Разделы презентаций


Тема бакалаврської роботи: “Моніторинг розповсюдження житньо-пшеничних

Содержание

Пшениця відіграє важливу роль у виробництві хліба та хлібобулочних виробів, відповідно, хлібопекарська якість борошна є важливим показником для цієї культури. Зусилля сучасної селекції направлені на створення високопродуктивних та

Слайды и текст этой презентации

Слайд 1Тема бакалаврської роботи:
“Моніторинг розповсюдження
житньо-пшеничних транслокацій на території України”
Виконала:

Скриник М.М.
Робота виконувалась на базі
Інституту клітинної біології та генетичної інженерії

НАН України
Науковий керівник: к.б.н. Банникова М.О.

Національний технічний університет України
“Київський політехнічний інститут” Факультет біотехнології і біотехніки
Кафедра біоінформатики

Тема бакалаврської роботи:“Моніторинг розповсюдження житньо-пшеничних транслокацій на території України” Виконала: Скриник М.М.Робота виконувалась на базіІнституту клітинної біології

Слайд 2 Пшениця відіграє важливу роль у виробництві хліба та хлібобулочних виробів,

відповідно, хлібопекарська якість борошна є важливим показником для цієї культури.

Зусилля сучасної селекції направлені на створення високопродуктивних та екстрасильних сортів пшениці. Для поліпшення ознак врожайності та продуктивності було створено ряд сортів пшениці, які несуть інтрогресивний матеріал від співродичів, зокрема жита. Широкого розповсюдження набули сорти з житньо-пшеничними транслокаціями 1BL.1RS та 1AL.1RS. Враховуючи широке поширення інтрогресивного матеріалу, моніторинг житньо-пшеничних транслокацій дасть можливість оцінити хлібопекарську якість борошна українських виробників за допомогою молекулярно-генетичних методів.

Актуальність роботи

Пшениця відіграє важливу роль у виробництві хліба та хлібобулочних виробів, відповідно, хлібопекарська якість борошна є важливим

Слайд 3Мета роботи –

дослідити наявність житньо-пшеничних транслокацій (1AL.1RS та 1BL.1RS)

в борошні, виробленому з пшениці вирощеної на території України, яке

реалізується в торгівельній мережі м. Києва.

Завдання:

1. Зібрати зразки борошна у торгівельній мережі.
2. Виділити загальну ДНК з зібраних зразків
3. Виміряти концентрацію та чистоту препаратів ДНК
спектрофотометрично та електрофоретично.
4. Провести мультиплексну полімеразну ланцюгову реакцію (ПЛР)
для виявлення транслокацій 1AL.1RS та 1BL.1RS.
5. Розділити продукти ампліфікації методом електрофорезу в
агарозному гелі.
6. Підрахувати частоти виявлення транслокацій.
7. Провести атестацію робочого місця.

Мета роботи – дослідити наявність житньо-пшеничних транслокацій (1AL.1RS та 1BL.1RS) в борошні, виробленому з пшениці вирощеної на

Слайд 4Наукова новизна

Вперше досліджено наявність житньо-пшеничних транслокацій в пшеничному борошні, виробленому

з пшениці вирощеної на території України, яке реалізується в торгівельній

мережі м. Києва.

Практична цінність
Дослідження пшеничного борошна на наявність
чужерідного генетичного матеріалу дасть змогу
адекватно оцінити склад пшеничної сировини та
сформулювати рекомендації щодо забезпечення
високої якості хлібопекарського борошна.

Наукова новизнаВперше досліджено наявність житньо-пшеничних транслокацій в пшеничному борошні, виробленому з пшениці вирощеної на території України, яке

Слайд 5 Пшениця – провідна зернова культура в багатьох регіонах світу та

один з основних продуктів харчування.

Пшеничне борошно йде на випічку хліба

та виробництво інших харчових продуктів. Відходи борошномельного виробництва служать кормом для тварин та є сировиною в харчовій промисловості.

