Разделы презентаций
- Разное
- Английский язык
- Астрономия
- Алгебра
- Биология
- География
- Геометрия
- Детские презентации
- Информатика
- История
- Литература
- Математика
- Медицина
- Менеджмент
- Музыка
- МХК
- Немецкий язык
- ОБЖ
- Обществознание
- Окружающий мир
- Педагогика
- Русский язык
- Технология
- Физика
- Философия
- Химия
- Шаблоны, картинки для презентаций
- Экология
- Экономика
- Юриспруденция
WiFi – rsmu2 or rsmu5 Password – 1q2w3e4r
Содержание
- 1. WiFi – rsmu2 or rsmu5 Password – 1q2w3e4r
- 2. ОпределениеМолекулярный докинг – это расчет взаимодействия низкомолекулярного
- 3. Типы программ
- 4. Типы программPrieto-Martínez FD, Arciniega M, Medina-Franco JL.
- 5. Типы докинга
- 6. Типы докинга
- 7. Как найти нужную конформацию? Как понять, что она лучшая?
- 8. АлгоритмыСравнивают по так называемой оценивающей функции
- 9. Но как представить белок так, чтобы компьютер
- 10. Как вообще расшифровывают структуру белков?Рентгеновская кристаллографияЯдерно-магнитный резонанс
- 11. Форматы представленияProtein Data Bank (PDB). Формат файла
- 12. Пример pdbqt файлаКак описывается атом в pdb
- 13. Где брать?www.rcsb.org Состояние на 24.09.2020 21:50 UTC+3
- 14. AutoDock
- 15. ОпределениеКластер — группа компьютеров, объединённых высокоскоростными каналами связи, представляющая
- 16. Что хочетсяЧто естьОглянитесь вокруг Техники работают с большим Linux кластером в Хемницком техническом университете, Германия
- 17. HadoopHadoop — проект фонда Apache Software Foundation, свободно распространяемый набор утилит, библиотек и фреймворк для разработки
- 18. MapReduce
- 19. Архитектура кластера Hadoophttps://data-flair.training/blogs/hadoop-architecture/
- 20. Как я организовал процессВходВыход
- 21. Как я организовал процессMapperReducer
- 22. Скачать презентанцию
ОпределениеМолекулярный докинг – это расчет взаимодействия низкомолекулярного вещества с активным центром белка и предсказание энергетически выгодной конформации низкомолекулярного вещества в этом активном центре.
Слайды и текст этой презентации
Слайд 2Определение
Молекулярный докинг – это расчет взаимодействия низкомолекулярного вещества с активным
Слайд 4Типы программ
Prieto-Martínez FD, Arciniega M, Medina-Franco JL. Molecular docking: current
advances and challenges. TIP Rev Esp Cienc Quim Biol. 2018;21(Suppl: 1):65-87.
Слайд 9Но как представить белок так, чтобы компьютер понял, что это
белок? Да и ещё нам что-то посчитал?
Это всё замечательно
Слайд 10Как вообще расшифровывают структуру белков?
Рентгеновская кристаллография
Ядерно-магнитный резонанс
Слайд 11Форматы представления
Protein Data Bank (PDB). Формат файла представляет собой формат
текстового файла описание трехмерных структур молекул , проведенные в Protein
Data Bank . PDB формат соответственно предусматривает для описания и аннотации белков и нуклеиновых кислот структур , включая атомные координаты, наблюдаемые боковую цепь ротамеры , вторичные структуры задания, а также атомную связь.
Слайд 15Определение
Кластер — группа компьютеров, объединённых высокоскоростными каналами связи, представляющая с точки зрения
пользователя единый аппаратный ресурс.
Кластер - слабо связанная совокупность нескольких вычислительных систем,
работающих совместно для выполнения общих приложений, и представляющихся пользователю единой системой.Кластер — это разновидность параллельной или распределённой системы, которая: состоит из нескольких связанных между собой компьютеров; используется как единый, унифицированный компьютерный ресурс».
Слайд 16Что хочется
Что есть
Оглянитесь вокруг
Техники работают с большим Linux кластером в Хемницком техническом
университете, Германия
Слайд 17Hadoop
Hadoop — проект фонда Apache Software Foundation, свободно распространяемый набор утилит, библиотек и фреймворк для разработки и выполнения распределённых
программ, работающих на кластерах из сотен и тысяч узлов. Разработан на Java в рамках
вычислительной парадигмы MapReduce, согласно которой приложение разделяется на большое количество одинаковых элементарных заданий, выполнимых на узлах кластера и естественным образом сводимых в конечный результат.
