Субтиповая характеристика ВИЧ-инфекции на Юге России

Ростовский научно-исследовательский институт микробиологии и паразитологии Роспотребнадзора.

Южный Окружной Центр по

борьбе со СПИДом,
г. Ростов-на-Дону

и Северо-Кавказского федеральных округов России собрано 377 клинических образцов крови

от лиц с диагностированной ВИЧ-инфекцией.

Для всех пациентов проведен сбор и анализ эпидемической информации и данных клинико-диагностических исследований.

2. Из 377 исследованных вирусов 321(85,1%) вариантов относились к субтипу

A, 23 – к субтипу B (6,1%), 19 – к субтипу G (5%) и 1 – к субтипу C (0,3%) ВИЧ-1.
Из оставшихся образцов были выделены циркулирующие рекомбинантные формы ВИЧ-1: в четырёх случаях - CRF02_AG (1,1%), в пяти - CRF63_02A1 (1,3%) и по одному случаю (0,3%) инфицирования субтипами CRF03_AB, CRF28_BF, CRF01_AE и рекомбинантом между CRF02_AG и субтипом B.

в 2015-2016гг. (377 образцов)

в 2013-2016гг.

по распространению ВИЧ-инфекции на территории Юга России схожа с таковой

для большинства регионов России. На фоне преобладающей распространенности классического для России генетического варианта ВИЧ-1 субтипа А (А1) 5-8% циркулирующей популяции вирусов относится к субтипу G и 6-7% к субтипу В.

выявляться не характерные ранее для этих регионов рекомбинантные формы ВИЧ-1.

В Ростовской области зарегистрированы случаи инфицирования при гетеросексуальных контактах рекомбинантной формой CRF_01_AE и CRF_63_02A1, в Краснодарском крае - CRF_63_02A1 и CRF_28_BF, на территории Кабардино-Балкарской республики в 2015-2016 годах были выявлены рекомбинант CRF_02_AG и субтипа B, CRF_03_AB, CRF_63_02A1

4).
В 3-х случаях вирусы выделены от инфицированных гомосексуальным путем

лиц из Ростова-на-Дону, в 6 – у МСМ из Краснодарского края, в 3-х у МСМ из Кабардино-Балкарии. Все вышеперечисленные варианты ВИЧ1 субтипа В располагаются на разных ветвях филогенетического дерева и не образуют общие кластеры.
Четыре вариантов ВИЧ-1 субтипа В были выявлены у женщин, с предположительно гетеросексуальным путём передачи и они также располагаются на отдельных ветвях и не образуют кластеры с друг с другом. Ещё два варианта вируса были выделены от ПИН, и последний - от инфицированного при рождении ребёнка.

инфицирования

СКФО наблюдается циркуляция генетически отдаленных вариантов субтипа В ВИЧ-1. Это

можно объяснить независимыми отдельными заносами субтипа В ВИЧ-1 на исследованные территории и ограниченной циркуляцией вирусов этого генетического субтипа, вероятно, связанной с группой риска МСМ.
Кроме того, мы видим эволюцию путей передачи субтипа B.
Впервые на Юге России мы наблюдаем передачу этого субтипа гетеросексуальным и инъекционными путями

6). 6 штаммов, выделенных на территории Юга России, собираются в

один кластер.
Референсной последовательностью с максимальной степенью идентичности для этого варианта является штамм выделенный в республике Калмыкия и задепонированный в международной базе «Genbank». Классические же штаммы, распространившиеся в Камеруне и Сенегале в середине 90-х годов прошлого столетия кластеризуются вместе и не связаны со штаммами из ЮФО и СКФО.

эпидемическую связь с Сибирью, где с 2008 года регистрируется стремительное

распространение этого генетического варианта ВИЧ-1. Все варианты вируса, выделенные на территории ЮФО и СКФО, кластеризуются вместе со штаммами, выделеными от детей, прибывших в Ростовскую область из Новосибирской и Омской областей, а также от пацентов из Сибирского федерального округа, чьи штаммы также были депонированы в базе данных «GENBANK».

субтипов CRF63_02A1 CRF02_AG.

Краснодарском крае, был выявлен новый случай инфицирования ВИЧ-1 субтипа С,

который предпочтительно доминирует в странах Африки, в Индии и в Китае. Есть данные о том, что субтип С начинает появляться на Дальнем Востоке. Был проведён анализ данного штамма среди близкородственных вариантов ВИЧ-1, депонированных в международной базе данных (GenBank), также был проведён филогенетический анализ.

максимальным генетическим сходством с вариантами ВИЧ-1, распространившимися с 1998 по

2015 гг. в Бразилии (рис. 7,8). Заражение скорее всего произошло через незащищенные гетеросексуальные контакты. При исследовании этого штамма ВИЧ-1 на наличие мутаций устойчивости к АРВТ, мутаций к ИП, НИОТ и ННИОТ обнаружено не было

более частое обнаружение новых ранее не встречавшихся (или редко встречавшихся)

генетических вариантов вируса (субтипа C, рекомбинантных форм ВИЧ-1 (CRF02_AG, CRF63_02A1 CRF03_AB, CRF28_BF, CRF01_AE и CRF03_AB), которые получили преимущественное распространение в некоторых регионах России (Калининград, Сибирь), в странах Юго-Восточной и Средней Азии (Таджикистан, Туркменистан и др.) и Африки.

эпидемиологических сетей и повышении опасности заноса и дальнейшего распространения на

территории ЮФО и СКФО новых форм ВИЧ.
В свете всего вышесказанного, очень важно и необходимо продолжать мониторинг циркуляции субтипов ВИЧ-1 для выявления особенностей развития эпидемии на Юге России.