Слайд 2Таксон — группа организмов, обладающих заданной степенью однородности.
Для характеристики микроорганизмов
используют разнообразные признаки: морфологические, цитологические, культуральные, физиологические, биохимические, иммунологические и
др. Если объем информации для характеристики объектов по существу беспределен, то для целей идентификации может быть использован ограниченный объем информации, достаточный для распределения организмов по таксономическим группам.
Слайд 3Специальный раздел таксономии — номенклатура — имеет дело с правилами
присвоения наименований описанным объектам. В систематике бактерий для наименования объекта
используют биномиальную номенклатуру К. Линнея (К. Linne, 1707—1778), согласно которой биологическому виду присваивают название, состоящее из двух слов: первое определяет принадлежность организма к определенному роду, второе — виду. Названия бактериям присваивают в соответствии с правилами Международного кодекса номенклатуры бактерий.
Слайд 4Основной таксономической категорией является вид. Отнесение прокариотных организмов к одному
или разным видам осуществляется в большой степени эмпирическим путем на
основе анализа многих признаков, при этом генетическая информация, содержащаяся в нехромосомных генетических элементах, для определения видовой принадлежности не используется.
В микробиологии употребляются такие термины, как "штамм" и "клон". Под штаммом понимают бактериальные культуры одного вида, выделенные, например, из разных мест обитания. Различия между штаммами не выходят за пределы вида. Клон — еще более узкое понятие, это культура, выделенная из одной клетки.
Слайд 5Накопление огромного фактического материала потребовало классифицировать изучаемые в микробиологии объекты
для удобства работы с ними. В современной классификации микроорганизмов принята
следующая иерархия таксонов: Домен, Царство (Regnum),Отдел (Phylum),Класс (Classis),Порядок (Ordo),Семейство (Familia),Род (Genus),Вид (Species). Микробиологи пользуются биномиальной системой обозначения объекта (номенклатуры), включающее родовое и видовое названия, например Escherichia coli.
«Жизнь» разделяется на домены:
Архебактерии - особая экологическая группа бактерий, обычно обитающих в весьма экзотичных условиях (экстремальные термофилы, экстремальные галлофилы и тд.).
Домен эубактерии включает большинство современных «истинных» бактерий.
Эукариоты - одно- и многоклеточные ядерные организмы, относящиеся к царствам животных (Animalia), растений (Plantae) и грибов (Fungi).
Слайд 7 Группы внутри четырех основных категорий бактерий (с. 21)
Категория 1
1.
Спирохеты (с. 30)
2. Аэробные/микроаэрофильные, подвижные, спиральные/изогнутые грамотрицательные бактерии (с. 42)
3.
Неодвижные (или, редко, подвижные) грамотрицательные изогнутые бактерии (с. 67)
4. Грамотрицательные, аэробные/микроаэрофильные палочки и кокки (с. 73)
5. Факультативно анаэробные грамотрицательные палочки (с. 180)
6. Грамотрицательные, анаэробные, прямые, изогнутые и спиральные бактерии (с. 295)
7. Бактерии, осуществляющие диссимиляционное восстановление сульфата или серы (с. 337)
8. Анаэробные грамотрицательные кокки (с. 348)
9. Риккетсии и хламидии (с. 352)
10. Аноксигенные фототрофные бактерии (с. 353)
11. Оксигенные фототрофные бактерии (с. 375)
12. Аэробные хемолитотрофные бактерии и родственные организмы (с. 437)
13. Почкующиеся и/или обладающие выростами бактерии (с. 467)
14. Бактерии, обладающие чехлом (с. 487)
15. Нефотосинтезирующие, не образующие плодовых тел скользящие бактерии (с. 493)
16. Скользящие бактерии, образующие плодовые тела: миксобактерии (с. 523)
Категория 2
17. Грамположительные кокки (с. 536)
18. Грамположительные палочки и кокки, образующие эндоспоры (с. 567)
19. Грамположительные неспорообразующие палочки правильной формы (с. 573)
20. Грамположительные неспорообразующие палочки неправильной формы (с. 579)
21. Микобактерии (с. 606)
22-29. Актиномицеты (с. 613)
22. Нокардиоформные актиномицеты (с. 630)
23. Роды с многогнездными спорангиями (с. 655)
24. Актинопланы (с. 658)
25. Стрептомицеты и близкие роды (с. 672)
26. Мадуромицеты (с. 683)
27. Thermomonospora и близкие роды (с. 699)
28. Термоактиномицеты (с. 704)
29. Другие роды (с. 706)
Слайд 8
Категория 3
30. Микоплазмы (или молликуты): бактерии без клеточной стенки
Категория
4
31. Метаногены
32. Сульфатредуцирующие археи
33. Экстремально галофильные аэробные архебактерии
(галобактерии)
34. Архебактерии, лишенные клеточной стенки
35. Экстремальные термофилы и гипертермофилы, метаболизирующие S0
Хотя клетки архебактерий структурно относятся к прокариотному типу, они построены из макромолекул (липидов, полисахаридов, белков), многие из которых являются уникальными и не синтезируются ни эукариотами, ни эубактериями. Архебактерии осуществляют ряд биохимических процессов, не свойственных остальным живым организмам.
Представленная в Определителе бактерий Берги система классификации является строго идентификационной и не решает задачи выявления эволюционных связей между прокариотами.