Посіви пшениці є найбільшими з усіх сільськогосподарських культур :
Індія – 31,5 млн.га
Китай – 24,3 млн.га Європа – 26,1 млн.га
Канада – 10,4 млн. га
Україна – 6,7 млн. га

Sharma, 2012;
FAOSTAT, 2012

Пшениця

Пшениця – провідна зернова культура в багатьох регіонах світу та один з основних продуктів харчування.	Пшеничне борошно йде

Слайд 6Бадаева, 2013.
Геном А походить від стародавніх однозернянок
Геном В походить від

Aegelops speltoides
Геном D походить від Aegelops squarrosa
Геном м’якої пшениці


Геном м’якої пшениці (T. aestivum) складний.
Він складається з трьох геномів: A, B, D

Бадаева, 2013.Геном А походить від стародавніх однозернянокГеном В походить від Aegelops speltoides Геном D походить від Aegelops

Слайд 7Переваги
Фрагмент житньої хромосоми містить гени стійкості до патогенів:
Lr26 -

до бурої іржі,
Sr31 - до стеблової іржі,
Yr9 - до

жовтої іржі,
Pm8, Pm17 – до борошнистої роси,
Gb2, Gb6 - до попелиці
Schizaphis graminum та
кліща Aceria tosichella.
Недоліки
Локус Sec-1 жита кодує синтез секалінів, і тому знижує хлібопекарську якість борошна.

ЖИТНЬО-ПШЕНИЧНІ ТРАНСЛОКАЦІЇ
1BL.1RS та 1AL.1RS

Втрачаються пшеничні локуси
Gli-Al (ω і γ-гліадин) і Glu-B3, розташовані в S плечі хромосоми 1A,
які контролюють синтез білків клейковини.

Переваги Фрагмент житньої хромосоми містить гени стійкості до патогенів:Lr26 - до бурої іржі, Sr31 - до стеблової

Слайд 8Lukaszewski A, 2001
Структура модифікованої житньо–пшеничної транслокації 1RSm.1BL

(не містить локусу

Sec-1)

Lukaszewski A, 2001Структура модифікованої житньо–пшеничної транслокації 1RSm.1BL (не містить локусу Sec-1)

Слайд 9МОЛЕКУЛЯРНІ МАРКЕРИ
Молекулярним маркером називають нуклеотидну послідовність відомої локалізації, завдяки якій

можна виявляти інші генетичні послідовності (гени).
Маркер має відповідати ряду вимог:


доступність фенотипових проявів алельних варіантів для ідентифікації у різних особин;
відмінність алелів одного локусу від алелів інших локусів;
поліморфність;
рівномірність локалізації в геномі;
простота виявлення, відтворюваність, дешевизна;
можливість автоматизації виявлення;
кодомінантність. Nevo, 1989

В даній роботі для визначення житньо-пшеничних транслокацій використовували SSR-маркер –
SCM9.

МОЛЕКУЛЯРНІ МАРКЕРИМолекулярним маркером називають нуклеотидну послідовність відомої локалізації, завдяки якій можна виявляти інші генетичні послідовності (гени).Маркер має

Слайд 10МЕТОДИ ДОСЛІДЖЕНЬ

CTAB метод виділення ДНК з сухого матеріалу;
спектрофотометричне вимірювання очищеної

ДНК;
електрофорез загальної ДНК та продуктів ампліфікації у агарозному гелі;
мультиплексна полімеразна

ланцюгова реакція (ПЛР) на визначення житньо-пшеничної транслокації.

МЕТОДИ ДОСЛІДЖЕНЬCTAB метод виділення ДНК з сухого матеріалу;спектрофотометричне вимірювання очищеної ДНК;електрофорез загальної ДНК та продуктів ампліфікації у

Слайд 11ЗБІР ЗРАЗКІВ
Зібрано 22 зразки борошна в торгівельній мережі
м. Києва

ЗБІР ЗРАЗКІВЗібрано 22 зразки борошна в торгівельній мережі м. Києва

Слайд 12Спектрофотометричне визначення
концентрації ДНК
A230 – визначення фенольних та ароматичних

сполук, вуглеводів;
A260 – визначення концентрації ДНК;
A280 – визначення білкових

речовин;
A340 – присутність клітинного гомогенату, або забруднення самої кювети;
A260/A280 – забруднення білками;
A260/A230 – забруднення фенольними та ароматичними сполуками, вуглеводами

У всіх проаналізованих зразках
концентрація ДНК була достатньою для проведення
ампліфікації,
рівень чистоти ДНК задовольняв вимогам ПЛР.

