Разделы презентаций
- Разное
- Английский язык
- Астрономия
- Алгебра
- Биология
- География
- Геометрия
- Детские презентации
- Информатика
- История
- Литература
- Математика
- Медицина
- Менеджмент
- Музыка
- МХК
- Немецкий язык
- ОБЖ
- Обществознание
- Окружающий мир
- Педагогика
- Русский язык
- Технология
- Физика
- Философия
- Химия
- Шаблоны, картинки для презентаций
- Экология
- Экономика
- Юриспруденция
Методы типирования
Содержание
- 1. Методы типирования
- 2. Саузерн-блоттинг
- 3. Саузерн-блоттинг
- 4. Саузерн-блоттинг
- 5. Слайд 5
- 6. Слайд 6
- 7. Слайд 7
- 8. Слайд 8
- 9. Слайд 9
- 10. Саузерн-блоттинг
- 11. Саузерн-блоттинг
- 12. Саузерн-блоттинг
- 13. Макрорестрикционный анализ,Электрофорез в пульсирующем поле (PFGE)
- 14. Макрорестрикционный анализ,Электрофорез в пульсирующем поле (PFGE)
- 15. Макрорестрикционный анализ,Электрофорез в пульсирующем полеAssignment of Staphylococcus
- 16. RFLP (ПДРФ – полиморфизм длин рестрикционных фрагментов)
- 17. RFLP (ПДРФ – полиморфизм длин рестрикционных фрагментов)
- 18. RFLP (ПДРФ – полиморфизм длин рестрикционных фрагментов)
- 19. RFLP (ПДРФ – полиморфизм длин рестрикционных фрагментов)
- 20. Подбор праймеров, специфичных к участкам гена dnaAПримечание:В
- 21. Типирование методом локус-специфичной ПЦР-ПДРФСемейство XanthomonadaceaeПрофили фрагментов рестрикции
- 22. Семейство XanthomonadaceaeПрофили фрагментов рестрикции амплификата гена dnaA
- 23. Слайд 23
- 24. AFLP – amplified fragment length polymorphism
- 25. AFLP – amplified fragment length polymorphism
- 26. AFLP – amplified fragment length polymorphism
- 27. RAPD – random amplified polymorphic DNA
- 28. RAPD – random amplified polymorphic DNA
- 29. RAPD – random amplified polymorphic DNARAPD profiles of Bacillus isolates
- 30. REP-PCR
- 31. Слайд 31
- 32. REP-PCR
- 33. REP-PCR
- 34. Типирование методом амплификации локусов, содержащих CRISPR-элементы(CRISPR — Clustered
- 35. VNTR (MLVA – multiple-locus variable tandem repeat analysis)
- 36. Alignment of Lpms37 repeats and flanking sequences
- 37. Слайд 37
- 38. Методы генотипирования микроорганизмов
- 39. PLFA: Phospholipid Fatty Acid
- 40. DGGE: Denaturing Gradient Gel Electrophoresis
- 41. T-RFLP: Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism
- 42. Скачать презентанцию
Саузерн-блоттинг
Слайды и текст этой презентации
Слайд 15Макрорестрикционный анализ,
Электрофорез в пульсирующем поле
Assignment of Staphylococcus Isolates to Groups
by spa Typing, SmaI Macrorestriction Analysis, and Multilocus Sequence Typing
Clin. Microbiol. July 2006 vol. 44 no. 7 2533-2540 
Слайд 20Подбор праймеров, специфичных к участкам гена dnaA
Примечание:
В скобках указан номер
нуклеотида в последовательности гена, соответствующий началу и концу представленного участка
Праймеры:
Xnf 5′-ATGGA(T/A)(G/T)C(T/C)TGG(C/T)CCCG-3′, Тm = 56 ºС
Xnr 5′-CGGCA(G/A)GC(A/G)TG(C/T)A(G/A)CAC-3′, Тm = 58 ºС
Семейство Xanthomonadaceae
Типирование методом локус-специфичной ПЦР-ПДРФ
Слайд 21Типирование методом локус-специфичной ПЦР-ПДРФ
Семейство Xanthomonadaceae
Профили фрагментов рестрикции амплификата гена dnaA
С использованием рестриктазы Aat2
С использованием рестриктазы Bgl1
Дорожки 1 –
16 – ПДРФ профили фрагмента гена dnaA микроорганизмов сем. Xanthomonadaceae1 – Pseudoxanthomonas suwonensis 11-1; 2 – Stenotrophomonas maltophilia K279a; 3 – Stenotrophomonas maltophilia R551-3; 4 – Xanthomonas albilineans GPE PC73; 5 – Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306;
6 – Xanthomonas campestris pv. campestris str. 8004; 7 – Xanthomonas campestris pv. campestris str. ATCC 33913;
8 – Xanthomonas campestris pv. campestris str. B100; 9 – Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10;
10 – Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC10331; 11 – Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018;
12 – Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A; 13 – Xylella fastidiosa 9a5c; 14 – Xylella fastidiosa M12;
15 – Xylella fastidiosa M23; 16 – Xylella fastidiosa Temecula1; М – Маркер молекулярной массы
Слайд 22Семейство Xanthomonadaceae
Профили фрагментов рестрикции амплификата гена dnaA
С использованием рестриктазы
Sac1
Дорожки 1 – 16 – ПДРФ профили фрагмента гена dnaA
микроорганизмов сем. Xanthomonadaceae1 – Pseudoxanthomonas suwonensis 11-1; 2 – Stenotrophomonas maltophilia K279a; 3 – Stenotrophomonas maltophilia R551-3; 4 – Xanthomonas albilineans GPE PC73; 5 – Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306;
6 – Xanthomonas campestris pv. campestris str. 8004; 7 – Xanthomonas campestris pv. campestris str. ATCC 33913;
8 – Xanthomonas campestris pv. campestris str. B100; 9 – Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10;
10 – Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC10331; 11 – Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018;
12 – Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A; 13 – Xylella fastidiosa 9a5c; 14 – Xylella fastidiosa M12;
15 – Xylella fastidiosa M23; 16 – Xylella fastidiosa Temecula1; М – Маркер молекулярной массы
Типирование методом локус-специфичной ПЦР-ПДРФ
Слайд 34Типирование методом амплификации локусов, содержащих CRISPR-элементы
(CRISPR — Clustered Regularly Interspaced Short
Palindromic Repeats)
Структура CRISPR-повторов в геноме Xanthomonas anoxypoda
Слайд 36Alignment of Lpms37 repeats and flanking sequences in the three
reference strains and three unrelated isolates using ClustalW.
Christine Pourcel
et al. J. Clin. Microbiol. 2007;45:1190-1199
