковая инженерия
Геномная

инженерия
(работа с геномами в живой клетке)
- Редактирование геномов
Изменение биологических макромолекул

и, как следствие свойств живого

Общий методологический арсенал:
электрофорез, рестрикция, лигирование, трансформация, мутагенез, секвенирование, биоинформатика…

БиоинженерияГенная инженерия(работа с генами в пробирке) Молекулярное клонирование Белковая инженерияГеномная инженерия(работа с геномами в живой клетке)- Редактирование

Слайд 6Центральная догма молекулярной биологии
(1958 год, Ф.Крик)

Центральная догма молекулярной биологии(1958 год, Ф.Крик)

Слайд 7На самом деле все оказалось сложнее
В любом случае, отсюда следует,

что основным объектом биоинженерии является...

На самом деле все оказалось сложнееВ любом случае, отсюда следует, что основным объектом биоинженерии является...

Слайд 8Дезоксирибонуклеиновая кислота!

Дезоксирибонуклеиновая кислота!

Слайд 9Принцип комплементарности цепей ДНК

Принцип комплементарности цепей ДНК

Слайд 11А вот как ДНК выглядит в клетке
Ядро
Хромосома

А вот как ДНК выглядит в клеткеЯдроХромосома

Слайд 12Ген (др.-греч. γένος — род) — структурная и функциональная единица наследственности

живых организмов. 
Биоинженерное определение: ген представляет собой участок ДНК, задающий последовательность определённой

РНК.

(А почему не белок?)
Ген (др.-греч. γένος — род) — структурная и функциональная единица наследственности живых организмов. Биоинженерное определение: ген представляет собой участок ДНК,

Слайд 13Первая биоинженерная эпоха: работа с генами
Что научились делать биоинженеры за

время первой эпохи?

«вынимать» ДНК из клетки – выделение и

очистка нуклеиновых кислот,
видеть ДНК глазами – электрофорез,
«вынимать» нужные участки из ДНК - рестрикция,
соединять несколько участков ДНК в один - лигирование, клонирование,
«засовывать» ДНК в клетку - трансформация,
многократно увеличивать количество нужного участка ДНК - ПЦР,
направленно вносить изменения в гены in vitro – мутагенез,
определять нуклеотидную последовательность нужного участка ДНК - секвенирование,
оценивать экспрессию генов, в том числе сравнивая ее у двух или более разных объектов - анализ дифференциальной экспресии,
Первая биоинженерная эпоха: работа с генамиЧто научились делать биоинженеры за время первой эпохи? «вынимать» ДНК из клетки

Слайд 14Выделение и очистка нуклеиновых кислот

Выделение и очистка нуклеиновых кислот

Слайд 15Депротеинизация фенолом/хлороформом
ДНК/РНК гидрофильна*. Фенол гидрофобен. Белки содержат гидрофильные и гидрофобные

химические группы.

Депротеинизация фенолом/хлороформомДНК/РНК гидрофильна*. Фенол гидрофобен. Белки содержат гидрофильные и гидрофобные химические группы.

Слайд 16Почему на предыдущем слайде была звездочка?
РНК более кислая, чем ДНК.

При кислых рН РНК остается отрицательно заряженной и может гидратироваться,

то есть по-прежнему гидрофильна.
ДНК при кислых рН становится нейтральной. Она теряет способность к гидратации и становится гидрофобной.

Метод «кислого фенола» используется для выделения РНК.
Почему на предыдущем слайде была звездочка?РНК более кислая, чем ДНК. При кислых рН РНК остается отрицательно заряженной

Слайд 17Осаждение ДНК/РНК спиртами
(этанол, изопропанол)
Соль (ацетат натрия) добавляется для того, чтобы

ионы Na+ нейтрализовали отрицательные заряды фосфатных групп ДНК. Растворимость ДНК

снижается. Однако вода обладает высокой диэлектрической константой, что не дает ионам Na+ как следует сблизиться с ДНК, и та остается растворимой.

Спирт обладает значительно более низкой диэлектрической константой. Добавление достаточного количества спирта (около 70% минимум) приводит к усилению электростатического взаимодействия ионов Na+ с ДНК, что вызывает критическое снижение растворимости ДНК и ее выпадение в осадок.

Центрифугирование помогает сконцентрировать всю ДНК из образца в небольшом участке пространства.
Осаждение ДНК/РНК спиртами(этанол, изопропанол)Соль (ацетат натрия) добавляется для того, чтобы ионы Na+ нейтрализовали отрицательные заряды фосфатных групп

Слайд 18Электрофорез
Нуклеиновые кислоты заряжены отрицательно. Если поместить их в гель с

соответствующим размером пор и приложить электрическое поле, они начнут перемещаться

сквозь поры, причем скорость их перемещения будет прямо пропорциональна заряду, то есть размеру.
Бромистый этидий интеркалирует между цепочками ДНК, возбуждается УФ-светом и испускает в видимом диапазоне (флуоресценция).
ЭлектрофорезНуклеиновые кислоты заряжены отрицательно. Если поместить их в гель с соответствующим размером пор и приложить электрическое поле,

Слайд 19Красота-то какая!

Красота-то какая!

Слайд 20Электрофоретическому разделению поддаются фрагменты ДНК самого разного размера

Электрофоретическому разделению поддаются фрагменты ДНК самого разного размера

Слайд 21Пульс-электрофорез
При проведении обычного электрофореза все молекулы размером больше 50 т.п.н.

движутся с одинаковой скоростью.
Пульс-электрофорез – движение молекул ДНК в геле

под действием электрического поля с регулярно меняющейся направленностью. В этих условиях молекулы ДНК начинают «запаздывать», причем тем сильнее, чем больше молекула. В результате молекулы размером меньше 10 т.п.н. «убегают» слишком далеко, а более крупные молекулы, вплоть до 1,5 млн п.н., отлично разделяются.
Пульс-электрофорезПри проведении обычного электрофореза все молекулы размером больше 50 т.п.н. движутся с одинаковой скоростью.Пульс-электрофорез – движение молекул

Слайд 22Пульс-электрофорез: объяснение метода, выглядящее наиболее правдоподобно

Пульс-электрофорез: объяснение метода, выглядящее наиболее правдоподобно

Обратная связь

Если не удалось найти и скачать доклад-презентацию, Вы можете заказать его на нашем сайте. Мы постараемся найти нужный Вам материал и отправим по электронной почте. Не стесняйтесь обращаться к нам, если у вас возникли вопросы или пожелания:

Email: Нажмите что бы посмотреть 

Что такое TheSlide.ru?

Это сайт презентации, докладов, проектов в PowerPoint. Здесь удобно  хранить и делиться своими презентациями с другими пользователями.


Для правообладателей

Яндекс.Метрика