Спектрофотометричне визначення концентрації ДНК A230 – визначення фенольних та ароматичних сполук, вуглеводів;A260 – визначення концентрації ДНК; A280

Слайд 13Доріжки 20.1 - 23.3 – досліджувані зразки;
М – маркер

молекулярної маси λ/HindIII
Електрофореграма виділеної загальної ДНК

Доріжки 20.1 - 23.3 – досліджувані зразки; М – маркер молекулярної маси λ/HindIII Електрофореграма виділеної загальної ДНК

Слайд 14ПРОВЕДЕННЯ МУЛЬТИПЛЕКСНОЇ ПЛР
Характеристики використаних у роботі праймерів
Амплікон 226

п.н. свідчить про наявність 1АL.1RS транслокації
Амплікон 206 п.н. свідчить про

наявність 1BL.1RS транслокації.
ПРОВЕДЕННЯ МУЛЬТИПЛЕКСНОЇ ПЛР Характеристики використаних у роботі праймерів Амплікон 226 п.н. свідчить про наявність 1АL.1RS транслокаціїАмплікон 206

Слайд 15Програма ампліфікації для ефективного
проходження ПЛР

T=94 °C, 00:30 хв

– плавлення загальної ДНК;
T=94 °C, 04:00 хв – плавлення загальної

ДНК;
T=60 °С, 00:30 хв – стадія відпалу;
T=72 °С, 01:00 хв – стадія елонгаці;
GOTO 2 REP 34 – 34 цикли реакції ;
Т=72 °C, 05:00 хв – стадія фінальної елонгації;
Т=22 °C, 01:00 – охолодження суміші;
end.
Програма ампліфікації для ефективного проходження ПЛР T=94 °C, 00:30 хв – плавлення загальної ДНК;T=94 °C, 04:00 хв

Слайд 16Електрофореграма продуктів ПЛР
1.1 – 4.3 – досліджувані зразки;
С1+

– позитивний контроль, сорт Новокиївська (1BL.1RS) – амплікон 206 п.н.
С2+

– позитивний контроль, сорт Смуглянка (1AL.1RS) – амплікон 226 п.н.
С3+ – позитивний контроль, сорт Ятрань (без транслокацій) - амплікон 934 п.н.;
C- – негативний контроль – ТЕ буфер без додавання ДНК;
М – маркер молекулярної маси GeneRulerTM DNA Ladder Mix
Електрофореграма продуктів ПЛР 1.1 – 4.3 – досліджувані зразки; С1+ – позитивний контроль, сорт Новокиївська (1BL.1RS) –

Слайд 17Частоти зустрічальності транслокацій

Частоти зустрічальності транслокацій

Слайд 18Висновки
1. В торгівельній мережі м. Києва зібрано 22 зразки

борошна.
2. Виділено загальну ДНК з усіх 22 зразків у

3-х повторностях за допомогою СТАВ
методу.
3. Проведено спектрофотометричну та електрофоретичну оцінку концентрації і чистоти
препаратів ДНК. У всіх проаналізованих зразках концентрація ДНК була достатньою
для проведення ампліфікації, рівень чистоти ДНК задовольняв вимогам ПЛР.
4. Проведено мультиплексну ПЛР з 22 зразками (у 3-х повторностях) на локус SCM9 та
референтний ген пшениці TaTM20 з розділенням продуктів ампліфікації методом
електрофорезу в агарозному гелі.
5. За результатами ПЛР виявлено:
з 22 проаналізованих зразків борошна
7 зразків містили обидві житньо-пшеничні транслокації (32%),
в одному не виявлено транслокацій (4,5%) («Макфа»),
2 зразки містили лише 1АL.1RS (9%),
3 – лише 1BL.1RS (14%).
Домішки 1АL.1RS транслокації містились в 2-х зразках (9%),
домішки 1BL.1RS – в 1 (4,5%),
наявність домішок обох транслокацій в однаковій мірі була відмічена у 2-х
зразках (9%).
У 3-х зразках мітилась 1АL.1RS транслокація з домішками 1BL.1RS (13,5%).
В 1 зразку було виявлено 1BL.1RS транслокацію з домішками 1АL.1RS (4,5%).

18

Висновки 1. В торгівельній мережі м. Києва зібрано 22 зразки борошна. 2. Виділено загальну ДНК з усіх

Слайд 19Висловлюється подяка
Степаненку А.І.
Моргуну Б.В.

Висловлюється подякаСтепаненку А.І.Моргуну Б.В.

Слайд 20Дякую за увагу!

Дякую за увагу!

Обратная связь

Если не удалось найти и скачать доклад-презентацию, Вы можете заказать его на нашем сайте. Мы постараемся найти нужный Вам материал и отправим по электронной почте. Не стесняйтесь обращаться к нам, если у вас возникли вопросы или пожелания:

Email: Нажмите что бы посмотреть 

Что такое TheSlide.ru?

Это сайт презентации, докладов, проектов в PowerPoint. Здесь удобно  хранить и делиться своими презентациями с другими пользователями.


Для правообладателей

Яндекс.Метрика